【摘要】：本研究對新疆高原鰍(鯉形目:鰍科)的線粒體全基因組進(jìn)行了測序和組裝,并結(jié)合鰍科其它魚類進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析。該線粒體基因組長度為16,590 bp,由13個(gè)蛋白質(zhì)基因,22個(gè)tRNA基因,2個(gè)rRNA基因和2個(gè)非編碼區(qū)組成。總的堿基含量A、T、C、G分別為28.26%、28.49%、25.42%和17.82%。除ND6和ND8 tRNA基因外,其它的編碼基因均位于重鏈。基于線粒體DNA序列和微衛(wèi)星DNA對采自伊犁河4個(gè)群體共112個(gè)個(gè)體的新疆高原鰍進(jìn)行了PCR擴(kuò)增和測序,進(jìn)而研究其群體遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示新疆高原鰍群體有高的基因型多樣性和中度的核苷酸多樣性,同時(shí)其遺傳多樣性也處于中度水平。經(jīng)測序后,發(fā)現(xiàn)179條序列含微衛(wèi)星位點(diǎn)。最后,設(shè)計(jì)的PCR引物中有52對成功擴(kuò)增出對應(yīng)位點(diǎn)的目的片段,其中8個(gè)位點(diǎn)顯示出多態(tài)性15個(gè)位點(diǎn)呈單態(tài)。本研究挑選8對熒光標(biāo)記的微衛(wèi)星引物對新疆高原鰍個(gè)體展開測序研究,等位基因數(shù)和多態(tài)信息含量(PIC)的變化范圍分別為8至25,0.41至0.92。中性檢驗(yàn)和不匹配分布分析證實(shí),新疆高原鰍可能經(jīng)歷了較晚的種群擴(kuò)張。遺傳分化分析表明,不同地區(qū)的群體間存在顯著的遺傳分化。分子方差(AMOVA)分析還顯示,遺傳多樣性主要表現(xiàn)在群體間。在本研究中,我們比較了兩種DNA標(biāo)記(四種線粒體DNA,16S,COI,COII和CR)和(微衛(wèi)星標(biāo)記)在評估新疆高原鰍的群體結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性時(shí)的效率。COII基因所呈現(xiàn)的遺傳多樣性表明其進(jìn)化速率比16S,COI和CR基因較低�？傊�,我們的研究結(jié)果表明使用線粒體DNA標(biāo)記和核DNA標(biāo)記來分析新疆高原鰍的遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性是非常有效的方法,而線粒體DNA中16S,COI和CR基因以及SSR標(biāo)記是比線粒體COII基因更好的DNA標(biāo)記。這項(xiàng)研究對于構(gòu)建有效的科學(xué)計(jì)劃來保護(hù)和長遠(yuǎn)發(fā)展新疆高原鰍的野生資源是必不可少的。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S917.4

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本文編號(hào)：2669061