墨吉明對蝦是中國東南沿海生態(tài)系統(tǒng)的關(guān)鍵種和重要的漁業(yè)經(jīng)濟種。隨著近幾年來南美白對蝦養(yǎng)殖的大力發(fā)展,出現(xiàn)的難題也逐漸增多,例如進口親蝦越來越貴、種質(zhì)資源降低、病害加劇等嚴重影響其效益。因此尋找替代品種來保證對蝦行業(yè)的產(chǎn)出量,是當(dāng)務(wù)之急。而從70年代開始,我國就開始了對墨吉明對蝦的胚胎發(fā)育、育苗等養(yǎng)殖技術(shù)的研究。墨吉明對蝦養(yǎng)殖曾在我國對蝦養(yǎng)殖中占重要地位,墨吉明對蝦野生種質(zhì)資源也可從我國自然海區(qū)捕獲,且又具有價格相對便宜、抗病性較強等優(yōu)點,已受到養(yǎng)殖戶的廣泛關(guān)注。但是截止目前,我們對于墨吉明對蝦自然種群在中國東南沿海的種群組成、遺傳結(jié)構(gòu)等遺傳學(xué)屬性的了解還是空白。因此,我們采集了覆蓋墨吉明對蝦在中國近海主要分布地區(qū)的自然群體樣品,選用當(dāng)下比較流行的線粒體標記和微衛(wèi)星分子標記,對這個自然物種的種群遺傳結(jié)構(gòu)進行了進一步的分析,以期對其能有更好的理解。首先利用RAD測序的方法,開發(fā)了墨吉明對蝦多態(tài)性微衛(wèi)星標記。結(jié)果共獲得多態(tài)性墨吉明對蝦微衛(wèi)星標記23個,各標記等位基因分布范圍為3-16,各標記的觀測雜合度(HO)和期望雜合度(HE)的分布范圍分別為0.2188-1.0000和0.4430-0.8819,而各標記的“哈迪溫伯格”平衡測試的結(jié)果表明,5個位點背離了哈迪溫伯格平衡。其中只有4個位點顯示出中多態(tài)性(0.25PIC0.5),其余全是高度多態(tài)性(PIC0.5)。采集覆蓋墨吉明對蝦在中國沿海分布范圍的9個墨吉明對蝦自然群體,使用線粒體Control Region標記,對中國沿海墨吉明對蝦種群遺傳結(jié)構(gòu)進行了分析。所有的樣本共檢測到191個多態(tài)性位點(S),共定義181個單倍型(Nh)。墨吉明對蝦總體反映出非常高的單倍型多樣性(0.9958±0.0010)和較高的核苷酸多樣性(0.021798±0.010897)。通過構(gòu)建群體間的系統(tǒng)發(fā)育樹(NJ樹)發(fā)現(xiàn),來自北部灣的臨高群體(LG)、北海群體(BH)、企沙群體(QS)單獨據(jù)為一支(GOT),剩下6個群體(Clade I)成分散態(tài)勢,沒有形成與地理群體對應(yīng)的分支,與地理位置沒有明顯的相關(guān)性。以組(GOT)和組(Clade I)為依據(jù),進行組間、組內(nèi)群體間和群體的內(nèi)部的分級分子方差分析,分析結(jié)果表明,墨吉明對蝦Control Region區(qū)序列幾乎所有的遺傳差異(99.22%)均來源于群體內(nèi)部,組內(nèi)群體間和組間的遺傳差異分別占0.37%和0.41%。核苷酸不配對分布曲線分析和中性檢驗分析均表明墨吉明對蝦群體在中國海域歷史上發(fā)生過擴張。由此可以推算出墨吉明對蝦群體擴張事件發(fā)生在距今115559-39518年前。屬于更新紀晚期。上述分析都說明墨吉明對蝦群體,兩個組(GOT和Clade I)之間存在明顯的遺傳差異,組內(nèi)部各群體間遺傳差異非常微弱。采集覆蓋墨吉明對蝦在中國沿海分布范圍的9個墨吉明對蝦自然群體,使用16對微衛(wèi)星標記,對中國沿海墨吉明對蝦種群遺傳結(jié)構(gòu)進行了分析。所有的群體顯示出高度的基因多樣性廈門群體(He=0.5557~0.6870)。計算各自然群體對間的FST值,僅有34個群體對之間的FST值高于0.01,最高值僅為0.06049,這表明群體對之間的遺傳分歧程度普遍很低。顯著性檢驗的結(jié)果顯示,有25個群體對之間的FST值通過了檢驗,其中,企沙群體(QS)與其他9個群體分別存在顯著性的遺傳分歧,表明企沙群體(QS)其他群體的遺傳分歧程度較大。AMOVA結(jié)果顯示,全部自然群體中僅有2.25%的遺傳變異來自于群體間,而97.75%的遺傳變異來自于群體內(nèi)部(P=0.00000),將9個群體分為北部灣組和剩余群體組兩個組,來對組間的遺傳差異程度進行評價,2個組間(P=0.00000)和組內(nèi)群體間(P=0.00000)存在微弱但是顯著性的遺傳分歧。但群體內(nèi)部雖存在較大的遺傳變異,但是不顯著(P=0.42424)。Structure軟件的分析結(jié)果表明:將種群數(shù)(K)設(shè)定為3時,9個自然墨吉明對蝦群體除了處于北部灣地區(qū)的北海群體和企沙群體帶有特異的假定種群的特征外,剩余7個群體都基本帶有幾乎相同程度的各個假定種群的特征。這些結(jié)果說明9個自然群體間存在兩個與地理位置有相關(guān)性的兩個種群。
【學(xué)位單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2016
【中圖分類】：S917.4
【部分圖文】：

