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微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)鯉的兩個(gè)育成品種遺傳背景分析和遺傳評(píng)價(jià)體系建立

發(fā)布時(shí)間:2020-04-29 20:03
【摘要】:在我國(guó)淡水養(yǎng)殖水產(chǎn)生物的品種中,鯉魚(yú)是養(yǎng)殖量最多、最集中的品種(品系),其中有些品種還可以作為我國(guó)獨(dú)特?fù)碛械酿B(yǎng)殖品種。鯉魚(yú)經(jīng)歷了長(zhǎng)期的人工選擇和嚴(yán)酷的自然選擇,這使得其在表型上表現(xiàn)出較高的多態(tài)性,且在生化遺傳上表現(xiàn)出較高的雜合性,同時(shí)在群體結(jié)構(gòu)上也具有較高的多態(tài)性。增加鯉魚(yú)雜交優(yōu)勢(shì)的利用,可以為鯉魚(yú)品種選育提供豐富的原始材料,降低對(duì)品種進(jìn)行穩(wěn)定選育時(shí)所帶來(lái)的難度。通過(guò)對(duì)鯉魚(yú)群體遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的研究,在生產(chǎn)上進(jìn)行分子標(biāo)記輔助育種,可以有效地保護(hù)鯉魚(yú)的種質(zhì)資源。同時(shí)開(kāi)發(fā)、完善種質(zhì)評(píng)價(jià)的各種遺傳指標(biāo),揭示種質(zhì)資源的特性、遺傳發(fā)育與進(jìn)化規(guī)律,最終達(dá)到對(duì)重要種質(zhì)資源的深度發(fā)掘和對(duì)育種成果的準(zhǔn)確客觀評(píng)價(jià)。以便促進(jìn)我國(guó)水產(chǎn)種業(yè)的能夠穩(wěn)定保持并且沿著健康可持續(xù)的路線進(jìn)行發(fā)展。利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)鯉新的育成品種---易捕鯉的遺傳背景進(jìn)行分析。研究表明:利用30對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記以96尾易捕鯉個(gè)體的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果將所得的基因型差異利用生物軟件對(duì)各種遺傳參數(shù)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示:在96尾易捕鯉個(gè)體中含有的等位基因總數(shù)達(dá)到了154個(gè),其中每個(gè)位點(diǎn)所檢測(cè)到的等位基因數(shù)范圍在3~9,有效等位基因數(shù)的平均值為4.0607;期望雜合度主要分布在0.5969~0.8710,平均值為0.7400;多態(tài)信息含量計(jì)算平均值為0.7022,主要分布在0.6280~0.8550,由此說(shuō)明此品種具有較豐富的遺傳多樣性;對(duì)此群體進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn),結(jié)果顯示現(xiàn)階段群體處于不平衡狀態(tài);平均固定系數(shù)為-0.0410,說(shuō)明該群體因受選擇壓力的影響存在雜合子過(guò)剩現(xiàn)象;并且檢測(cè)到群體在目前階段經(jīng)歷過(guò)了瓶頸效應(yīng);有效群體大小依連鎖不平衡方法進(jìn)行計(jì)算,結(jié)果為64.2。該研究表明此品種具有較高的遺傳異質(zhì)性和較大的選育空間,但由于人工選擇的作用,群體處于不平衡狀態(tài),對(duì)于品種長(zhǎng)期有效地發(fā)展將產(chǎn)生不利的影響,因而下一步選育工作的重點(diǎn)是:如何有效地對(duì)其保種策略進(jìn)行研究,以便維持其豐富的遺傳多樣性和優(yōu)良的經(jīng)濟(jì)性狀。選用50個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記檢測(cè)松浦鏡鯉F8的遺傳背景。結(jié)果表明:本研究從育成品種松浦鏡鯉F8代中隨機(jī)選取200尾個(gè)體,并且對(duì)所選取的所有個(gè)體進(jìn)行PIT標(biāo)記。在50對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記下對(duì)所選取個(gè)體的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢測(cè)。群體平均等位基因數(shù)(A)和有效等位基因數(shù)(Ae)分別為4.9600和2.4708,平均期望雜合度(He)值和多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.5141和0.4576,由此說(shuō)明該選育群體的遺傳多樣性的水平較高;通過(guò)對(duì)50個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn)的結(jié)果顯示:其中顯著或極顯著偏離平衡的位點(diǎn)有32個(gè),這可能是人工選擇壓力的結(jié)果;計(jì)算有效群體大小為22.5,瓶頸效應(yīng)檢查的結(jié)果是:近期內(nèi)群體可能經(jīng)歷了遺傳瓶頸。通過(guò)對(duì)松浦鏡鯉F8的遺傳變異進(jìn)行系統(tǒng)的研究,對(duì)該種群的遺傳結(jié)構(gòu)有了較深刻的了解,為松浦鏡鯉選育群體F8的進(jìn)一步繁育提供理論支持。利用微衛(wèi)星標(biāo)記研究3個(gè)鯉魚(yú)育成品種的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性,在樣本容量和標(biāo)記數(shù)上設(shè)置不同的梯度,分析各種遺傳參數(shù)變化趨勢(shì)。結(jié)果表明:3種育成品種遺傳多樣性參數(shù):平均有效等位基因數(shù)、平均期望雜合度、平均多態(tài)信息含量在樣本量50以上標(biāo)記數(shù)25以上時(shí)趨于穩(wěn)定。對(duì)于遺傳結(jié)構(gòu)有效群體大小的計(jì)算結(jié)果是:當(dāng)樣本量在60以上標(biāo)記數(shù)22以上時(shí)趨于穩(wěn)定。對(duì)一個(gè)群體進(jìn)行正確且有效的遺傳評(píng)價(jià)時(shí),所選樣本容量大小、標(biāo)記數(shù)量多少都有較大的影響,通過(guò)本研究建議用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)一個(gè)育成品種進(jìn)行有效的遺傳評(píng)價(jià)時(shí),樣本容量在60以上標(biāo)記數(shù)在25以上時(shí)較為合適。
【圖文】:

