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弓背青鳉線粒體DNA遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2020-12-22 08:52
  弓背青鳉(Oryzias curvinotus)隸屬怪頜鳉科(Adrianichthyidae),青鳉屬(Oryzias),是一種廣鹽性、廣溫性、產(chǎn)卵量大、世代周期短及易于在實驗室飼養(yǎng)的小型魚類。弓背青鳉(O.curvinotus)是南方沿海分布的土著魚類,與同屬中研究最為清晰的日本青鳉(Oryzias latipes)親緣關(guān)系密切,且都具有XX-XY性別控制系統(tǒng),具有極好的理論研究價值。對弓背青鳉(O.curvinotus)生態(tài)學(xué)調(diào)查及其線粒體DNA遺傳多樣性分析,豐富了其生物學(xué)背景研究,為發(fā)展弓背青鳉(O.curvinotus)為模式生物的研究提供支撐。具體研究結(jié)果主要包括五部分:1.弓背青鳉(O.curvinotus)的生態(tài)學(xué)調(diào)查水的理化指標(biāo):鹽度范圍為0.14-33.57;水溫范圍為9.58-40.9℃;p H值范圍為7.2-9.38;溶解氧的范圍為2.11-17.12 ppm。弓背青鳉(O.curvinotus)棲息生境特征是:生活在水流平緩并有植物的水域中,一旦食蚊魚(Gambusia affinis)發(fā)展成為優(yōu)勢種,弓背青鳉(O.curvinotus)的數(shù)量將大大減少。2... 

