沙塘鱧科魚類分布于東亞,雖然是蝦虎魚亞目分化史上較為重要的部分,但研究者未對其產(chǎn)生足夠的重視。沙塘鱧科魚類與大多數(shù)的蝦虎魚存在著顯著差異,它們的體型更粗壯、形態(tài)特化程度小、且僅生活于淡水中。最近的研究證實,沙塘鱧科與溪鱧科的親緣關(guān)系更近。但沙塘鱧科內(nèi)部的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系未見系統(tǒng)研究。沙塘鱧科有多少屬,目前還未知。沙塘鱧科魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系仍未理清。本研究中,我們采集了 41尾樣本,代表了除老撾怪沙塘鱧屬外的所有沙塘鱧科已知屬。同時也包含疑是沙塘鱧科物種的海南華黝魚以及6科的14種外群。我們通過靶基因富集和高通量測序收集了 4,434單拷貝核苷酸編碼基因的測序數(shù)據(jù)。沙塘鱧科的系統(tǒng)發(fā)育樹被重建,沙塘鱧科是單系群且溪鱧科是其姐妹群的觀點得以證實。本研究通過系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和肩帶特征驗證了新沙塘鱧屬、華黝魚屬和海南華黝魚確實屬于沙塘鱧科。根據(jù)形態(tài)和分子方面的證據(jù),我們以海南華黝魚為模式物種建了一新屬,命名為細(xì)齒黝魚屬(Microdous)。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹,沙塘鱧科分為兩大支:細(xì)齒黝魚屬與小黃黝魚屬和華黝魚屬形成的一支構(gòu)成姐妹群;沙塘鱧屬則與鱸塘鱧屬和新沙塘鱧屬所形成的分支關(guān)系更近。我們基于100個最符合分子鐘模型的基因數(shù)據(jù)和3塊化石信息,對沙塘鱧科魚類的分化時間進(jìn)行估算。同時,應(yīng)用RASP和BioGeoBEARS重建該科的祖先分布區(qū)域。結(jié)果顯示,沙塘鱧科魚類的共同祖先起源于約30百萬年前的中國南方。地形、氣候變化和河流襲奪可能導(dǎo)致了沙塘鱧科魚類的分化和地理分布。為厘清沙塘鱧屬的分類學(xué)問題,我們采集47尾沙塘鱧屬樣本構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,證實了暗色沙塘鱧和中華沙塘鱧均為有效種。同時,也證實了沙塘鱧屬是單系群,且與新沙塘鱧屬和鱸塘鱧屬構(gòu)成姐妹群。沙塘鱧屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系如下:暗色沙塘鱧和斜口沙塘鱧構(gòu)成一支,這一支最先分化,中華沙塘鱧和海豐沙塘鱧構(gòu)成一支隨后形成,平頭沙塘鱧單獨(dú)分化,鴨綠沙塘鱧是河川沙塘鱧和斷紋沙塘鱧的姐妹種。祖先分布區(qū)域重建結(jié)果顯示,沙塘鱧屬的祖先分布范圍較廣,包含中國東南部、朝鮮半島南部和日本等。隨著地理隔離的產(chǎn)生,該屬魚類在這些地區(qū)獨(dú)立進(jìn)化并在冰川期存在著短暫的淡水聯(lián)系。為評估中國沙塘鱧的群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,我們重建了中國三種沙塘鱧不同地理種群間的進(jìn)化關(guān)系,發(fā)現(xiàn)河川沙塘鱧、中華沙塘鱧和鴨綠沙塘鱧均存在著遺傳分化。同時基于大量單核苷酸多態(tài)性位點數(shù)據(jù),對三種沙塘鱧進(jìn)行了群體遺傳結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)河川沙塘鱧大致有3個群體;中華沙塘鱧分為4個群體;鴨綠沙塘鱧則有著兩大群體。群體遺傳結(jié)構(gòu)的形成與各種群所處水系(長江、鴨綠江)的環(huán)境變化,如河面寬度、水流流速、泥沙含量等有密切的關(guān)系。
【學(xué)位單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：S917.4
【部分圖文】：

圖１－１沙塘鰉科（引自Ｆｉｓｈｂａｓｅ）??

