副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是引起人類食源性疾病和水產(chǎn)養(yǎng)殖中南美白對蝦急性肝胰腺壞死病(AHPND,又被稱為早期死亡綜合征)的條件性致病菌,是食源性腸胃炎最主要的病原之一,為人類和水產(chǎn)養(yǎng)殖帶來了巨大的災(zāi)難和損失。本研究首先建立了基于PCR快速檢測副溶血弧菌的方法。由于弧菌屬尤其是哈維氏弧菌群的基因組具有很高的相似度,16S rDNA無法將之區(qū)分,因此對于副溶血弧菌檢測的核心就是找到有效的靶標(biāo)。而對于目前報道的副溶血弧菌鑒定和篩選的靶標(biāo)基因一直沒有一個有效的特異性評估,因此存在特異性不高的問題。為了避免假陽性,本研究通過生物信息分析找到了3個分布在兩個染色體上的靶序列,對比之前報道的特異性基因,這3個靶序列同時具備種間特異性和種內(nèi)保守性的特點。為了探究水產(chǎn)養(yǎng)殖中副溶血弧菌的毒力、耐藥和遺傳多樣性等特點,本研究分別在天津(2016年6月、9月和2017年4月)、南通(2016年9月)、杭州(2016年9月)、湛江(2016年11月)和海南地區(qū)(2016年8月)進(jìn)行了樣品的采集,然后利用TCBS和LB培養(yǎng)基共分離純化了1045株細(xì)菌�；诒狙芯拷⒌臋z測方法,... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

副溶血弧菌的結(jié)構(gòu)和毒力基因(Wangetal.2015a)

可以通過轉(zhuǎn)化、接合或者轉(zhuǎn)導(dǎo)在細(xì)菌間轉(zhuǎn)移。1.5.2 插入序列插入序列（Insertion Sequence，IS）的基本結(jié)構(gòu)如圖1-2，在兩端有正向重復(fù)序列（directrepeats，DR）和反向重復(fù)序列(inverted repeats, IR)，中間通常是一個或者兩個編碼轉(zhuǎn)座酶的基因。通常 IS 是不攜帶毒力和耐藥基因的，但是兩種特殊的類型的 IS，ISEcp1 和ISCR 以及形成的復(fù)合型轉(zhuǎn)座子是能夠捕獲和轉(zhuǎn)移毒力和耐藥基因的(Partridge 2011)。近幾年，隨著進(jìn)化基因組學(xué)的研究，發(fā)現(xiàn) IS 對于基因組的可塑性和多樣性具有重要功能。以前的研究表明，IS 就像基因組寄生蟲一樣(Charlesworth 1994)可以通過塑造細(xì)菌基因組來促進(jìn)遺傳多樣性的產(chǎn)生

圖 1-3 基因島的基本結(jié)構(gòu)示意圖 (Dobrindt et al. 2004)Figure 1-3 General characteristics of genomic islands (Dobrindt et al. 2004)


本文編號：2945136