【摘要】：文蛤(Meretrix meretrix)是我國沿海廣泛分布的重要經(jīng)濟貝類,由于其肉嫩味鮮和營養(yǎng)豐富的特點,有“天下第一鮮”的美稱,深受國內(nèi)外消費者的歡迎,是我國大宗出口的鮮活水產(chǎn)品之一。目前文蛤良種培育采用傳統(tǒng)的選擇育種,為加快培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆性強的文蛤新品種,開展文蛤生長、發(fā)育等相關功能基因的生長調(diào)控機制的研究對開發(fā)分子標記輔助選擇育種技術具有重要意義,能加快縮短育種周期,促進文蛤養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。本研究依據(jù)文蛤轉(zhuǎn)錄組文庫注釋信息克隆了 3個生長相關基因:BMP2、BMP7和TGF-βR1基因,并對BMP2和BMP7基因的時空表達和生長相關性SNP位點進行了相關的研究,對TGF-βR1基因的外顯子篩選生長相關的SNP位點,這些工作為利用分子標記輔助育種技術培育優(yōu)質(zhì)的文蛤新品系提供理論基礎。研究結果如下:(1)MmBMP2基因cDNA全長為2641bp,開放閱讀框為1395bp,編碼464個氨基酸,具有信號肽,沒有跨膜區(qū)。MmBMP2蛋白含有一個結構域,為TGF-β超家族結構域(363Cys-464Arg)。氨基酸多重序列比對結果顯示,文蛤BMP2基因與櫛孔扇貝的同源性最高,為53.1%,與其它生物的同源性在43%～53%之間。在不同組織的表達結果顯示,MmBMP2基因在成體外套膜、水管、內(nèi)臟團、鰓、閉殼肌和斧足6個組織中都有不同程度的表達,其中外套膜的表達最高(P0.01),極顯著高于其他組織;在不同發(fā)育時期的表達結果顯示,MmBMP2基因在七個發(fā)育階段中也有不同程度的表達,在稚貝時期表達量最高(P0.05),顯著高于其他6個時期。兩個文蛤群體中,在MmBMP2基因外顯子區(qū)域發(fā)現(xiàn)了兩個共同的生長相關SNP位點(A726G和A732T),說明該基因可能與文蛤的生長存在一定相關性,可作為分子標記輔助育種的候選基因。(2)MmBMP7基因cDNA全長為3161bp,開放閱讀框為1257bp,編碼418個氨基酸,存在一個潛在的跨膜區(qū),含有一個結構域,為TGF-β超家族結構域(281Arg-418His)。氨基酸多重序列比對結果顯示,文蛤BMP7基因與合浦珠母貝的同源性最高,為58.7%,與其它生物的同源性在44.4%～57.6%之間。在不同組織的表達結果顯示,MmBMP7基因在六個組織(外套膜、水管、內(nèi)臟團、鰓、閉殼肌、和斧足)中都有不同程度的表達,其中外套膜的表達最高(P0.05),顯著高于其他組織;不同發(fā)育時期的表達結果顯示,MmBMP7基因在未受精卵、囊胚、原腸胚、擔輪幼蟲和稚貝期都高度表達(P0.05),猜測其可能參與幼蟲形態(tài)發(fā)生和貝殼的形成。在MmBMP7基因外顯子區(qū)域篩選SNP位點,發(fā)現(xiàn)JS群體中有2個SNP位點(C32T和G144A)與生長性狀呈顯著相關,但在WL2群體中,沒有發(fā)現(xiàn)與生長性狀相關的SNP位點。(3)TGF-βR1基因cDNA全長為2357bp,其中開放閱讀框為1542bp,編碼513個氨基酸。Smart預測該蛋白功能域的結果顯示,TGF-β R1蛋白含有兩個結構域,一個為Ⅰ型受體典型的GS結構域(177Ser-205I1e),另一個為S-TKc結構域(205I1e-493Leu)。氨基酸多重序列比對結果顯示,文蛤TGF-βR1基因與櫛孔扇貝的同源性最高,為63.08%,與其它生物的同源性在50.93%～62.65%之間。TGF-βRI基因外顯子區(qū)域篩選SNP位點,發(fā)現(xiàn)JS群體中有1個SNP位點(A427T)與生長性狀呈顯著相關,但在WL2群體中,沒有發(fā)現(xiàn)與生長性狀相關的SNP位點。
【圖文】：

上海海洋大學碩士學位論文TGF-β超家族受體基因并研究它們在早期斑馬魚胚胎發(fā)育中的作用，結果顯示這基因的過量表達都會嚴重影響斑馬魚背腹軸的發(fā)育，并且不同的基因會造成不程度的干擾，，猜測 TGF-β超家族受體基因在軟體動物早期胚胎發(fā)育中可能發(fā)揮重要作用[84-86]。在櫛孔扇貝中也同樣克隆了轉(zhuǎn)化生長因子-β I 型受體基因，發(fā)3' UTR 區(qū)有一個與生長相關的 SNP 位點[44]。

