作物的早熟性是一個復(fù)雜的數(shù)量性狀,而早花是陸地棉早熟性的一個重要標(biāo)志。本研究采用早熟品種魯棉研19號和中熟品種魯棉研37號進行雜交,構(gòu)建了F₂和F_2:3分離群體,對現(xiàn)蕾和開花性狀進行了分析,并從F₂群體中選擇極早和極晚開花的單株分別組建了兩個極端池,采用高通量測序技術(shù)對親本和兩個極端池進行全基因組重測序,利用鑒定篩選的SNP和In Del標(biāo)記及已報道的早熟相關(guān)SSR標(biāo)記構(gòu)建了遺傳圖譜,對早熟性相關(guān)QTLs進行了精細定位,進一步確定了相關(guān)候選基因。主要結(jié)論如下:1、正常春播條件下,魯棉研19號的開花時間比魯棉研37號提前9-10d,播種至現(xiàn)蕾和播種至開花天數(shù)在F_2:3分離群體呈正態(tài)分布,表明棉花早熟性狀是由多基因控制的數(shù)量性狀。2、采用BSA-seq方法對魯棉研19號、魯棉研37號以及早花池和晚花池進行了重測序,每個樣本的檢測指標(biāo)均為Q20≥92.55%、Q30≥85.22%,GC含量分布正常。以魯棉研37號為參考親本,對早花池和晚花池的測序結(jié)果進行比對,篩選SNP、InDel,運用QTL-seq方法分...

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1BSA測序原理Fig2.1TheprincipleofBSAsequencing圖2.2建庫測序流程Fig2.2Libraryconstructionandsequencingprocess

19圖2.2建庫測序流程Fig2.2Libraryconstructionandsequencingprocess.1.5.1QTL-seq分析作為一種重要的分析方法，BSA借助于高通量的發(fā)展逐步形成一種新的方：QTL-seq[118]。QTL-seq是一種....

選擇親本P1作為參考親本，計算兩個子代在P-index（即SNP的頻率）。SNP-index計算方法如圖2.1所相比較與其相同的記為0，不同的記為1。制兩個極端池的SNP-index圖：將計算出早花池和別以1Mb為單位窗口，以滑動窗口大小為1kb來計....

24圖2.4F2和F2:3群體單株現(xiàn)蕾和開花天數(shù)的次數(shù)分布Fig2.4FrequencydistributionofsquaringandfloweringdaysinF2andF2:3generation注：a:F2群體的播種-開花(FT)的次數(shù)分....

本文編號：4008514