【摘要】：大黃魚(yú)(Larimichthys crocea)是中國(guó)海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖量最大的重要經(jīng)濟(jì)物種之一,其生長(zhǎng)具有雌雄二態(tài)性,然而大黃魚(yú)性腺分化分子機(jī)制相關(guān)知識(shí)仍然匱乏,性腺分化過(guò)程中基因表達(dá)情況缺乏系統(tǒng)研究。因此,本文對(duì)不同發(fā)育階段的大黃魚(yú)雌雄性腺進(jìn)行分別測(cè)序,然后進(jìn)行比較分析。主要研究結(jié)果如下:1、取8月齡大黃魚(yú)雌雄性腺進(jìn)行RNA-Seq,初步考察轉(zhuǎn)錄組分析大黃魚(yú)性腺基因表達(dá)狀況的效率及可靠性。結(jié)果顯示,RNA-Seq共產(chǎn)生2.5億個(gè)平均125bp的原始讀段,經(jīng)質(zhì)控、拼接,獲得77405個(gè)平均長(zhǎng)度為896bp的轉(zhuǎn)錄本,其中雄性高表達(dá)基因13342個(gè),雌性高表達(dá)基因3573個(gè),雄性特異表達(dá)基因4713個(gè),雌性特異表達(dá)基因46個(gè)。差異基因的聚類(lèi)熱圖顯示,雌雄性腺間基因表達(dá)模式差異巨大,相同性別樣品間重復(fù)性好。用該數(shù)據(jù)庫(kù)查找了42個(gè)性別決定或分化相關(guān)基因的序列和表達(dá)量,并利用RT-PCR驗(yàn)證了其中12個(gè)基因,結(jié)果相符的有10個(gè)基因,不相符的有2個(gè)基因。2、取3月齡和18月齡大黃魚(yú)性腺進(jìn)行RNA-Seq,然后將數(shù)據(jù)對(duì)比到實(shí)驗(yàn)室獲得的基因組上,結(jié)合第一部分研究?jī)?nèi)容,分析大黃魚(yú)在各個(gè)發(fā)育階段性腺表達(dá)基因的表達(dá)水平,篩選性腺性別特異表達(dá)基因。3月齡測(cè)序數(shù)據(jù)注釋到21944個(gè)基因;8月齡測(cè)序數(shù)據(jù)注釋到21924個(gè)基因;18月齡測(cè)序數(shù)據(jù)注釋到19,659個(gè)基因。其中,在大黃魚(yú)3月齡性腺中,有68個(gè)基因在精巢中特異性表達(dá),157個(gè)基因在卵巢中特異性表達(dá),3910個(gè)基因共表達(dá);8月齡時(shí),有1959個(gè)基因在精巢中特異性表達(dá),45個(gè)基因在卵巢中特異性表達(dá),7480個(gè)基因共表達(dá);18月齡時(shí),有976個(gè)基因在精巢中特異性表達(dá),140個(gè)基因在卵巢中特異性表達(dá),7233個(gè)基因共表達(dá);將雌雄數(shù)據(jù)分別混合,發(fā)現(xiàn)仍然有13個(gè)基因在精巢中特異性表達(dá),8個(gè)基因在卵巢中特異性表達(dá),6773個(gè)基因共表達(dá)。將大黃魚(yú)雌雄性腺在不同發(fā)育階段中特異表達(dá)基因分別作統(tǒng)計(jì)分析,更好地觀測(cè)這些表達(dá)基因在每?jī)蓚�(gè)相鄰時(shí)期的變化。3、研究對(duì)大黃魚(yú)雌雄性腺發(fā)育的時(shí)序性,獲得表達(dá)基因在不同發(fā)育時(shí)期的數(shù)量變化。在雄性中,從3月齡到8月齡有2789個(gè)基因表達(dá)量上升,2944個(gè)基因表達(dá)量下降;從8月齡到18月齡有2436個(gè)基因表達(dá)量上升,共有2307個(gè)基因表達(dá)量下降。在雌性中,從3月齡到8月齡有716個(gè)基因表達(dá)量上升,5061個(gè)基因表達(dá)量下降;從8月齡到18月齡有584個(gè)基因表達(dá)量上升,共有247個(gè)基因表達(dá)量下降。本文為進(jìn)一步研究大黃魚(yú)的性別分化機(jī)制奠定基礎(chǔ),也為魚(yú)類(lèi)性別分化機(jī)制和進(jìn)化研究提供數(shù)據(jù)和參考。
【圖文】：

DNA革命的發(fā)展（引自Costaetal.,2010）

2圖 1.2 主要轉(zhuǎn)錄組技術(shù)工作流程示意圖（引自史碩博等，2010）EST 技術(shù)基于 mRNA 構(gòu)建的 cDNA 文庫(kù)，從中隨機(jī)挑取 cDNA 克隆，，對(duì)其 5’或 3’
【學(xué)位授予單位】：集美大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4

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本文編號(hào)：2684486