【摘要】：琴魚(Rhinogobius SP)屬于鱸形目(Perciformes)蝦虎魚亞目(Gobioidei)蝦虎魚科(Gobiidae)吻蝦虎魚屬(Rhinogobius),是安徽省皖南山區(qū)地方特有魚類,也是安徽省二級保護(hù)動物,具有極高的經(jīng)濟(jì)價值。目前琴魚的種屬關(guān)系只鑒定至吻蝦虎魚屬。由于蝦虎魚體型較小,且種類繁多,其游泳能力不強(qiáng),許多種類由于地理隔絕等因素形成了新種或亞種,造成了蝦虎魚的分類較為混亂。本文主要從形態(tài)學(xué)和分子分類學(xué)兩個方面對琴魚的種屬關(guān)系進(jìn)行鑒定和分析,得到以下結(jié)論:一、琴魚外形細(xì)長,前端呈圓柱狀,后部呈側(cè)扁形,雌魚體長和體寬的比例較雄魚略小,且體色比雄魚淺,體被大櫛鱗,頭部無鱗、腹部無鱗,無背鰭前鱗,無側(cè)線,胸鰭透明無色,基部無黑色斑點(diǎn),展開呈圓形,與琴魚形態(tài)學(xué)特征最為相似的是褐吻蝦虎魚和波氏吻蝦虎魚,但波氏吻蝦虎魚的胸鰭鰭條數(shù)比琴魚多2-3條,且第一背鰭上有一藍(lán)黑色斑,而褐吻蝦虎魚第一背鰭高聳呈三角形。二、通過PCR擴(kuò)增得到琴魚線粒體基因組全長,通過序列分析,得到結(jié)論如下:琴魚線粒體基因組全長16483 bp(登錄號:KU871066.1),堿基組成為:A(27.06%)、T(26.21%)、G(16.89%)、C(29.84%)其中G的含量相對較少,A、T、C堿基數(shù)量基本相當(dāng),并且A+T堿基(53.27%)大于G+C堿基(46.73%)。包括37個編碼基因和一個非編碼控制區(qū)(D-loop區(qū)),編碼基因包括13個蛋白質(zhì)基因、2個rRNA基因,22個tRNA基因,其中tRNA基因中的Gln、Ala、Asn、Cys、Tyr、Ser、Glu、Pro基因在L鏈上編碼,剩余的基因均編碼在H鏈上。最長的非編碼區(qū)位于Asn和Cys之間,共有27bp,重復(fù)編碼區(qū)域均不超過10bp,最多為7bp。三、采用了鄰接法和最大似然法兩種方法分別對16S rRNA、ND1、ND2、COX I和Cyt b基因建立系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,兩種方法分別針對上述基因建立的進(jìn)化樹都明確地將琴魚歸類至吻蝦虎魚屬,支持形態(tài)學(xué)上的分類結(jié)果。鄰接法構(gòu)建的進(jìn)化樹中,除ND2基因建立的進(jìn)化樹將子陵吻蝦虎魚歸類于裸頭蝦虎魚屬外,其他4個進(jìn)化樹都將吻蝦虎魚聚在一起,但屬內(nèi)種之間的親緣關(guān)系不完全相同,且屬以上層次的親緣關(guān)系差異較大。最大似然法建樹,除ND2基因建立的進(jìn)化樹將子陵吻蝦虎魚歸類于裸頭蝦虎魚屬外,其他4個進(jìn)化樹都將吻蝦虎魚聚在一起。16S rRNA和COX I進(jìn)化樹中,與吻蝦虎魚屬親緣關(guān)系最近的是矛尾蝦虎魚屬(Chaemrichthys)和鈍尾蝦虎魚屬(Amblychaeturichthys),ND1進(jìn)化樹中與吻蝦虎魚屬較為接近的是線塘鱧屬(Nemateleotris),ND2進(jìn)化樹中與之親緣關(guān)系最接近的屬是縞蝦虎虎魚屬(trigonocephalus),Cyt b進(jìn)化樹中與吻蝦虎魚屬親緣關(guān)系較為接近的是短蝦虎魚屬(Brachygobius)。四、琴魚和吻蝦虎魚的3個種以及虎魚屬的三個種遺傳距離比較。在16S rRNA基因遺傳距離明顯小于其他基因,ND1和ND2進(jìn)化速度較快,COX1和Cyt b較為保守,全序列的進(jìn)化速度和Cyt b基因最為接近。與琴魚遺傳距離最短的為褐吻蝦虎魚,Mt DNA的遺傳距離接近0.095;其次是波氏吻蝦虎魚,遺傳距離為0.113。綜合形態(tài)學(xué)特征和分子分類學(xué)分析結(jié)果,認(rèn)定琴魚為吻蝦虎魚一地方亞種,是否為新種還需進(jìn)一步研究鑒定。本文通過形態(tài)學(xué)和分子水平兩個方面,準(zhǔn)確鑒定出琴魚的種屬關(guān)系,為開發(fā)和保護(hù)琴魚資源提供理論基礎(chǔ);同時獲得了琴魚線粒體基因組全長,補(bǔ)充了Genbank上吻蝦虎魚屬的基因庫,為后期深入研究琴魚提供基礎(chǔ)資料。
【學(xué)位授予單位】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S917.4
【圖文】：

1.2 樣本的采集主要采樣地點(diǎn)位于安徽省涇縣琴溪河蔡村鎮(zhèn)河段，坐標(biāo)（30.680885,118.516658），地圖位置如圖 1-1 所示。再對青弋江支流孤峰河源頭處，九峰河九峰村河段，秦坑河秦坑村河段，厚岸河查濟(jì)村河段進(jìn)行采樣，調(diào)查琴魚是否分布于該地域。駕車前往采樣地點(diǎn)，采用純?nèi)斯きh(huán)保的方式隨機(jī)捕撈該區(qū)域的魚，挑選琴魚若干，用充氧箱運(yùn)輸至安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院魚類養(yǎng)殖實(shí)驗(yàn)室暫養(yǎng)，再隨機(jī)取琴魚各 20 條進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀測。

注：圖①是雄魚；圖②是雌魚；圖③是愈合成吸盤狀的腹鰭；圖④是琴魚頭部的特征；圖⑤是胸鰭的特征；圖⑥是琴魚的卵。Fig2-1 morphologic feature of Rhinogobius SPTips：fig ① is male Rhinogobius SP; fig ② is female Rhinogobius SP; fig ③ is ventral fin of Rhinogobius SP; fig④ is head feature of Rhinogobius SP; fig ⑤ is pectoral fin of Rhinogobius SP; fig ⑥ is eggs of Rhinogobius SP.①②

圖 2-3 琴魚的線粒體基因組Fig2-3 Rhinogobius SP mitochondrial genome表 2-3 琴魚線粒體 DNA 基因組信息表Table 2-3 Characterization of mitochondrial genome of Rhinogobius SP基因名稱 位置 長度 起始密碼 終止密碼a基因間隔b*鏈tRNA-Phe 1-68 68 0 H12SrRNA 69-1022 954 0 HtRNA-Val 1023-1094 72 0 H16S rRNA 1095-2781 1687 0 HtRNA-Leu 2782-2856 75 0 HND1 2857-3831 975 ATG TAA 0 HtRNA-Ile 3835-3903 69 3 HtRNA-Gln 3903-3973 71 -1 LtRNA-Met 3973-4041 69 -1 HND2 4042-5088 1047 ATG TAA 0 H

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2786691