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丹參miR408前體序列的克隆及功能分析

發(fā)布時間:2024-12-11 05:51
  植物microRNAs(miRNAs)是一類長度為20-24 nt的非編碼小RNA,通過抑制mRNA的翻譯或者降解mRNA來調(diào)控靶基因的表達(dá)。miR408是由21個核苷酸組成的高度保守的miRNA分子,在多個物種中已有報道。研究表明,miR408在植物體內(nèi)可參與非生物脅迫應(yīng)答、維持銅離子平衡,miR408過表達(dá)的擬南芥幼苗其花青素含量是對照的7-8倍,說明miR408可能參與植物的次生代謝調(diào)控。丹參(Salvia miltiorrhiza Bunge),唇形科多年生藥用植物,其根是我國傳統(tǒng)大宗藥材,對心腦血管疾病、組織損傷、血脂升高等具有很好療效,被譽(yù)為“藥用模式植物”。目前關(guān)于丹參中miRNA的功能研究尚未見報道。本實(shí)驗(yàn)從丹參中克隆得到miR408前體序列,進(jìn)一步獲得該基因的過表達(dá)轉(zhuǎn)基因煙草及干涉轉(zhuǎn)基因丹參株系,以期對調(diào)控丹參次生代謝產(chǎn)物的生物學(xué)功能進(jìn)行初步研究。本實(shí)驗(yàn)的研究內(nèi)容與結(jié)果如下:1.基于丹參基因組Survey數(shù)據(jù)庫,從中搜索并通過PCR克隆得到長度為366 bp的miR408前體序列及長度為723 bp的上游啟動子區(qū),并將miR408的前體序列命名為Sm-MIR408。通過...

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-2?洲前體二級結(jié)構(gòu)預(yù)測??

圖2-2?洲前體二級結(jié)構(gòu)預(yù)測??

能為-75.00?kcal/mol,故能開多成穩(wěn)定的莖環(huán)結(jié)構(gòu),miR408/miR408*雙鏈結(jié)構(gòu)區(qū)分別??位于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的兩臂,miR408成熟序列(5'-AUGCACUGCCUCUUCCCUGGC-3')??位在于莖環(huán)結(jié)構(gòu)3’端(圖2-2箭頭所指位置)。??在。遥危翑(shù)據(jù)庫mi....


圖2-3miR408成熟序列堿基保守性分析

圖2-3miR408成熟序列堿基保守性分析

miR408的前體序列及成熟序列,分析丹參miR408和數(shù)據(jù)庫中所有植物??408成熟序列堿基保守性,結(jié)果如圖2-3所示,miR408家族具有很高的保守性,??9,?13,15,16,?19位上的堿基保守性最高,且丹參miR408的成熟序列??'-AUGCACUGCCUCUUCC....


圖2-5?見/(財在不同組織中的表達(dá)量??不同字母表示有顯著差異(P<〇.〇5)??Figure?2-5?Relative?expression?level?of?Sm-MIR408?in?different?plant?tissues??

圖2-5?見/(財在不同組織中的表達(dá)量??不同字母表示有顯著差異(P<〇.〇5)??Figure?2-5?Relative?expression?level?of?Sm-MIR408?in?different?plant?tissues??

?洲在不同器官的相對表達(dá)水平??運(yùn)用實(shí)時定量PCR方法檢測在丹參的根、莖、葉,花中表達(dá),結(jié)??果如圖2-5所示,5VW-M//W仰在不同組織中都有表達(dá)且表達(dá)量不同,在花中的表達(dá)??量最高,其次是葉、莖和根。??7?-I??—5?-??c??.2?b????4?-?T??^?1??....


圖3-3不同處理?xiàng)l件下加-M/T^仍的表達(dá)變化??不同字母表示有顯著差異(p<〇.〇5)??A:?500?umol/L?MeJA?B:機(jī)械損傷??C:光?

圖3-3不同處理?xiàng)l件下加-M/T^仍的表達(dá)變化??不同字母表示有顯著差異(p<〇.〇5)??A:?500?umol/L?MeJA?B:機(jī)械損傷??C:光?

用500umol/L茉莉酸甲酯(methyljamsonateMeJA)處理丹參植株,lh后表達(dá)量??開始降低,在8?h達(dá)到最低值,表達(dá)量僅為對照的10%,之后升高,在24?h其表達(dá)量??與對照沒有顯著性差異(圖3-3A);機(jī)械損傷處理1?h后加-M/M^表達(dá)量最低,為對??照的....



本文編號:4016288

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