蛋白磷酸酶和蛋白激酶對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行的可逆磷酸化催化作用是真核生物中信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要機(jī)制之一。蔗糖非發(fā)酵相關(guān)蛋白激酶(sucrose non-fermenting-1-related protein kinase,Sn RK)是一類在植物中廣泛存在的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,都包含一個(gè)典型的Ser-Thr激酶催化結(jié)構(gòu)域。擬南芥中,Sn RK基因家族分為三個(gè)亞組:Sn RK1、Sn RK2和Sn RK3,它們是擬南芥糖信號(hào)傳導(dǎo)、脅迫反應(yīng)、幼苗生長(zhǎng)和種子萌發(fā)等生物過程的關(guān)鍵激酶。Sn RK蛋白激酶是協(xié)調(diào)細(xì)胞適應(yīng)營(yíng)養(yǎng)和能量狀況變化的中心樞紐,而且在代謝調(diào)節(jié)中具有核心作用。甘藍(lán)型油菜是世界上重要的油料作物,其種子含有大量油脂,具有工業(yè)和食用價(jià)值。為了提高對(duì)油菜油脂代謝相關(guān)基因的認(rèn)知,發(fā)掘新的功能基因,我們對(duì)甘藍(lán)型油菜Sn RK基因家族進(jìn)行了系統(tǒng)分析,獲得了92個(gè)潛在Sn RK基因的基本信息,并通過候選基因關(guān)聯(lián)分析篩選與油菜種子含油量相關(guān)的家族成員,最后利用qRT-PCR對(duì)這些基因進(jìn)行表達(dá)量分析。主要結(jié)果如下。(1)在甘藍(lán)型油菜中共鑒定出92個(gè)SnRK(Brassica napus sucrose no...

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 SnRK基因家族研究進(jìn)展
        1.1.1 SnRK結(jié)構(gòu)
        1.1.2 SnRK功能
        1.1.3 十字花科SnRK的進(jìn)化
    1.2 油脂合成與種子含油量
        1.2.1 十字花科種子油脂合成
        1.2.2 SnRKs對(duì)油脂含量的影響
    1.3 關(guān)聯(lián)分析
        1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的兩種基本方法和模型發(fā)展
        1.3.2 候選基因關(guān)聯(lián)分析在植物中應(yīng)用
    1.4 本研究的目的和意義
2 材料和方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 BnSnRK基因家族成員的鑒定和蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
        2.2.2 序列比對(duì)和進(jìn)化樹構(gòu)建
        2.2.3 基因結(jié)構(gòu)和氨基酸序列保守基序的分析
        2.2.4 SnRK基因家族與含油量性狀的關(guān)聯(lián)分析
            2.2.4.1 表型數(shù)據(jù)的篩選
            2.2.4.2 SNP標(biāo)記的選擇
            2.2.4.3 群體結(jié)構(gòu)分析
            2.2.4.4 親緣關(guān)系分析
            2.2.4.5 關(guān)聯(lián)分析
            2.2.4.6 含油量關(guān)聯(lián)基因單倍型分析
        2.2.5 基因家族成員在染色體上的分布和共線性分析
        2.2.6 富集分析
        2.2.7 qRT-PCR
3 結(jié)果與分析
    3.1 甘藍(lán)型油菜SnRK基因家族成員鑒定及理化性質(zhì)分析
    3.2 序列比對(duì)和進(jìn)化樹分析
    3.3 BnSnRK基因家族結(jié)構(gòu)和保守基序分析
    3.4 BnSnRK與含油量性狀的關(guān)聯(lián)分析
        3.4.1 關(guān)聯(lián)群體的表型數(shù)據(jù)
        3.4.2 模型選擇
        3.4.3 重復(fù)檢測(cè)的SNP及其對(duì)應(yīng)的基因
            3.4.3.1 單倍型分析
            3.4.3.2 環(huán)境對(duì)含油量相關(guān)候選基因的影響
            3.4.3.3 油脂組分關(guān)聯(lián)分析
    3.5 表達(dá)量分析
    3.6 BnSnRK基因家族的同源共線性分析
        3.6.1 BnSnRK在染色體上的位置及共線性分析
        3.6.2 近緣物種間的共線性
4 討論
    4.1 甘藍(lán)型油菜SnRK不同亞族間的比較
    4.2 BnSnRK的進(jìn)化分析
    4.3 BnSnRK與油菜種子含油量
    4.4 主要研究結(jié)果與進(jìn)一步研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄
    附錄1 qRT-PCR引物
    附錄2 甘藍(lán)型油菜中SnRK基因
    附錄3 關(guān)聯(lián)分析所用材料
    附錄4 關(guān)聯(lián)群體的表型統(tǒng)計(jì)描述
    附錄5 重復(fù)檢測(cè)到的油脂組分關(guān)聯(lián)位點(diǎn)
    附錄6 SnRK基因家族染色體位置分布圖
致謝



本文編號(hào)：3884967