發(fā)布時(shí)間：2020-07-19 21:33

【摘要】：祁連山裸鯉(Gymnocypris chilianensis)隸屬于鯉形目,鯉科,裂腹魚亞科,裸鯉屬,僅分布于甘肅省河西走廊黑河、疏勒河及石羊河三大內(nèi)陸河流域。近年來,由于受到內(nèi)陸河流域生態(tài)環(huán)境失衡及水利工程建設(shè)、過度捕撈等自然與人為因素的雙重影響,祁連山裸鯉自然分布區(qū)大面積縮減,野生資源急劇減少。祁連山裸鯉的物種地位一直備受爭(zhēng)議,有關(guān)學(xué)者以形態(tài)學(xué)分類得到的分類結(jié)果也不盡相同。本研究采集河西走廊黑河(HH)及疏勒河(SL)流域的祁連山裸鯉各25尾,青海湖的青海湖裸鯉(Gymnocypris przewalskii)(QH)25尾。提取這些樣本的基因組DNA,分別擴(kuò)增線粒體DNA細(xì)胞色素b基因(Cyt b)及D-loop區(qū)序列。另從GenBank中下載花斑裸鯉(Gymnocypris eckloni)(HB)的Cyt b基因和D-loop區(qū)序列各25條,通過基因序列特征分析、遺傳多樣性分析以及遺傳距離和進(jìn)化樹分析,從分子水平上探討了祁連山裸鯉的遺傳多樣性及其分類地位。主要研究結(jié)果如下:(1)分析祁連山裸鯉、花斑裸鯉和青海湖裸鯉共100尾個(gè)體的Cyt b基因全序列(1140 bp,均無插入"缺失),共檢測(cè)到變異位點(diǎn)267個(gè),單倍型94個(gè)。4個(gè)群體單倍型多樣度為0.9870~1.0000,核苷酸多樣度為0.0039~0.0063。其中祁連山裸鯉黑河種群(HH)遺傳多樣性水平最高(h=1.0000,π=0.0063),疏勒河種群(SL)遺傳多樣性水平最低(h=0.9870,π=0.0039)。利用Kimura雙參數(shù)模型計(jì)算4個(gè)群體的群體內(nèi)和群體間遺傳距離分別為0.0040~0.0060和0.0070~0.0840,表明群體間遺傳距離均大于群體內(nèi)遺傳距離;其中祁連山裸鯉黑河種群(HH)和疏勒河種群(SL)與花斑裸鯉(HB)遺傳距離分別為0.0810和0.0780,與青海湖裸鯉(QH)遺傳距離分別為0.0840和0.0810,均大于0.0600,表明祁連山裸鯉與花斑裸鯉、青海湖裸鯉達(dá)到了種的分化水平,祁連山裸鯉是裸鯉屬的一個(gè)獨(dú)立種。(2)分析祁連山裸鯉、花斑裸鯉和青海湖裸鯉共100尾個(gè)體的D-loop區(qū)序列(747 bp,均無插入"缺失),共檢測(cè)到變異位點(diǎn)116個(gè),單倍型78個(gè)。4個(gè)群體單倍型多樣度為0.9431~0.9970,核苷酸多樣度為0.0043~0.0082。祁連山裸鯉黑河種群遺傳多樣性水平最高(h=0.9970,π=0.0082),疏勒河種群遺傳多樣性水平最低(h=0.9431,π=0.0043)。與基于Cyt b基因的研究結(jié)果一致。利用Kimura雙參數(shù)模型計(jì)算4個(gè)群體的群體內(nèi)和群體間遺傳距離分別為0.0050~0.0080和0.0084~0.0350,表明群體間遺傳距離均大于群體內(nèi)遺傳距離;其中祁連山裸鯉黑河種群(HH)和疏勒河種群(SL)與花斑裸鯉(HB)遺傳距離分別為0.0320和0.0280,與青海湖裸鯉(QH)遺傳距離分別為0.0350和0.0300。驗(yàn)證了本試驗(yàn)中基于Cyt b基因?qū)z傳距離研究的結(jié)果。(3)以厚唇裸重唇魚(Gymnodiptychus pachycheilus)(Cyt b與D-loop區(qū)序列GenBank登陸號(hào):JQ082349和FJ601172)和雙須葉須魚(Ptychobarbus dipogon)(Cyt b與D-loop區(qū)序列GenBank登陸號(hào):JQ082345和FJ601178)為外群,使用Mega 5.0軟件分別構(gòu)建基于Cyt b與D-loop區(qū)序列所有單倍型的NJ系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示,兩樹均是由兩大枝組成,祁連山裸鯉的兩個(gè)種群聚為其中一枝,花斑裸鯉和青海湖裸鯉聚為另一大分枝,說明祁連山裸鯉與花斑裸鯉和青海湖裸鯉的親緣關(guān)系遠(yuǎn),而花斑裸鯉和青海湖裸鯉具有較近的親緣關(guān)系。(4)對(duì)祁連山裸鯉(HH和SL)和青海湖裸鯉的Cyt b與D-loop兩基因各75條序列(兩個(gè)基因的75條序列來源于相同的樣本群)進(jìn)行序列分析。結(jié)果顯示,Cyt b基因多態(tài)位點(diǎn)百分比(21.9%)極顯著高于D-loop區(qū)(14.3%)(P0.01),每個(gè)核苷酸位點(diǎn)的替代數(shù)Cyt b(0.0221)D-loop(0.0163),表明裸鯉屬魚類Cyt b基因比D-loop區(qū)具有更快的進(jìn)化速率,更適用于裸鯉屬魚類近緣種間的遺傳分化研究�；贑yt b基因分析結(jié)果表明,祁連山裸鯉和青海湖裸鯉發(fā)生遺傳分化的時(shí)間在距今約2.4 Ma(百萬年)的更新世初期,與青藏高原隆升時(shí)期相符合。
【學(xué)位授予單位】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S917.4

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2763002