發(fā)布時(shí)間：2020-05-04 19:37

【摘要】：為了探究目前我國(guó)鯉種質(zhì)資源現(xiàn)狀,了解不同鯉群體間的遺傳差異,進(jìn)而為鯉的良種選育奠定基礎(chǔ)。本文選取了我國(guó)4個(gè)野生鯉群體和2個(gè)人工選育鯉群體為研究對(duì)象,其中以野生清水江鯉群體為主要研究目標(biāo)。利用微衛(wèi)星標(biāo)記和D-loop序列變異,分別對(duì)6個(gè)鯉群體的遺傳多樣性及遺傳變異進(jìn)行分析。本文的主要研究結(jié)果如下:1.我國(guó)6個(gè)鯉群體的D-loop序列遺傳變異分析對(duì)4個(gè)野生鯉群體(太湖TH、清水江QSJ、黑龍江HLJ和黃河HH)和2個(gè)選育鯉群體(福瑞鯉FRL和松浦鯉SPL)共計(jì)185尾個(gè)體的D-loop區(qū)進(jìn)行遺傳變異分析。發(fā)現(xiàn)D-loop序列(931bp)中共存在36個(gè)變異位點(diǎn),27個(gè)單倍型;其中QSJ群體單倍型數(shù)最多;FRL和SPL群體分別存在1個(gè)優(yōu)勢(shì)單倍型,占有率為93%和80%。除了SPL群體與HLJ群體遺傳分化不顯著(P0.05),其余群體間均呈極顯著分化狀態(tài)(P0.01)。基于遺傳距離的NJ樹(shù)顯示,FRL和HH群體首先聚類,然后依次與其他鯉群體聚類。分子方差分析顯示,群體間遺傳變異極顯著(P0.01),占總變異的35.59%。Tajima's中性檢測(cè)發(fā)現(xiàn),僅FRL群體存在顯著的群體擴(kuò)增現(xiàn)象(P0.05)。研究結(jié)果表明:QSJ和TH群體具有較高的遺傳多樣性,推測(cè)具有進(jìn)一步選育利用的遺傳潛力;2個(gè)選育群體遺傳純度較高,其中FRL作為鯉的優(yōu)良養(yǎng)殖品種,在廣泛的推廣應(yīng)用中呈現(xiàn)群體擴(kuò)增現(xiàn)象。2.我國(guó)6個(gè)鯉群體的微衛(wèi)星遺傳變異分析利用14對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)以上6個(gè)鯉群體進(jìn)行遺傳分析。共檢測(cè)到374個(gè)等位基因。研究結(jié)果表明,選育群體的遺傳多樣性普遍低于野生群體,其中松浦鯉群體的遺傳多樣性參數(shù)平均值最低(平均等位基因數(shù)Na、表觀雜合度Ho、香農(nóng)指數(shù)I和多態(tài)信息含量PIC分別為3.77、0.457、0.88和0.397),清水江鯉群體的遺傳參數(shù)平均值最高(Na=20.07,Ho=0.799,I=2.65,PIC=0.889)。分子方差分析顯示:變異來(lái)源主要存在于群體內(nèi)部(91.49%);鯉群體兩兩間存在極顯著的遺傳分化(P0.01)。遺傳距離對(duì)比發(fā)現(xiàn),野生鯉群體和人工選育的鯉群體間遺傳距離最大,而且聚類圖表明,野生群體首先聚類再與人工選育群體依次聚類;遺傳結(jié)構(gòu)圖顯示選育群體的遺傳結(jié)構(gòu)相對(duì)單一。通過(guò)遺傳瓶頸效應(yīng)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),QSJ、TH、HHL和FRL群體顯著偏離突變-漂變平衡,推測(cè)這些群體近期可能經(jīng)歷了遺傳瓶頸,需要加強(qiáng)保護(hù)。3.清水江鯉形態(tài)差異和基于微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性分析對(duì)192尾清水江鯉的表型變異及分子遺傳信息進(jìn)行了分析。形態(tài)學(xué)分析發(fā)現(xiàn)試驗(yàn)個(gè)體的表型差異較大,各體態(tài)特征值存在不同程度的變異,其中體質(zhì)量的變異系數(shù)最大(38.0%);利用12對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)清水江鯉群體的遺傳多樣性進(jìn)行分析,研究發(fā)現(xiàn)12個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)介于5~21(均值為10),有效等位基因數(shù)介于3.62~15.25(均值為8.37),表觀雜合度介于0.24~0.91(均值為0.54),期望雜合度介于0.73~0.94(均值為0.86),多態(tài)性信息含量介于0.68~0.93(均值為0.84)。結(jié)果表明,清水江鯉群體表現(xiàn)出較高的遺傳多樣性水平。根據(jù)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果,依據(jù)遺傳來(lái)源將所有個(gè)體劃分為3個(gè)遺傳區(qū)組。對(duì)區(qū)組間的表型差異分析發(fā)現(xiàn),區(qū)組1與區(qū)組2在背鰭硬棘、側(cè)線鱗和側(cè)線上鱗等3性狀間存在顯著差異(P0.05),區(qū)組1與區(qū)組3之間在尾柄長(zhǎng)/體長(zhǎng)存在顯著差異(P0.05)。對(duì)3個(gè)區(qū)組的遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,清水江鯉群體內(nèi)部存在明顯的遺傳分化。故此,在對(duì)其種質(zhì)資源的保護(hù)和利用的過(guò)程中,應(yīng)當(dāng)引起重視,做好甄選提純工作。
【圖文】：

6 個(gè)鯉群體聚為 2 大支(圖2-1)。其中 1 支由福瑞鯉(FRL)、黃河鯉(HHL)首先聚類，再與清水江鯉(QSJ)和太湖(TH)群體依次聚類；另 1 支由黑龍江(HLJ)和松浦鯉(SPL)群體聚類而成。

圖 2-2 鯉魚(yú) mtDNAD-loop 區(qū) 27 個(gè)單倍型的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖Fig. 2-2 The haplotypes network of mtDNA D-loop region of C. carpio3 討論本研究中，鯉 D-loop 區(qū)堿基序列中 A+T 的含量為 66.2%，而 G+C 的含量為33.8%，結(jié)果與其他對(duì)鯉 D-loop 區(qū)序列研究結(jié)果相似[89,92,100]，符合脊椎動(dòng)物 mtDNA堿基的含量分布[109]。單倍型多樣性及核苷酸多樣性的值越大，則種群或群體的遺傳遺傳多樣性水平越高[110]。就整體而言，本研究 6 個(gè)鯉群體具有較高的單倍型多樣性水平(Hd=0.785)，而具有較低的核苷酸多樣性水平(π=0.0085)，這與在草魚(yú)[111]、淃[112]、真鯛[113]、刀鱭和湖鱭等的研究結(jié)果相似[114]；推測(cè)與單倍型多樣性相對(duì)核苷酸多樣性在短時(shí)間內(nèi)更容易積累有關(guān)[115]。通過(guò)遺傳多樣性對(duì)比發(fā)現(xiàn)，4 個(gè)野生鯉群體的遺傳多樣性水平較 2 個(gè)選育群體要高。這與梁宏偉等[100]對(duì) 2 種選育的紅鯉及長(zhǎng)江野鯉的多樣性對(duì)比分析結(jié)果一致。因?yàn)?mtDNA 遵循母系遺傳，推測(cè)選育群體從有限的原始群體中經(jīng)過(guò)多代人工選育
【學(xué)位授予單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S917.4

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本文編號(hào)：2648884