【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 分類與形態(tài)
    1.2 生物學(xué)特性
    1.3 國內(nèi)外對弓背青鳉研究現(xiàn)狀
    1.4 魚類線粒體基因組研究意義
    1.5 研究目的和意義
2 弓背青鳉的生態(tài)學(xué)調(diào)查
    2.1 材料與方法
        2.1.1 調(diào)查點的設(shè)立
        2.1.2 采樣及測量方法
        2.1.3 室內(nèi)繁養(yǎng)
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 水的物化指標(biāo)
        2.2.2 棲息生境
        2.2.3 室內(nèi)繁養(yǎng)
    2.3 討論
3 鹽度對弓背青鳉受精卵孵化的影響
    3.1 材料與方法
        3.1.1 材料來源
        3.1.2 鹽度梯度設(shè)置
    3.2 結(jié)果
    3.3 討論
4 弓背青鳉遺傳性別鑒定
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實驗材料
        4.1.2 實驗試劑與儀器
        4.1.3 引物合成
        4.1.4 基因組DNA的提取
        4.1.5 克隆測序
        4.1.6 瓊脂糖凝膠電泳
    4.2 結(jié)果
        4.2.1 性別標(biāo)記引物克隆與分析
        4.2.2 弓背青鳉遺傳性別的判定
        4.2.3 弓背青鳉自然遺傳性比
    4.3 討論
5 弓背青鳉線粒體基因組全序列測定與系統(tǒng)進(jìn)化分析
    5.1 材料與方法
        5.1.1 材料
        5.1.2 試劑、儀器和設(shè)備
        5.1.3 實驗方法
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 弓背青鳉線粒體基因組組成與排列
        5.2.2 堿基組成
        5.2.3 蛋白質(zhì)編碼基因
        5.2.4 轉(zhuǎn)運RNA(tRNA)基因和核糖體RNA(rRNA)基因
        5.2.5 非編碼區(qū)
        5.2.6 以mtDNA基因組為基礎(chǔ)的分子系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    5.3 討論
6 基于COⅠ基因與D-loop區(qū)的南方沿海弓背青鳉遺傳多樣性分析
    6.1 材料與方法
        6.1.1 材料
        6.1.2 試劑、儀器和設(shè)備
        6.1.3 實驗方法
    6.2 結(jié)果
        6.2.1 基于mtDNACOⅠ基因的結(jié)果分析
        6.2.2 基于mtDNAD-loop區(qū)的結(jié)果分析
        6.2.3 核苷酸代替速率
    6.3 討論
        6.3.1 堿基組成
        6.3.2 遺傳變異分析
        6.3.3 根據(jù)COⅠ基因與D-loop區(qū)序列檢測群體遺傳多樣性的結(jié)果比較
        6.3.4 遺傳多樣性分析
        6.3.5 遺傳分化分析
        6.3.6 群體動態(tài)歷史
    6.4 結(jié)語
7 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長江中下游湖泊短頜鱭線粒體控制區(qū)遺傳多樣性分析[J]. 王旭歌,何勇鳳,吳興兵,楊德國.  動物學(xué)雜志. 2018(01)
[2]廣東淡水魚類弓背青鳉分類形態(tài)性狀再描述[J]. 張方方,姜昊辰,金錦錦,仇玉萍,陳國柱.  四川動物. 2017(05)
[3]基于COI基因和D-loop區(qū)部分序列比較雷州半島東、西岸湖棲鰭蝦虎魚群體的遺傳多樣性[J]. 廖健,龍水生,賀亮,郭昱嵩,劉楚吾,劉麗,王中鐸.  海洋科學(xué). 2017(02)
[4]基于DNA條形碼探討紅樹林區(qū)背眼蝦虎魚亞科魚類的分子系統(tǒng)學(xué)[J]. 張順,黃承勤,廖健,郭昱嵩,劉楚吾,王中鐸.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(08)
[5]基于線粒體DNA D-loop的都柳江鲇形目兩種經(jīng)濟魚類種群遺傳多樣性研究[J]. 劉偉,代應(yīng)貴,袁振興,孫際佳,劉麗.  水產(chǎn)科學(xué). 2016(04)
[6]COⅠ條形碼輔助分析雷州半島紅樹林區(qū)魚類的物種多樣性[J]. 張順,廖健,柏琴,陳沖,郭昱嵩,劉楚吾,王中鐸.  海洋與湖沼. 2016(03)
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[8]海水模式種青鳉魚(Oryzias melastigma)的胚胎發(fā)育觀察[J]. 陳漪,王曉杰,冉皓宇,林昱.  海洋與湖沼. 2016(01)
[9]不同水系銀鲴自然群體線粒體COI基因遺傳變異研究[J]. 劉軍,趙良杰,劉其根,張宏.  淡水漁業(yè). 2015(06)
[10]基于線粒體COI序列的中國沿海藍(lán)點馬鮫遺傳多樣性[J]. 曹艷,章群,宮亞運,呂金磊,楊喜書.  海洋漁業(yè). 2015(06)

碩士論文
[1]基于線粒體控制區(qū)和細(xì)胞色素B基因的江豚種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 程亞欣.上海海洋大學(xué) 2016
[2]基于FVCOM的瓊州海峽潮汐潮流數(shù)值模擬與研究[D]. 鄭淑賢.中國海洋大學(xué) 2015
[3]基于mtDNA Cyt b基因和D-loop區(qū)的祁連山裸鯉遺傳多樣性及分類地位分析[D]. 張久盤.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]青鳉性腺發(fā)育的組織學(xué)觀察和DMY、Dmrt1基因的表達(dá)分析[D]. 張靜.上海海洋大學(xué) 2013
[5]黃河流域大鱗副泥鰍遺傳多樣性分析[D]. 趙旭.河南師范大學(xué) 2012
[6]青鳉的生態(tài)學(xué)調(diào)查及其在不同鹽度下的繁殖生物學(xué)研究[D]. 李志國.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]中國野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂小亮.暨南大學(xué) 2010
[8]中國東部6個大型湖泊翹嘴鲌(Culter alburnus)遺傳多樣性的線粒體ND2基因序列分析[D]. 伊西慶.暨南大學(xué) 2009
[9]隆額網(wǎng)翅蝗線粒體基因組全序列的測定與分析[D]. 劉念.陜西師范大學(xué) 2006



本文編號:2931486

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