華南水域眾多,漁業(yè)生物種質(zhì)資源豐富,是我國重要的種質(zhì)資源庫。由于形態(tài)學(xué)鑒定的缺陷,加之傳統(tǒng)分類學(xué)家日趨減少,漁業(yè)生物的鑒定與分類發(fā)展遇到瓶頸,亟待一種快速、廉價(jià)和規(guī)范的物種鑒定方法來解決。以線粒體DNA為載體的物種鑒定技術(shù),即DNA條形碼技術(shù),可以彌補(bǔ)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定缺陷,即使物種失去形態(tài)學(xué)特征,也能通過DNA條形碼技術(shù)予以快速且準(zhǔn)確鑒定。本論文利用DNA條形碼技術(shù),對(duì)部分華南漁業(yè)動(dòng)物進(jìn)行了鑒定分類研究。采集了華南水域漁業(yè)動(dòng)物81個(gè)物種,共1653個(gè)樣本,研究獲得DNA條形碼數(shù)（COI基因）837個(gè),整理形成華南漁業(yè)動(dòng)物DNA條形碼信息庫。測(cè)定了線紋尖塘鱧線粒體DNA全序列。通過與已有云斑尖塘鱧的線粒體DNA全序列比對(duì),針對(duì)兩者在線粒體COI基因的差異位點(diǎn),設(shè)計(jì)并獲得種特異性引物,建立了這兩個(gè)物種簡便的鑒別方法,解決了云斑尖塘鱧與線紋尖塘鱧在幼苗階段不易鑒別的難題�；贒NA條形碼的目標(biāo)基因（COI基因）,對(duì)采集到的鯉科、塘鱧科、鲇形目、十足目和龜鱉目的物種進(jìn)行遺傳距離與系統(tǒng)進(jìn)化分析,研究結(jié)果充實(shí)了傳統(tǒng)分類學(xué)的成果,也為其中存在的物種歸屬問題提供了一些佐證數(shù)據(jù)。研究內(nèi)容如下:1.線紋尖塘... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

基于魚類物種線粒體全基因組構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹(ML)

ｓｉｚｅ?（ｂｐ）?（°Ｃ）??ＸＷ１Ｆ?ＧＣＡＧＧＡＡＡＴＣＴＧＧＣＴＣＡＣ?１７０?６０??ＸＷ１Ｒ?ＡＡＧＡＣＧＧＣＴＣＡＴＡＣＧＡＡＡ??ＣＯＩ１Ｆ?ＴＣＡ?ＡＣＣ?ＡＡＣ?ＣＡＣ?ＡＡＡ?ＧＡＣ?ＡＴＴ?ＧＧＣ?ＡＣ?７１７?５５??ＣＯＩ１Ｒ?ＴＡＧ?ＡＣＴ?ＴＣＴ?ＧＧＧ?ＴＧＧ?ＣＣＡ?ＡＡＧ?ＡＡＴ?ＣＡ??ＣＯＩ２Ｆ?ＴＣＧ?ＡＣＴ?ＡＡＴ?ＣＡＴ?ＡＡＡ?ＧＡＴ?ＡＴＣ?ＧＧＣ?ＡＣ??ＣＯＩ２Ｒ?ＡＣＴ?ＴＣＡ?ＧＧＧ?ＴＧＡ?ＣＣＧ?ＡＡＧ?ＡＡＴ?ＣＡＧ?ＡＡ??擴(kuò)增產(chǎn)物切膠回收后，測(cè)序結(jié)果大小為１７０ｂｐ，通過將測(cè)得序列線紋尖塘鱧的ＣＯＩ??序列進(jìn)行ＮＣＢＩ?ｂｌａｓｔ?（ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）比對(duì)，測(cè)得序列與ＣＯＩ的片段相??似度為１００％，從而排除ＸＷ１引物以核基因ＤＮＡ為模板的可能性，確認(rèn)是以ＣＯＩ模??板進(jìn)行的ＰＣＲ擴(kuò)增反應(yīng)。??＾

圖３－２?上排是引物ＸＷ１擴(kuò)增結(jié)果：１－１０：云斑尖塘鱧，１１－２０：線紋尖塘鱧??下排是引物ＣＯＩ１和ＣＯＩ２的擴(kuò)增結(jié)果：１－１０：云斑尖塘鱧，１１－２０：線紋尖塘鱧；參照標(biāo)記：ＤＬ５０００??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于微衛(wèi)星標(biāo)記的養(yǎng)殖施氏鱘親魚群體遺傳多樣性[J]. 孔杰,石婧,向燕,關(guān)梅.  貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(12)
[2]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析3個(gè)暗紋東方鲀(Takifugu obscurus)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性[J]. 鄒杰,馬愛軍,趙艷飛,何偉國,王婷,岳亮,劉大勇,郭正龍.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[3]DNA條形碼技術(shù)在魚肉及其制品鑒別中的應(yīng)用[J]. 李新光,王璐,趙峰,馬麗萍,孫永,周德慶.  食品科學(xué). 2013(18)
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[7]中國近海13種對(duì)蝦分子系統(tǒng)演化和近似種問題的研究[J]. 麥維軍,張呂平,沈琪,胡超群.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(18)
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碩士論文
[1]河川沙塘鱧家系的建立及5個(gè)主要家系的遺傳分析[D]. 丁嚴(yán)冬.南京師范大學(xué) 2015
[2]河川沙塘鱧群體遺傳多樣性及其系統(tǒng)進(jìn)化研究[D]. 侯新遠(yuǎn).南京師范大學(xué) 2014
[3]長江流域不同泥鰍群體遺傳多樣性的PCR-RFLP分析[D]. 鄭鵬飛.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：2939935