１．２．３溯祖理論??溯組理論指出某個種群的所有等位基因可能源于共同祖先的遺傳變異，它是??回溯基因譜系關(guān)系的理論（圖１－２）。溯祖理論排除了一些由偶然事件引起等位基??因改變的情況。這個理論假定：１．不同種群內(nèi)或種群間等位基因不發(fā)生隨機(jī)的基??因交流或遺傳漂變事件；２．在特定的時段里自然選擇對特定種群未發(fā)生作用；３．??３??

，６??１．２．５哈迪－溫伯格平衡定律??哈迪－溫伯格平衡定律認(rèn)為，不考慮進(jìn)化事件的影響，群體內(nèi)部從上一代到下??—代的等位基因頻率與基因型頻率始終恒定。這些進(jìn)化事件包含婚配選擇、突變、??＿然選擇、基囡漂變、基囡交流和減數(shù)分裂驅(qū)動。不受這些事件影響的群體實際??上是不存在的，是“理想群體”。單一位點存在２個等位基因Ａ、ａ，它們的基面頻??率分別是／（Ａ）＝廣、／（ａ）＝心在隨機(jī)交配情況下，預(yù)期的ＡＡ?xí)r基國型頻率是／??（ＡＡ）＝ｐ２，ａａ的是／（ａａ）?＝?ｇ２?，?Ａａ的就是／（Ａａ）?＝?２辦�；嬱`頻率的和為１，??夕＋?２網(wǎng)＋?＃＝１?（圖１－３）。在沒有自然選擇、突變、基固溱變或者其他選擇壓力??的情況下，等位基因頻率ｐ、ｇ逐代保持恒定，這就是平衡狀態(tài)＊?Ｇ．Ｈ．?Ｈａｒｄｙ和??Ｗｉｌｈｅｌｍ?Ｗｅｉｎｂｅｒｇ首先通過數(shù)學(xué)的方法證實了這個定律《該定律解釋繁殖對基因??頻率和基因型頻率的影響。該定律的童要應(yīng)用之一是可以依據(jù)平衡狀態(tài)的群體基??因頻率來確定基因型頻率。??＇
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 張燕萍;王海華;吳斌;趙春來;王慶萍;陳文靜;俞澤溪;;沙塘鱧屬魚類種質(zhì)資源研究和保護(hù)進(jìn)展[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年02期

2 丁慧萍;覃劍暉;林少卿;格桑達(dá)娃;張志明;謝從新;;拉薩市茶巴朗濕地的外來魚類[J];水生態(tài)學(xué)雜志;2014年02期

3 陶林;周洵;張年軍;蘇文霞;潘俊;貢見輝;;河蟹、青蝦、沙塘鱧池塘生態(tài)養(yǎng)殖技術(shù)研究[J];中國水產(chǎn);2014年02期

4 任崗;章群;;中國沙塘鱧屬魚類線粒體12S rRNA基因序列分析[J];水生生物學(xué)報;2007年04期

5 喬德亮;洪磊;;淮河水系沙塘鱧形態(tài)特征和分類地位初步研究[J];淡水漁業(yè);2007年02期

6 許有鵬,于瑞宏,馬宗偉;長江中下游洪水災(zāi)害成因及洪水特征模擬分析[J];長江流域資源與環(huán)境;2005年05期

7 張仲石,郭正堂;根據(jù)地質(zhì)記錄恢復(fù)漸新世和中新世不同時期環(huán)境空間特征及其意義[J];第四紀(jì)研究;2005年04期

8 吳志浩,張貴友;淺析溯祖理論[J];生物學(xué)通報;2003年10期

9 萬天豐,曹瑞萍;中國中始新世—早更新世構(gòu)造事件與應(yīng)力場[J];現(xiàn)代地質(zhì);1992年03期

10 陳煒;鄭慈英;;中國塘鱧科魚類的三新種[J];暨南理醫(yī)學(xué)報(理科專版);1985年01期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前3條

1 鄭新;中國子陵吻蝦虎魚和小黃黝魚的種群結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性分析[D];上海海洋大學(xué);2016年

2 李強(qiáng);基于多基因位點的長江流域及淮河流域沙塘鱧屬魚類遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)分析[D];上海海洋大學(xué);2015年

3 程巖;鴨綠江河口地貌的形成與演變[D];東北師范大學(xué);2007年

本文編號：2842815