13圖 2-1 MmBMP2 基因 cDNA 全長序列和氨基酸序列預測-1 The full length of cDNA and deduced amino acid sequence of M起始密碼子、終止密碼子和加尾信號，*代表蛋白翻譯結束，下結構域，陰影部分代表信號肽rames represented the start codon, the stop codon and the polyadenypresents the end of the protein translation. The underlined part is TThe bold shaded part is the signal peptide of protein.
【學位授予單位】：上海海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：S917.4

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 蘇郁;張建芳;張子安;朱建福;李婷;王旭;陳繼良;王體惠;;TGF-β軸在骨巨細胞瘤中的表達[J];中國矯形外科雜志;2019年22期

2 趙帥;尹妮;;TGF-β1在糖尿病性視網(wǎng)膜病變中的作用[J];中南醫(yī)學科學雜志;2017年01期

3 程敏;鄭勇;陳衛(wèi)剛;康馨丹;張迪;徐麗紅;;外源性硫化氫對肝星狀細胞TGF-β_1表達的影響[J];山東醫(yī)藥;2017年08期

4 姜智馨;古麗;努爾古力·加尼木汗;阿地力·莫明;;新疆人群TGF-α基因多態(tài)性和非綜合征性唇腭裂風險易感性相關性研究[J];新疆醫(yī)科大學學報;2017年04期

5 徐偉莉;;TGF-β_1和VEGF在胃癌組織中的表達及臨床意義分析[J];醫(yī)藥論壇雜志;2017年01期

6 郭建橋;;PTEN與TGF-β在前列腺癌中的表達及其臨床意義[J];解放軍醫(yī)藥雜志;2016年11期

7 郭金葉;何士杰;;慢性肺源性心臟病患者血清TGF-β1水平的臨床意義[J];臨床醫(yī)學研究與實踐;2017年06期

8 王曉軍;茹甫毅;吳雙有;朱衛(wèi)民;田培軍;;COX-2、bFGF及TGFβ1在急性白血病中的表達及其臨床意義[J];臨床醫(yī)學研究與實踐;2017年07期

9 孫芳初;劉春秋;吳瓊;李國歡;張超;;血府逐瘀膠囊對肺癌患者放射性肺損傷血TGF-β_1影響的臨床研究[J];現(xiàn)代中西醫(yī)結合雜志;2017年12期

10 刁兵;張道友;;氯沙坦聯(lián)合骨化三醇對糖尿病腎病患者血清TGF-β1的影響[J];錦州醫(yī)科大學學報;2017年01期

相關會議論文 前10條

1 郭志軍;鄔鵬宇;;老年非小細胞肺癌患者血清TGF-β1水平的臨床意義[A];中國轉(zhuǎn)化醫(yī)學和整合醫(yī)學研討會（廣州站）論文綜合刊[C];2015年

2 劉曉霞;陳育民;李衛(wèi)霞;王奇志;王雪玲;陳劍華;;加味八珍湯對TGF-β1抑制的T淋巴細胞影響的體外研究[A];第十屆全國免疫學學術大會匯編[C];2015年

3 陳權;焦安欽;徐俊秀;袁泉;李玲;苗德光;陳則潤;;腎力康顆粒對系膜增生性腎小球腎炎患者TGF-β1與CTGF水平影響的臨床研究[A];第10屆全國中西醫(yī)結合腎臟病學術會議論文匯編[C];2009年

4 張�，�;劉占東;胡朝軍;張洋;馮雪;包書萌;張擁波;王得新;李永哲;;慢性疲勞綜合征患者外周血單個核細胞中TGF-β1 mRNA表達水平的研究[A];全國臨床免疫檢驗研討會暨第六屆全國臨床免疫學術會議論文匯編[C];2009年

5 張玉震;孫金龍;李猛;李相坤;王鵬;魏麟;;TGF-β1與慢性交通性腦積水形成機制研究進展[A];中華醫(yī)學會神經(jīng)外科學分會第九次學術會議論文匯編[C];2010年

6 郭健;徐國興;周真寶;宋曉晴;蘇志強;簡立輝;張文淑;;TGF-β_1在早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變發(fā)病機制中的作用研究[A];第十屆全國中西醫(yī)結合眼科學術會議暨第五屆海峽眼科學術交流會論文匯編[C];2011年

7 張玉震;孫金龍;李猛;李相坤;魏麟;孟祥靖;孔建新;劉廣存;郭建;崔友強;;TGF—β1與慢性交通性腦積水形成機制研究進展[A];2011中華醫(yī)學會神經(jīng)外科學學術會議論文匯編[C];2011年

8 李U

本文編號：2639633