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文地理格局狀況，以期為墨吉明對蝦資源的開發(fā)、保護、管理和可持續(xù)利用提供科學(xué)依據(jù)。2.1 材料與方法2.1.1 材料2.1.1.1 樣品采集根據(jù)墨吉明對蝦在中國沿海的分布范圍，設(shè)計采樣地點，采集我國東南沿海周邊的 9 個墨吉明對蝦群體的 250 個個體，樣品信息見圖（圖 2-1）和表（表2-1）。

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文2.2.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析基于 NJ 樹以 Tamura 3-parameter 距離構(gòu)建的墨吉明對蝦 Control Region 區(qū)的系統(tǒng)發(fā)育樹見圖（圖 2-2）。當(dāng) 9 個群體單獨聚類時，如圖 2-2（左）所示，除北海群體（BH）與剩余 8 個群體聚類較遠，有地理分布相關(guān)外，剩余 8 個群體呈分散態(tài)勢，而將位于北部灣的三個群體（臨高群體、北海群體、企沙群體）合并為一個群體（GOT）聚類時，如圖 2-2（右），發(fā)現(xiàn)來自北部灣的臨

圖 2-3 基于線粒體 Control Region 序列構(gòu)建的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖Fig 2-3 Median-Network showing phylogenetic relationship among Control Regionhaplotypes of Fenneropenaeus merguiensis表 2-3 墨吉明對蝦的群體遺傳結(jié)構(gòu)Table 2-3 Genetic structuring for populations of Fenneropenaeus merguiensis variation d.f Sum of squares Variance components % variatio間 1 10.110 0.02664 Va 0.41體內(nèi)部 7 49.866 0.02411 Vb 0.37內(nèi)部 241 1557.515 6.46272 Vc 99.22

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1 胡賢德;孫成波;李鎮(zhèn)泉;陳科光;王平;李義軍;徐安敏;;北部灣墨吉明對蝦和斑節(jié)對蝦形態(tài)性狀對體質(zhì)量的影響分析[J];海南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2009年01期

2 俞開康;養(yǎng)殖對蝦病毒病的診斷和防治[J];齊魯漁業(yè);2005年01期

3 ;[J];;年期

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1 鞏法慧;中國東南沿海墨吉明對蝦分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D];上海海洋大學(xué);2016年

本文編號：2820750