位點(diǎn),等位基因頻率,基因頻率,微衛(wèi)星位點(diǎn)


布在 0.6280~0.8550 的范圍之內(nèi),平均值為 0.7022。計(jì)算結(jié)果顯示:在本實(shí)驗(yàn)選取的微衛(wèi)星位點(diǎn)都是高度多態(tài)性(P≥0.5)的位點(diǎn)。通過(guò)計(jì)算等位基因頻率布可知,,96 尾個(gè)體 30 標(biāo)記中等位基因頻率在 0.0~0.3 所占比例較大,等位基率分布比例屬于非 L‖形狀(圖 2-2)。

等位基因頻率


HLJ1556 4 3.4556 0.8333 0.7143 0.0896 0.6930 -0.1727HLJ855 4 3.7825 0.7812 0.7395 0.0852 0.6960 -0.0620HLJ3850 4 3.6007 0.8021 0.7261 0.4151 0.6950 -0.1105HLJ3993 4 3.7848 0.8021 0.7396 0.0129 0.6630 -0.0901HLJ3617 4 3.2196 0.2917 0.6930 0.0000 0.6850 -0.5769HLJ3999 4 3.3820 0.6042 0.7080 0.0858 0.7370 0.1422HLJ2545 5 4.3730 0.7396 0.7754 0.1338 0.7620 0.0411HLJ2369 6 4.9642 0.8229 0.8027 0.0000 0.7020 -0.0305HLJ328 5 2.8823 0.5000 0.6565 0.0001 0.7140 0.2344HLJ392 5 4.0860 0.6771 0.7592 0.0000 0.6990 0.1035HLJ740 4 2.8493 0.4688 0.6524 0.0005 0.6350 0.2778HLJ690 5 3.9673 0.7396 0.7519 0.0157 0.7520 0.0112HLJ1115 5 4.7334 0.8542 0.7929 0.0004 0.7200 -0.0830HLJ1515 4 2.5725 0.7396 0.6145 0.1218 0.6440 -0.2099HLJ3554 5 3.9234 0.8854 0.7490 0.0000 0.7020 -0.1883HLJ3948 5 3.8336 0.9271 0.7430 0.0000 0.6860 -0.2543HLJ3954 4 3.5617 0.6979 0.7230 0.0431 0.6990 0.0296Average 5.133 4.0607 0.7035 0.7400 0.7022 -0.0410
【學(xué)位授予單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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3 陳萬(wàn)光;崔智峰;董彬;王慧;;應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記分析一個(gè)日本錦鯉人工養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年05期

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本文編號(hào):2644946

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