炸莢現(xiàn)象是造成野生大豆(Glycine soja)產(chǎn)量損失的關(guān)鍵因素之一。目前Dong等鑒定的大豆抗炸莢基因SHAT1-5在栽培大豆豆莢中的表達量是野生大豆等位基因型的15倍,進而形成了栽培大豆的抗炸莢性。進一步研究表明SHAT1-5基因在栽培大豆中表達量上升的原因是由于該基因上游4kb處存在20bp的缺失造成的。而本實驗室前期研究發(fā)現(xiàn)該20bp缺失在栽培大豆中只占了14.6%,并且該位點在野生大豆和栽培大豆間遺傳分化差異很小,那么另外不包含該位點的85.6%的栽培大豆抗炸莢性又當如何解釋?它們與SHAT1-5基因的關(guān)系究竟如何這有待于進一步研究。本課題選擇不同地區(qū)有代表性的75份大豆品種(包括48份栽培大豆和27份野生大豆)為研究材料,結(jié)合生物信息學分析SHAT1-5基因在大豆野生群體和栽培群體中的基因結(jié)構(gòu)差異和表達差異,從而尋找與抗炸莢性相關(guān)的功能多態(tài)性位點,為進一步分析這些位點與栽培大豆抗炸莢性間的關(guān)系提供理論依據(jù)。本研究的主要結(jié)果如下:1、在Phytozome數(shù)據(jù)庫中查找SHAT1-5基因序列,通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn)該基因結(jié)構(gòu)簡單,包含3個外顯子和2個內(nèi)含子。該基因編碼了一個含...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 前言
    1.1 作物的炸莢現(xiàn)象及其影響
        1.1.1 炸莢現(xiàn)象的概念
        1.1.2 作物炸莢現(xiàn)象的發(fā)生及其影響
    1.2 大豆的炸莢現(xiàn)象及其遺傳基礎(chǔ)
        1.2.1 野生大豆和栽培大豆的炸莢現(xiàn)象
        1.2.2 大豆炸莢的形態(tài)學研究
        1.2.3 大豆炸莢的遺傳基礎(chǔ)
        1.2.4 大豆抗炸莢基因SHAT1-5 的群體遺傳學研究
    1.3 啟動子分析和基因瞬時表達概述
        1.3.1 啟動子分析概述
        1.3.2 基因瞬時表達
    1.4 本研究的內(nèi)容、目的及意義
第2章 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 供試大豆材料
        2.1.2 常用的實驗試劑和實驗儀器
    2.2 實驗方法
        2.2.1 SHAT1-5 基因及其啟動子序列的生物信息學分析方法
        2.2.2 SHAT1-5 基因在野生大豆和栽培大豆中基因序列的測定
        2.2.3 熒光定量PCR實驗方法
第3章 結(jié)果與分析
    3.1 SHAT1-5 基因及其上游序列的生物信息學分析
        3.1.1 SHAT1-5 基因的結(jié)構(gòu)分析
        3.1.2 SHAT1-5 基因啟動子序列的分析
    3.2 SHAT1-5 基因及其上下游序列的多樣性分析
        3.2.1 SNP的分布
        3.2.2 次等位基因頻率的分布及其在馴化和育種過程中的變化
        3.2.3 群體遺傳分化系數(shù)及其分布范圍
    3.3 SHAT1-5 基因的表達分析
        3.3.1 SHAT1-5 基因熒光定量PCR引物的篩選
        3.3.2 SHAT1-5 基因在大豆中的時空表達特性分析
        3.3.3 SHAT1-5 基因在野生大豆和栽培大豆不同品種中的表達分析
第4章 討論
致謝
參考文獻
附錄



本文編號：3831367