葉綠素是植物形成產(chǎn)量的重要因子。為了探究吐絲期葉綠素的遺傳機(jī)理和代謝機(jī)制,本研究以榆林、楊凌兩地126份玉米自交系為材料,采用全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法將簡(jiǎn)化基因組測(cè)序填充過(guò)濾篩選后得到31 561個(gè)SNP (Single nucleotide polymorphism)標(biāo)記,結(jié)合葉綠素指數(shù)SPAD (Soil and plant analyzer develotrnent)值以及BLUP (Best linear unbiased prediction)值進(jìn)行分析,共檢測(cè)到37個(gè)顯著性關(guān)聯(lián)SNP標(biāo)記;在LD (Linkage disequilibrium)衰退有效距離上下150 kb內(nèi)檢測(cè)到201個(gè)候選基因,進(jìn)一步進(jìn)行GO富集注釋和分析,將葉綠素相關(guān)候選基因主要錨定在過(guò)氧化氫代謝過(guò)程、受體活性、活性氧代謝過(guò)程和氮化合物代謝過(guò)程的負(fù)調(diào)控等18個(gè)代謝途徑上。本研究進(jìn)一步探究了葉綠素相關(guān)代謝遺傳機(jī)理,對(duì)高光效育種和提高作物產(chǎn)量有重要意義。

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圖1AM126SPAD值頻率分布

為了更好地分析葉綠素指數(shù)的代謝基礎(chǔ)，對(duì)37個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)置信區(qū)間的候選基因進(jìn)行基因搜索，共得到201個(gè)候選基因(表5)。用AgriGOV2.0對(duì)所在的201個(gè)候選基因進(jìn)行功能注釋?zhuān)凑誴≤0.05標(biāo)準(zhǔn)，篩選出18個(gè)富集程度較好的生物途徑，包括5個(gè)分子功能：分子換能器活性、受體活性....

圖2AM126葉綠素指數(shù)全基因組關(guān)聯(lián)分析曼哈頓和分位數(shù)-分位數(shù)圖(QQ圖)

前人利用經(jīng)典遺傳分析法定位了自然條件下不同生育期葉綠素QTL(王愛(ài)玉和張春慶,2008;譒imicetal.,2014)、不同處理下葉綠素QTL(Hundetal.,2004;Caietal.,2012)和不同處理下不同部位葉片QTL(Chanetal.,2....

本文編號(hào)：3912093