為了深入分析SBP基因家族在谷子中的功能作用,本研究在谷子全基因組水平,通過NCBI blast及HMMER search等生物信息學(xué)方法進(jìn)行了谷子SBP基因家族鑒定,分析了SBP蛋白理化性質(zhì)及系統(tǒng)發(fā)育,利用RT-qPCR分析了谷子SBP基因在PEG和ABA脅迫下的表達(dá)情況。結(jié)果表明,谷子SBP基因家族有19個(gè)成員,位于9條染色體上,編碼的氨基酸序列長度為199～1 118 aa。谷子SBP蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果顯示,該蛋白家族可分為兩大類:第一類分為六個(gè)亞類,第二類僅有一個(gè)SBP蛋白。谷子SBP蛋白家族成員的外顯子數(shù)從2～11個(gè)不等,且均為親水性蛋白。亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,除SBP7外,所有的SBP蛋白在細(xì)胞核中均有信號。谷子SBP蛋白與擬南芥SBP蛋白在進(jìn)化關(guān)系上較遠(yuǎn),而與高粱、水稻SBP蛋白進(jìn)化關(guān)系較近。谷子SBP基因家族啟動(dòng)子區(qū)域的順式作用元件主要為植物激素、干旱、光照及病原菌、創(chuàng)傷類的響應(yīng)元件。RT-qPCR分析結(jié)果顯示,PEG和ABA脅迫誘導(dǎo)下,SBP基因在葉和莖中的表達(dá)均上調(diào),表達(dá)量增幅表現(xiàn)為:葉>莖。PEG脅迫后SBP基因的表達(dá)增長量顯著高于外源ABA誘導(dǎo);其中,S...

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 谷子SBP基因家族的鑒定
    1.3 谷子SBP蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹及SiSBPs基因結(jié)構(gòu)分析
    1.4 不同作物間SBP蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.5 基因定位
    1.6 啟動(dòng)子分析
    1.7 脅迫處理試驗(yàn)
    1.8 谷子幼苗根莖葉總RNA 提取及反轉(zhuǎn)錄
    1.9 PEG 6000脅迫和外源ABA誘導(dǎo)后SiSBPs基因的RT-qPCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 SiSBPs基因家族成員鑒定結(jié)果
    2.2 谷子SBP蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化、基因結(jié)構(gòu)及蛋白結(jié)構(gòu)域的分析
    2.3 不同作物SBP蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.4 谷子SBP基因家族的染色體定位分析
    2.5 谷子SBP基因家族的啟動(dòng)子分析
    2.6 谷子SBP基因家族的表達(dá)分析
        2.6.1 PEG 6000脅迫對SiSBPs基因相對表達(dá)量的影響
        2.6.2 外源ABA脅迫對SiSBPs基因相對表達(dá)量的影響
3 討論
4 結(jié)論



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