基于matK+rbcL條形碼與RAPD分子標(biāo)記方法的青海唐古特大黃遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2023-11-02 19:22
唐古特大黃,蓼科大黃屬多年生高大草本植物,野生資源主要分布于平均海拔3000-4000 m以上的果洛地區(qū)。近年來因市場需求量過大,野生資源過度采挖,生境破碎化趨于嚴(yán)重,唐古特大黃野生資源已處于易危等級。本研究利用matK+rbc L條形碼和RAPD分子標(biāo)記分析了唐古特大黃遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)等特征,得到以下結(jié)論:1.基于高通量測序技術(shù)構(gòu)建唐古特大黃葉綠體全基因組圖譜,唐古特大黃葉綠體全基因組長為161 054 bp,包括長為86 441 bp的大單拷貝區(qū)(LSC),長為12745 bp的小單拷貝區(qū)(SSC)和長均為30 934 bp的反向重復(fù)序列A(IRA)和反向重復(fù)序列B(IRB)。唐古特大黃葉綠體全基因組共包含164個基因,分為111個蛋白編碼基因,45個轉(zhuǎn)運RNA基因,8個核糖體RNA基因三類。2.從唐古特大黃葉綠體全基因組中挑選matK+rbcL聯(lián)合條形碼對唐古特大黃36個種群180個個體進(jìn)行分析,得到1 634 bp片段長度,共產(chǎn)生10種單倍型,民和峽門3種群(MH XM3)單倍型多樣性最高,大通樺林鎮(zhèn)(DT HLZ)、互助五峰(HZ WF)等25個種群倍型多樣性最低。AMO...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 遺傳多樣性
1.1.1 遺傳多樣性的概念
1.1.2 遺傳多樣性的檢測方法
1.1.3 遺傳多樣性的研究意義
1.2 唐古特大黃研究進(jìn)展
1.2.1 唐古特大黃簡介
1.2.2 唐古特大黃化學(xué)成分研究
1.2.3 唐古特大黃藥理作用研究
1.2.4 唐古特大黃分子生物學(xué)研究
1.3 研究目的及意義
1.4 研究方案及技術(shù)路線
第二章 唐古特大黃葉綠體全基因組
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 測序和序列拼接
2.1.4 基因組序列注釋
2.2 結(jié)果
2.2.1 總DNA提取
2.2.2 唐古特大黃葉綠體基因大小
2.2.3 唐古特大黃葉綠體基因注釋、基因功能及分類
2.3 討論
第三章 基于matK+rbcL條形碼對唐古特大黃遺傳多樣性的研究
3.1 材料與方法
3.1.1 樣品采集與處理
3.1.2 器材
3.1.3 試劑與溶液配制
3.1.4 DNA提取
3.1.5 PCR擴增
3.1.6 總DNA、PCR擴增產(chǎn)物檢測及測序
3.1.7 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 總DNA提取
3.2.2 PCR擴增
3.2.3 序列特征及單倍型分布
3.2.4 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
3.2.5 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.6 單倍型進(jìn)化關(guān)系
3.2.7 唐古特大黃進(jìn)化動態(tài)
3.3 討論
3.3.1 唐古特大黃DNA提取
3.3.2 唐古特大黃PCR擴增
3.3.3 唐古特大黃單倍型特征分析
3.3.4 唐古特大黃的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)
3.3.5 唐古特大黃的系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化
第四章 基于RAPD對唐古特大黃遺傳多樣性的研究
4.1 材料與方法
4.1.1 樣品采集與處理
4.1.2 試劑與器材
4.1.3 DNA提取
4.1.4 PCR擴增
4.1.5 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 總DNA提取
4.2.2 PCR擴增
4.2.3 擴增產(chǎn)物多態(tài)性
4.2.4 遺傳多樣性分析
4.2.5 遺傳結(jié)構(gòu)與分化
4.2.6 聚類分析
4.3 討論
4.3.1 RAPD法DNA擴增
4.3.2 遺傳多樣性分析和遺傳結(jié)構(gòu)
4.3.3 系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化
第五章 總結(jié)與展望
5.1 主要結(jié)論
5.2 保護(hù)唐古特大黃物種的啟示
5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
碩士期間主要研究成果
本文編號:3859607
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 遺傳多樣性
1.1.1 遺傳多樣性的概念
1.1.2 遺傳多樣性的檢測方法
1.1.3 遺傳多樣性的研究意義
1.2 唐古特大黃研究進(jìn)展
1.2.1 唐古特大黃簡介
1.2.2 唐古特大黃化學(xué)成分研究
1.2.3 唐古特大黃藥理作用研究
1.2.4 唐古特大黃分子生物學(xué)研究
1.3 研究目的及意義
1.4 研究方案及技術(shù)路線
第二章 唐古特大黃葉綠體全基因組
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 測序和序列拼接
2.1.4 基因組序列注釋
2.2 結(jié)果
2.2.1 總DNA提取
2.2.2 唐古特大黃葉綠體基因大小
2.2.3 唐古特大黃葉綠體基因注釋、基因功能及分類
2.3 討論
第三章 基于matK+rbcL條形碼對唐古特大黃遺傳多樣性的研究
3.1 材料與方法
3.1.1 樣品采集與處理
3.1.2 器材
3.1.3 試劑與溶液配制
3.1.4 DNA提取
3.1.5 PCR擴增
3.1.6 總DNA、PCR擴增產(chǎn)物檢測及測序
3.1.7 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 總DNA提取
3.2.2 PCR擴增
3.2.3 序列特征及單倍型分布
3.2.4 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
3.2.5 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.6 單倍型進(jìn)化關(guān)系
3.2.7 唐古特大黃進(jìn)化動態(tài)
3.3 討論
3.3.1 唐古特大黃DNA提取
3.3.2 唐古特大黃PCR擴增
3.3.3 唐古特大黃單倍型特征分析
3.3.4 唐古特大黃的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)
3.3.5 唐古特大黃的系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化
第四章 基于RAPD對唐古特大黃遺傳多樣性的研究
4.1 材料與方法
4.1.1 樣品采集與處理
4.1.2 試劑與器材
4.1.3 DNA提取
4.1.4 PCR擴增
4.1.5 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 總DNA提取
4.2.2 PCR擴增
4.2.3 擴增產(chǎn)物多態(tài)性
4.2.4 遺傳多樣性分析
4.2.5 遺傳結(jié)構(gòu)與分化
4.2.6 聚類分析
4.3 討論
4.3.1 RAPD法DNA擴增
4.3.2 遺傳多樣性分析和遺傳結(jié)構(gòu)
4.3.3 系統(tǒng)發(fā)育與進(jìn)化
第五章 總結(jié)與展望
5.1 主要結(jié)論
5.2 保護(hù)唐古特大黃物種的啟示
5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
碩士期間主要研究成果
本文編號:3859607
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