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水稻種質(zhì)資源外觀和加工品質(zhì)的全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2024-03-23 11:49
  水稻是我國第一大糧食作物,隨著人們生活水平的日益提高,優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)已經(jīng)成為國內(nèi)外水稻育種的重要目標。稻米外觀與加工品質(zhì)性狀是典型的數(shù)量性狀,由多基因控制并且受環(huán)境影響。迄今利用不同定位群體和定位方法,一些重要的控制稻米外觀與加工品質(zhì)及其相關(guān)性狀的位點和基因已經(jīng)被克隆,然而真正應用到育種實踐的位點或基因較少。起源于不同地域的種質(zhì)資源中往往蘊藏著大量有利等位基因,基于變異豐富的種質(zhì)資源的全基因組關(guān)聯(lián)分析是當前有利基因挖掘方面熱門方法,但該方法在稻米外觀和加工品質(zhì)性狀上的研究尚不多。本研究以732份遺傳變異豐富的水稻種質(zhì)資源(來自3000份水稻重測序項目)為試驗材料,在2個環(huán)境(海南三亞、廣東深圳)下考察8個水稻外觀與加工品質(zhì)(粒長、粒寬、長寬比、堊白粒率、堊白度、糙米率、精米率和整精米率)的表型,結(jié)合全基因組分布的404 K高質(zhì)量SNP全基因組關(guān)聯(lián)分析,挖掘控制稻米外觀和加工品質(zhì)的關(guān)鍵位點,探討控制稻米外觀和加工品質(zhì)的遺傳機制,以期為通過分子途徑加速培育優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)水稻新品種提供指導信息。主要結(jié)論如下:1.試驗材料起源地多樣化,表型變異豐富。732份材料共來自56個國家或地區(qū)。在海南,表型范圍分別...

【文章頁數(shù)】:52 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線

圖1基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線

圖1基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線Fig.1Theframeworkofassociationanalysisbasedoncandidate-genetesting


圖2基于全基因組的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線

圖2基于全基因組的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線

6圖2基于全基因組的關(guān)聯(lián)分析技術(shù)路線Fig.2Theframeworkofassociationanalysisbasedongenomescan


圖4水稻種質(zhì)資源分類Fig.4Classificationofriceaccessionsintofivedistinctvarietalgroups注:系統(tǒng)進化樹引自http://gigascience.biomedcentral.com/Data:TheTreecomefromhttp://gigascience.biomedcentral.com/

圖4水稻種質(zhì)資源分類Fig.4Classificationofriceaccessionsintofivedistinctvarietalgroups注:系統(tǒng)進化樹引自http://gigascience.biomedcentral.com/Data:TheTreecomefromhttp://gigascience.biomedcentral.com/

圖4水稻種質(zhì)資源分類Fig.4Classificationofriceaccessionsintofivedistinctvarietalgroups注:系統(tǒng)進化樹引自http://gigascience.biomedcentral.com/Data:....


圖5秈稻亞群加工品質(zhì)性狀的曼哈頓散點圖

圖5秈稻亞群加工品質(zhì)性狀的曼哈頓散點圖

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本文編號:3935875

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