發(fā)布時(shí)間：2024-03-29 20:30

　　無(wú)芒隱子草(Cleistogenes songorica)屬于禾本科隱子草屬,是荒漠草地旱生種,為荒漠草原的建群種和優(yōu)勢(shì)種。它具有飼用價(jià)值高、耐寒、耐旱等優(yōu)良特性,可作為飼草、草坪草和生態(tài)草。目前,在無(wú)芒隱子草中還沒(méi)有大規(guī)模開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記的報(bào)道,限制了無(wú)芒隱子草分子生物學(xué)研究與育種工作。本研究在全基因組水平開(kāi)發(fā)了高效的無(wú)芒隱子草內(nèi)含子長(zhǎng)度多態(tài)性(Intron Length Polymorphism,ILP)分子標(biāo)記,并驗(yàn)證了無(wú)芒隱子草ILP(Cs_ILP)標(biāo)記在其他物種中的通用性,為無(wú)芒隱子草的分子標(biāo)記輔助育種、居群遺傳學(xué)研究等工作奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.從無(wú)芒隱子草全基因組中檢索出220,165個(gè)內(nèi)含子,其中有181,681個(gè)內(nèi)含子可以注釋到27,314個(gè)基因,并定位到無(wú)芒隱子草的20對(duì)染色體上。對(duì)這些基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,有20,503個(gè)基因被注釋到了GO數(shù)據(jù)庫(kù),9,604個(gè)基因被注釋到KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)。根據(jù)檢索出的內(nèi)含子序列,設(shè)計(jì)了91,170對(duì)Cs_ILP標(biāo)記引物。共有84,635個(gè)Cs_ILP標(biāo)記可以定位到染...

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1CsILP分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和利用技術(shù)路線

蘭州大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文無(wú)芒隱子草全基因組水平內(nèi)含子長(zhǎng)度多態(tài)性（ILP）分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用（1）根據(jù)無(wú)芒隱子草基因組數(shù)據(jù)鑒定含有內(nèi)含子的基因信息，進(jìn)行生物信息學(xué)分析。根據(jù)內(nèi)含子信息設(shè)計(jì)Cs_ILP標(biāo)記，并從中初步挑選高效標(biāo)記；（2）利用高效Cs_ILP標(biāo)記對(duì)隱子草居....

圖3-1CsILP標(biāo)記引物設(shè)計(jì)流程圖

圖3-1Cs_ILP標(biāo)記引物設(shè)計(jì)流程圖Fig.3-1ThedesignflowchartofCs_ILPmarkerprimers3.2.3生物信息學(xué)分析根據(jù)無(wú)芒隱子草全基因組數(shù)據(jù)，將本實(shí)驗(yàn)中用于設(shè)計(jì)無(wú)芒隱子草ILP引物的基因及內(nèi)含子進(jìn)行生物信息學(xué)分析。....

圖3-2部分隱子草基因組DNA在2%的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果

論文用“ggplot2內(nèi)的11，計(jì)算結(jié)果用無(wú)根進(jìn)化樹(shù)狀圖表示析結(jié)果，隱子草基因組凈，蛋白質(zhì)污染少。DNA0的平均值為無(wú)芒隱子草全基因組水平內(nèi)含子長(zhǎng)度多態(tài)性（IL”軟件包繪制主成分分析二維圖種植物中的轉(zhuǎn)移率。使用NTSYSpc，計(jì)算結(jié)果用無(wú)根進(jìn)化樹(shù)狀圖表示（RohlDNA在....

圖3-3無(wú)芒隱子草染色體上已開(kāi)發(fā)的CsILP標(biāo)記區(qū)域的位置分布圖

圖3-3無(wú)芒隱子草染色體上已開(kāi)發(fā)的Cs_ILP標(biāo)記區(qū)域的位置分布圖Fig.3-3DistributionofthedevelopedCs_ILPmarkersontheC.songoricachromosomes為了評(píng)估ILP引物相關(guān)基因的潛在功能，....

本文編號(hào)：3941260