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基于matK+rbcL條形碼與RAPD分子標(biāo)記方法的青海唐古特大黃遺傳多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2023-11-02 19:22
  唐古特大黃,蓼科大黃屬多年生高大草本植物,野生資源主要分布于平均海拔3000-4000 m以上的果洛地區(qū)。近年來(lái)因市場(chǎng)需求量過(guò)大,野生資源過(guò)度采挖,生境破碎化趨于嚴(yán)重,唐古特大黃野生資源已處于易危等級(jí)。本研究利用matK+rbc L條形碼和RAPD分子標(biāo)記分析了唐古特大黃遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)等特征,得到以下結(jié)論:1.基于高通量測(cè)序技術(shù)構(gòu)建唐古特大黃葉綠體全基因組圖譜,唐古特大黃葉綠體全基因組長(zhǎng)為161 054 bp,包括長(zhǎng)為86 441 bp的大單拷貝區(qū)(LSC),長(zhǎng)為12745 bp的小單拷貝區(qū)(SSC)和長(zhǎng)均為30 934 bp的反向重復(fù)序列A(IRA)和反向重復(fù)序列B(IRB)。唐古特大黃葉綠體全基因組共包含164個(gè)基因,分為111個(gè)蛋白編碼基因,45個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因,8個(gè)核糖體RNA基因三類(lèi)。2.從唐古特大黃葉綠體全基因組中挑選matK+rbcL聯(lián)合條形碼對(duì)唐古特大黃36個(gè)種群180個(gè)個(gè)體進(jìn)行分析,得到1 634 bp片段長(zhǎng)度,共產(chǎn)生10種單倍型,民和峽門(mén)3種群(MH XM3)單倍型多樣性最高,大通樺林鎮(zhèn)(DT HLZ)、互助五峰(HZ WF)等25個(gè)種群倍型多樣性最低。AMO...

【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 遺傳多樣性
        1.1.1 遺傳多樣性的概念
        1.1.2 遺傳多樣性的檢測(cè)方法
        1.1.3 遺傳多樣性的研究意義
    1.2 唐古特大黃研究進(jìn)展
        1.2.1 唐古特大黃簡(jiǎn)介
        1.2.2 唐古特大黃化學(xué)成分研究
        1.2.3 唐古特大黃藥理作用研究
        1.2.4 唐古特大黃分子生物學(xué)研究
    1.3 研究目的及意義
    1.4 研究方案及技術(shù)路線(xiàn)
第二章 唐古特大黃葉綠體全基因組
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 DNA提取
        2.1.3 測(cè)序和序列拼接
        2.1.4 基因組序列注釋
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 總DNA提取
        2.2.2 唐古特大黃葉綠體基因大小
        2.2.3 唐古特大黃葉綠體基因注釋、基因功能及分類(lèi)
    2.3 討論
第三章 基于matK+rbcL條形碼對(duì)唐古特大黃遺傳多樣性的研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 樣品采集與處理
        3.1.2 器材
        3.1.3 試劑與溶液配制
        3.1.4 DNA提取
        3.1.5 PCR擴(kuò)增
        3.1.6 總DNA、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)及測(cè)序
        3.1.7 數(shù)據(jù)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 總DNA提取
        3.2.2 PCR擴(kuò)增
        3.2.3 序列特征及單倍型分布
        3.2.4 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
        3.2.5 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.2.6 單倍型進(jìn)化關(guān)系
        3.2.7 唐古特大黃進(jìn)化動(dòng)態(tài)
    3.3 討論
        3.3.1 唐古特大黃DNA提取
        3.3.2 唐古特大黃PCR擴(kuò)增
        3.3.3 唐古特大黃單倍型特征分析
        3.3.4 唐古特大黃的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)
        3.3.5 唐古特大黃的系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化
第四章 基于RAPD對(duì)唐古特大黃遺傳多樣性的研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 樣品采集與處理
        4.1.2 試劑與器材
        4.1.3 DNA提取
        4.1.4 PCR擴(kuò)增
        4.1.5 數(shù)據(jù)分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 總DNA提取
        4.2.2 PCR擴(kuò)增
        4.2.3 擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性
        4.2.4 遺傳多樣性分析
        4.2.5 遺傳結(jié)構(gòu)與分化
        4.2.6 聚類(lèi)分析
    4.3 討論
        4.3.1 RAPD法DNA擴(kuò)增
        4.3.2 遺傳多樣性分析和遺傳結(jié)構(gòu)
        4.3.3 系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化
第五章 總結(jié)與展望
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 保護(hù)唐古特大黃物種的啟示
    5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
碩士期間主要研究成果



本文編號(hào):3859607

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