利用2b-RAD (type IIB endonucleases restriction-site associated DNA)技術對糯玉米品種‘滬玉糯3號’及其親本進行簡化基因組測序。通過與玉米‘B73’參考基因組序列進行比對,在3個糯玉米樣品的共同測序標簽內篩選出20 498個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點,并基于RADtyping分型策略對它們進行基因型分型。對其中20 333個位于玉米10條染色體上的SNP位點的基因型進行分析,開發(fā)出6個可用于‘滬玉糯3號’品種特異性鑒定的SNP分子標記。

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【部分圖文】：

圖1 SNPs在糯玉米樣品中的分布

‘申W22’、‘申W48’和‘滬玉糯3號’在糯玉米10條染色體上無差異的SNP位點有6220個,差異SNP位點14113個(圖2-A)。各染色體上樣品間無差異SNP位點占樣品間差異SNP位點數(shù)的比例為31.13%～56.23%,平均比例為44.60%(圖2-B)。此外,‘滬玉....

圖2‘滬玉糯3號’及其親本的基因型分析

圖1SNPs在糯玉米樣品中的分布2.4‘滬玉糯3號’的品種特異性鑒定

圖3‘滬玉糯3號’品種特異性鑒定

經(jīng)重復性TouchdownPCR擴增驗證,本研究從19對AC-PCR引物中篩選出S1-1和S1-2、S2-1和S2-2、S3-1和S3-2、S4-1和S4-2、S5-1和S5-2、S6-1和S6-2共6對引物對在‘滬玉糯3號’及其親本間擴增出穩(wěn)定、清晰的差異條帶。這6對引物不僅....

本文編號：4027499