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翹嘴鱖肌肉及肝臟miRNA的節(jié)律性表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-17 17:39
【摘要】:晝夜節(jié)律又稱近日節(jié)律,是機(jī)體行為、生理和生化呈近似24h周期性變化的規(guī)律,在所有動(dòng)物確定睡眠和進(jìn)食模式中起重要作用,并與生理周期的腦波活動(dòng)、激素生產(chǎn)、細(xì)胞再生及其它生理活性模式相關(guān)聯(lián)。目前對晝夜節(jié)律的機(jī)理研究主要在轉(zhuǎn)錄水平和翻譯后修飾,而轉(zhuǎn)錄后水平的研究還少有報(bào)道。MicroRNAs (miRNAs)與其靶基因3'非翻譯區(qū)(3'-UTR)元件的相互作用,靶向調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性和翻譯,因此,miRNA在調(diào)節(jié)動(dòng)物生長、繁育和疾病產(chǎn)生進(jìn)程中起重大作用。然而miRNA作為重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)因子,其在魚類晝夜節(jié)律調(diào)節(jié)的生物學(xué)功能尚未見報(bào)道。因此本研究以翹嘴鱖為研究對象,構(gòu)建翹嘴鱖紅肌和其它5個(gè)混合組織的小RNA文庫,然后利用Solexa高通量測序技術(shù)對小RNA文庫中的片段進(jìn)行測序。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測翹嘴鱖紅肌、白1肌和肝臟組織相關(guān)miRNA在12h:12h光/暗周期(LD光制)條件下的表達(dá)水平,分析了篩選后的miRNA在翹嘴鱖紅肌、白肌和肝臟組織內(nèi)表達(dá)的晝夜節(jié)律性,以及miRNA之間表達(dá)相關(guān)性。本研究結(jié)果如下:1利用Solexa高通量測序結(jié)果鑒定出了翹嘴鱖紅肌組織的204個(gè)miRNAs,在混合組織文庫中鑒定出了的217個(gè)miRNAs,其中包括2個(gè)新miRNAs,這些結(jié)果大量豐富了魚類miRNA數(shù)據(jù)庫。2對從紅肌文庫中篩選出的42個(gè)miRNAs進(jìn)行了晝夜節(jié)律性表達(dá)分析研究。在翹嘴鱖紅肌組織中21個(gè)niRNAs具有顯著的晝夜節(jié)律性,包括高表達(dá)的miR-206、miR-107和miR-133等10個(gè)miRNAs,以及相對較低表達(dá)的niR-29、miR-31和miR-375等11個(gè)miRNAs。多數(shù)miRNAs彼此之間存在正相關(guān)性,其中miR-133和miR-206呈正強(qiáng)相關(guān)性,而miR-499與部分miRNA存在負(fù)相關(guān)關(guān)系。翹嘴鱖白肌組織有35個(gè)miRNAs存在晝夜節(jié)律表達(dá),包括高表達(dá)的miR-1、miR-10和miR-21等18個(gè)niRNAs,以及相對較低表達(dá)的miR-338、miR-31 和 miR-93等17個(gè)miRNAs。這些miRNAs彼此之間存在相關(guān)性,其中miR-1、miR-133和miR-206彼此呈正相關(guān)性,而miR-499和miR-375與部分miRNAs呈負(fù)相關(guān)性。3對翹嘴鱖肝臟組織內(nèi)篩選出的23個(gè)與肝臟代謝或疾病相關(guān)miRNAs的晝夜節(jié)律表達(dá)進(jìn)行了研究。其中niR-26a、miR-122、miR-16、miR-33a、miR-200b、miR-221、miR-155、 miR-181b、miR-10、miR-21、miR-99b、miR-192、miR-194和miR-146a具有明顯的晝夜節(jié)律表達(dá),這些miRNA之間部分存在正相關(guān)關(guān)系。
【學(xué)位授予單位】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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