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魚類let-7家族的系統(tǒng)進化及表達與團頭魴生長和性腺發(fā)育的相關(guān)性研究

發(fā)布時間:2020-06-08 22:38
【摘要】:團頭魴(Megalobrama amblycephala)屬于鯉形目,鯉科,魴屬,又名武昌魚,具有味美、頭小、含肉率高、體形好、規(guī)格適中等優(yōu)點,是我國淡水魚類養(yǎng)殖的重要品種之一。然而,由于其自然分布十分狹隘、遺傳多樣性弱小、缺乏種質(zhì)資源保護等原因,團頭魴正受到種質(zhì)資源衰退的威脅,各地團頭魴人工養(yǎng)殖群體開始出現(xiàn)生長變慢以及性成熟提早等不良性狀。let-7 microRNAs(miRNAs)是miRNA家族中的重要成員,其在哺乳動物、軟體動物、魚體中均有表達,已被報道與動物體生長和性腺發(fā)育有著一定關(guān)系。本研究基于已經(jīng)發(fā)表公布的魚類小RNA組信息,系統(tǒng)分析了魚類let-7 miRNAs的系統(tǒng)進化,并以團頭魴為研究對象,首次在魚類中探討let-7 miRNAs對魚類生長和性腺發(fā)育的表達調(diào)控作用,為探討let-7 miRNAs在魚類生長和性腺發(fā)育調(diào)控方面的功能研究奠定了基礎(chǔ)。研究主要結(jié)果如下:1、通過比較miRBase數(shù)據(jù)庫中9種魚類、5個外源種類及2個魚類祖先物種的let-7 miRNAs10個成員的前體序列信息,并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,結(jié)果表明:let-7 miRNA序列在魚類中極度保守,而各let-7 miRNAs在不同物種中的基因拷貝數(shù)目也有所不同。在let-7a/b/c/d/e/f/g/h/i/j10個成員中,let-7a的前體序列與祖先序列最為接近,而其它成員均來自于let-7a的后期分化。通過GO功能富集分析發(fā)現(xiàn),魚類let-7 miRNAs成員的候選靶基因涉及一系列的生化過程,特別是在發(fā)育過程以及生長過程中發(fā)揮著重要作用。KEGG通路富集的結(jié)果顯示,預(yù)測靶基因集在卵母細胞減數(shù)分裂通路中分布十分廣泛。這些結(jié)果都為let-7 miRNAs在團頭魴生長及性腺發(fā)育中發(fā)揮的作用提供了理論依據(jù)。2、為了確定10個let-7 miRNAs成員在魚類生長發(fā)育過程中可能所發(fā)揮的不同功能,本研究檢測了其在團頭魴雌雄性成熟個體、以及3、6、12月齡生長快慢個體中的相對表達量。結(jié)果顯示10個miRNAs在雌雄個體中的表達模式十分相似,表現(xiàn)為在腦和垂體中的表達總是高于其它組織(P0.05)。在10個miRNAs中,let-7a在所有的組織中表達量均最高,其次為let-7b和let-7d,let-7c/e/f/g/h/i/j表達量最低。在不同生長階段的實驗組中,let-7 miRNAs在生長慢實驗組個體的腦和垂體中的表達總是顯著高于生長快實驗組(P0.05)。而let-7a/b/c/d/e在3月齡生長慢個體各組織中的表達均顯著高于生長快個體(P0.05)。這些結(jié)果表明let-7 miRNAs可能通過負調(diào)節(jié)其靶基因的表達,從而在團頭魴的生長發(fā)育過程中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用。3、為了探討10個let-7 miRNAs成員對魚類性腺發(fā)育的調(diào)控作用,本研究分析了let-7 miRNAs家族10個成員團頭魴性腺發(fā)育不同階段的表達模式,結(jié)果顯示在不同時期卵巢起主要表達作用的是let-7a/b/d。let-7a/b/d/f/h在Ⅰ至Ⅴ期性腺中的表達量逐步上升,第Ⅵ期顯著下降。而垂體中的let-7a/b/e/f在前4期上升,Ⅴ、Ⅵ期下降。這兩種表達模式都與魚類性腺的發(fā)育過程吻合,表明let-7 miRNAs可能在性激素及其受體基因兩個層次調(diào)節(jié)性腺發(fā)育。值得注意的是,let-7 miRNAs在性腺發(fā)育不同時期團頭魴腦中的表達與垂體中的表達完全相反,其表達原理仍有待進一步探究。在所有l(wèi)et-7 miRNAs中,let-7a/b在性腺發(fā)育不同時期團頭魴的卵巢、腦和垂體中均呈現(xiàn)規(guī)律性表達且表達量最高,表明let-7a/b在團頭魴的性腺發(fā)育過程中扮演著重要的角色。
【圖文】:

生物合成,文獻,過程


2004; Schwarz et al 2003; Maniataki and Mourelatos 2005)。而miRNA*鏈則在同時被迅速降解(圖1-1)。圖1-1 miRNA的生物合成過程(引自文獻(Donadeu et al 2012))Fig. 1-1 The biogenesis of miRNA(cited from Donadeu et al 2012)

種魚,系統(tǒng)進化樹,物種,小枝


miRNA 各基因均很好的聚在了同一小枝,而其他物種的 let-7 miRNAs 則分散在進化樹的各枝。圖2-2 16個物種(包括9種魚類)let-7 miRNAs的系統(tǒng)進化樹Fig. 2-2 The phylogenic tree of let-7 miRNAs in 16 species including nine fishspecies
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S917.4

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前8條

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本文編號:2703749

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