發(fā)布時間：2020-05-28 01:34

【摘要】：大黃魚(Larimichthys crocea)是中國海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖量最大的重要經(jīng)濟物種之一,其生長具有雌雄二態(tài)性,然而大黃魚性腺分化分子機制相關(guān)知識仍然匱乏,性腺分化過程中基因表達情況缺乏系統(tǒng)研究。因此,本文對不同發(fā)育階段的大黃魚雌雄性腺進行分別測序,然后進行比較分析。主要研究結(jié)果如下:1、取8月齡大黃魚雌雄性腺進行RNA-Seq,初步考察轉(zhuǎn)錄組分析大黃魚性腺基因表達狀況的效率及可靠性。結(jié)果顯示,RNA-Seq共產(chǎn)生2.5億個平均125bp的原始讀段,經(jīng)質(zhì)控、拼接,獲得77405個平均長度為896bp的轉(zhuǎn)錄本,其中雄性高表達基因13342個,雌性高表達基因3573個,雄性特異表達基因4713個,雌性特異表達基因46個。差異基因的聚類熱圖顯示,雌雄性腺間基因表達模式差異巨大,相同性別樣品間重復(fù)性好。用該數(shù)據(jù)庫查找了42個性別決定或分化相關(guān)基因的序列和表達量,并利用RT-PCR驗證了其中12個基因,結(jié)果相符的有10個基因,不相符的有2個基因。2、取3月齡和18月齡大黃魚性腺進行RNA-Seq,然后將數(shù)據(jù)對比到實驗室獲得的基因組上,結(jié)合第一部分研究內(nèi)容,分析大黃魚在各個發(fā)育階段性腺表達基因的表達水平,篩選性腺性別特異表達基因。3月齡測序數(shù)據(jù)注釋到21944個基因;8月齡測序數(shù)據(jù)注釋到21924個基因;18月齡測序數(shù)據(jù)注釋到19,659個基因。其中,在大黃魚3月齡性腺中,有68個基因在精巢中特異性表達,157個基因在卵巢中特異性表達,3910個基因共表達;8月齡時,有1959個基因在精巢中特異性表達,45個基因在卵巢中特異性表達,7480個基因共表達;18月齡時,有976個基因在精巢中特異性表達,140個基因在卵巢中特異性表達,7233個基因共表達;將雌雄數(shù)據(jù)分別混合,發(fā)現(xiàn)仍然有13個基因在精巢中特異性表達,8個基因在卵巢中特異性表達,6773個基因共表達。將大黃魚雌雄性腺在不同發(fā)育階段中特異表達基因分別作統(tǒng)計分析,更好地觀測這些表達基因在每兩個相鄰時期的變化。3、研究對大黃魚雌雄性腺發(fā)育的時序性,獲得表達基因在不同發(fā)育時期的數(shù)量變化。在雄性中,從3月齡到8月齡有2789個基因表達量上升,2944個基因表達量下降;從8月齡到18月齡有2436個基因表達量上升,共有2307個基因表達量下降。在雌性中,從3月齡到8月齡有716個基因表達量上升,5061個基因表達量下降;從8月齡到18月齡有584個基因表達量上升,共有247個基因表達量下降。本文為進一步研究大黃魚的性別分化機制奠定基礎(chǔ),也為魚類性別分化機制和進化研究提供數(shù)據(jù)和參考。
【圖文】：

DNA革命的發(fā)展（引自Costaetal.,2010）

2圖 1.2 主要轉(zhuǎn)錄組技術(shù)工作流程示意圖（引自史碩博等，2010）EST 技術(shù)基于 mRNA 構(gòu)建的 cDNA 文庫，從中隨機挑取 cDNA 克隆，，對其 5’或 3’
【學(xué)位授予單位】：集美大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S917.4

【相似文獻】

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本文編號：2684486