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深圳東部海域造礁石珊瑚遺傳多樣性研究

發(fā)布時間:2020-11-06 14:33
   珊瑚(Coral)屬于無脊椎動物門中的腔腸類,我國沿海的珊瑚資源主要分布于南海,深圳東部海域也有分布,為研究深圳東部海域造礁石珊瑚的分布、生長及珊瑚礁區(qū)的群落結(jié)構(gòu)等情況,運(yùn)用斷帶調(diào)查法對該海域的珊瑚分布、多樣性及覆蓋情況進(jìn)行水下調(diào)查,并通過分子生物學(xué)手段,選取造礁石珊瑚珊瑚蟲16s rRNA序列片段、共生藻28s rDNA序列片段進(jìn)行分子標(biāo)記,并利用測出的序列構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,分析深圳東部海域造礁石珊瑚的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系,并研究不同種類造礁石珊瑚與共生藻類型的相關(guān)性及共生藻的多樣性。研究結(jié)果如下:1.在深圳東部海域大澳灣的珊瑚普查中,共記錄造礁石珊瑚4科8屬13種,多樣性指數(shù)為2.251,均勻度指數(shù)為0.608,優(yōu)勢種以團(tuán)塊狀珊瑚為主,夾雜少量葉狀珊瑚。頻度級關(guān)系為AB=C=D=E,暗示石珊瑚群落穩(wěn)定性較低。對樣帶下方的底質(zhì)覆蓋進(jìn)行統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)石珊瑚覆蓋率大幅下降,并呈現(xiàn)高分布區(qū)-低分布區(qū)相交錯的情況。2.對深圳東部海域常見的4科7屬的28個造礁石珊瑚個體的16s rRNA基因片段進(jìn)行分析,測序結(jié)果表明造礁石珊瑚珊瑚蟲16s rRNA基因部分序列長度在540-714bp之間。AT堿基含量高于GC含量,呈現(xiàn)AT堿基偏倚特征。造礁石珊瑚屬內(nèi)、屬間、科間遺傳距離逐漸遞增,角孔珊瑚屬(Goniopora)珊瑚樣本與其他珊瑚樣本呈現(xiàn)出較大的遺傳距離,運(yùn)用NJ、MP、ML三種方法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果具有相似的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。3.對深圳東部海域常見的5科9屬15種造礁石珊瑚共生蟲黃藻28s rDNA序列片段進(jìn)行分析,測序結(jié)果表明蟲黃藻的28s rDNA序列片段長度在515-553bp之間,AT堿基含量略高于GC含量。深圳東部海域造礁石珊瑚共生藻以D系群共生藻為優(yōu)勢系群表現(xiàn)出較高的環(huán)境耐受能力,深圳東部海域造礁石珊瑚-共生藻系統(tǒng)對于適應(yīng)外界壓力表現(xiàn)良好。深圳東部海域造礁石珊瑚單一種類只與唯一系群的蟲黃藻共生。
【學(xué)位單位】:大連海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S917.4
【部分圖文】:

珊瑚,珊瑚礁,覆蓋率,深圳


半島位于廣東省深圳東南部,三面環(huán)海,其西海岸大澳灣是是中華白海豚周圍海灣大多具有豐富的珊瑚礁資源。該地區(qū)年平均氣溫 22.5℃,屬南亞雨量約 1900mm 左右。林昭進(jìn)等[59]于 2003 年對大亞灣海域珊瑚進(jìn)行了斷珊瑚 17 種,19 個斷面中測得珊瑚覆蓋率為 7.5%-58.8%。王云祥等[60]于鵝公灣、黑巖、西涌、長角、楊梅坑及東山 6 個珊瑚礁區(qū)進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)查珊瑚覆蓋率為 13.%-55%。但大澳灣附近的珊瑚礁分布鮮有研究。料與方法查區(qū)域 年 11 月對深圳大鵬半島大澳灣珊瑚礁區(qū)進(jìn)行珊瑚種類分布、健康狀況及究。采用 GPSMAP 60CSx 型全球衛(wèi)星定位系統(tǒng)在海域設(shè)置調(diào)查站位,大1(22 33'06"N, 114 28'02"E)及其附近海域均為調(diào)查范圍。調(diào) 米。

序列,基因,珊瑚,牡丹


16s 基因序列堿基組成及變異過擴(kuò)增測序、獲得28個石珊瑚樣本的16s rRNA基因相應(yīng)的序列片段。序列長4bp之間。根據(jù)NEGA 6 軟件統(tǒng)計分析在700個排列位點(diǎn)中有517個可變位點(diǎn),的A、T、G、C堿基情況見表3-3,其中A+T的堿基含量(61.38%)明顯高于38.62%),菌珊瑚科的十字牡丹珊瑚(Pavona decussata)及小牡丹珊瑚(PavoG+C堿基含量都達(dá)到40%以上,而秘密角蜂巢珊瑚(Favites abdita)、五邊vites pentagona)及肉質(zhì)扁腦珊瑚(Platygyra carnosa)的G+C堿基含量則僅約
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2873264

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