利用SSR、SFP、InDel和ILP標記對水稻品種進行通用性分析,明確其PCR擴增的有效性和多態(tài)性,以期為分子標記輔助選擇的應(yīng)用效果評價奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明:選用1 678對標記對TY和CO39進行PCR擴增,有擴增產(chǎn)物的標記為1 578對,擴增產(chǎn)物率為94.04%,其中,兩親本間共檢測到133對多態(tài)標記,多態(tài)檢出率為10.34%。4種分子標記間比較發(fā)現(xiàn),SSR標記具有數(shù)量多、染色體覆蓋度廣等特點,而ILP標記的多態(tài)檢出率最高,達28.90%,分別是SSR、SFP和In Del標記的2.79、4.77、1.47倍。因此,在水稻育種實踐中,將SSR和ILP標記結(jié)合用于基因型篩選,可以提高選擇效率,加快育種進程。

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圖1SSR,SFP,InDel和ILP多態(tài)標記在水稻染色體上的分布

SSR、SFP、InDel、ILP標記及其序列信息分別參考Mccouch等(2002)、Edwards等(2008)、Shen等(2004)、Wang等(2005)的研究。所有標記均由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成，用滅菌ddH2O溶解，-20℃保存?zhèn)溆�。PCR擴增方法參考陳桂華等....

圖2SSR(A),SFP(B),InDel(C)和ILP(D)標記對TY和CO39的擴增帶型

圖1SSR,SFP,InDel和ILP多態(tài)標記在水稻染色體上的分布3.4數(shù)據(jù)分析

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