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玉米C型細胞質雄性不育花粉敗育相關microRNA鑒定分析

發(fā)布時間:2024-03-24 01:22
  細胞質雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)在多種植物中發(fā)現并廣泛應用于植物雜交種子生產。miRNA作為植物體內一類重要的調控因子,幾乎參與植物生長發(fā)育的各個組織、各個時期,研究表明一些miRNA在植物花粉中大量存在,預示著這些miRNA可能與植物花發(fā)育相關,也很可能參與調控植物育性。但有關育性相關miRNA報道多數存在于模式植物如擬南芥、水稻等,而對玉米育性相關尤其玉米C型胞質雄性不育相關miRNA的分析研究報道甚少。本研究通過Hi-Seq高通量測序技術對玉米細胞質雄性不育系C48-2及其保持系N48-2花粉母細胞時期及單核期花藥中顯著差異表達的miRNA并作初步功能分析,以期尋找與育性相關miRNA。同時對挖掘到的可能與育性相關的miRNA作進一步靶基因預測分析,初步探討本實驗預測到的miRNA可能參與的生物學過程,F將本實驗的主要研究結果歸納如下:1.對兩個材料兩個時期構建的sRNAs文庫進行Hi-Seq高通量測序分析共獲得321個已知miRNA,屬29個miRNA家族;并通過進一步分析,獲得724個新的miRNA。2.生物信息學分析發(fā)現保持系N...

【文章頁數】:97 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-2不同組織中miRMA與其靶基因的調控關系(JinDFetal.,2013)??Fig2-2?The?regulatory?relationship?between?miRNAs?and?their?targets?(Jin?DF?et?al.,2013)??調控植物環(huán)境適應性自發(fā)現miR398靶基因197]與耐逆性有關,大量證據證實植??物miRNA參與響應生物脅迫或非生物脅迫過程[96]

圖2-2不同組織中miRMA與其靶基因的調控關系(JinDFetal.,2013)??Fig2-2?The?regulatory?relationship?between?miRNAs?and?their?targets?(Jin?DF?et?al.,2013)??調控植物環(huán)境適應性自發(fā)現miR398靶基因197]與耐逆性有關,大量證據證實植??物miRNA參與響應生物脅迫或非生物脅迫過程[96]

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圖4-1小RNA建庫流程??Fig4-1?Small?RNA?sequence?library?construction??

保持系N48-2花粉母細胞時期記為NM,單核期記為NU。提取樣品總RNA,使用??PAGE膠分離不同片段大小的RNA。切取18-30nt之間的條帶,回收SmallRNA。??構建4個。遥危廖膸,建庫流程如圖(圖4-1)??19??


圖5-1?sRNAs長度分布圖??Fig5-1?The?length?distribution?of?sRNAs??

圖5-1?sRNAs長度分布圖??Fig5-1?The?length?distribution?of?sRNAs??

對于18-30nt的sRNAs長度分布(圖5-1)進行分析發(fā)現大多sRNA長度分布在??21-24nt之間,與前人的研究類似,其中24nt占大多數,依次是22nt,21nt和23nt。??Length?Distribution??70%?-i???^?60%?■-=???|50%....


圖5-2?miRNA首位堿基偏好性分布??Fig5-2?The?distribution?of?the?first?base?bias?of?miRNA??33??

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對于18-30nt的sRNAs長度分布(圖5-1)進行分析發(fā)現大多sRNA長度分布在??21-24nt之間,與前人的研究類似,其中24nt占大多數,依次是22nt,21nt和23nt。??Length?Distribution??70%?-i???^?60%?■-=???|50%....



本文編號:3936756

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