對(duì)蝦白斑綜合癥病毒（White spot syndrome virus,WSSV）是嚴(yán)重阻礙對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展的主要病害之一,能夠?qū)е吗B(yǎng)殖的對(duì)蝦大規(guī)模死亡。在本研究中,我們從自然感染的日本囊對(duì)蝦中分離出了一株新的WSSV,命名為WSSV-CN04。全基因組測(cè)序表明WSSV-CN04的基因組長(zhǎng)度為281,054 bp,編碼157種蛋白。序列比對(duì)表明WSSV-CN04的基因組序列與低毒株WSSV-CN03密切相關(guān),具有97.5%的同源性。值得注意的是,WSSV-CN04的主要囊膜蛋白VP24不僅C-末端有片段缺失,而且在病毒粒子中也檢測(cè)不到。由于VP24之前被報(bào)道是一種幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白,通過(guò)介導(dǎo)WSSV-幾丁質(zhì)相互作用對(duì)WSSV經(jīng)口腔途徑的感染有著至關(guān)重要的作用。因此本研究我們進(jìn)一步分析了WSSV-CN03和WSSV-CN04通過(guò)口腔途徑感染凡納濱對(duì)蝦的情況。結(jié)果表明:由于WSSV-CN04的VP24基因部分缺失,導(dǎo)致剩余部分無(wú)法定位到病毒粒子的囊膜上。缺失VP24的病毒粒子減弱了與消化道中幾丁質(zhì)組分的結(jié)合能力,更容易被排出消化道,造成病毒粒子在消化道的滯留時(shí)間減少,降低了病毒粒子穿過(guò)消化道... 

【文章來(lái)源】：自然資源部第三海洋研究所福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：76 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

WSSV形態(tài)結(jié)構(gòu)示意圖

預(yù)測(cè)編碼 157 種蛋白（圖5-1）。表 5-1 中我們統(tǒng)計(jì)總結(jié)了目前已經(jīng)測(cè)序的八株 WSSV 分離株的基本信息。圖 5-1：WSSV-CN04 中國(guó)大陸株的基因組結(jié)構(gòu)示意圖同時(shí)我們用 Geneious 軟件的雙序列比對(duì)功能分析了 WSSV-CN04 與其它 7個(gè) WSSV 分離株的基因組序列同源性。分析結(jié)果表明 WSSV-CN04 與WSSV-CN03 具有最高同源性（97.5％），而與高毒株 WSSV-CN01 的差異最大（90.4％）。其中 WSSV-CN03 分離于自然感染的凡納濱對(duì)蝦，2010 年發(fā)現(xiàn)于福

圖 5-2：WSSV-CN03 和 WSSV-CN04 基因組的比較分析（A） WSSV-CN03 和 WSSV -CN04 的全基因組比對(duì)的圖形結(jié)果。 WSSV-CN03 和WSSV -CN04 的基因組序列用 MAUVE 的“對(duì)比整個(gè)基因組”功能進(jìn)行對(duì)比。 同源區(qū)段顯

【參考文獻(xiàn)】：
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