綠豆是豇豆屬中的主要栽培種作物,也是我國重要的食用豆類。作為小宗作物,綠豆研究基礎薄弱,遺傳圖譜數(shù)量少、密度低,難以有效用于新基因發(fā)掘等深入研究。本課題基于大花葉和冀綠9號變異株雜交衍生的RIL(Recombinant inbred line)群體,利用基因組重測序技術,構建了綠豆SNP高密度遺傳連鎖圖譜,并開展了主要表型性狀的QTL分析,主要研究結果如下:(1)綠豆高密度遺傳圖譜構建親本間共檢測到564449個SNP,將篩選后的SNP劃分為Bin標記,構建了包含1946個Bin標記(包含21508個SNP)的高密度遺傳連鎖圖譜,該圖譜總長為1060.17 cM,分為11個連鎖群(LG),平均圖距為0.54 cM。連鎖群的長度依次是LG 9(168.03 cM)>LG 6(127.99 cM)>LG 1(114.27 cM)>LG 5(113.37 cM)>LG 8(112.09 cM)>LG 7(95.76 cM)>LG 10(87.85cM)>LG 11(85.60 cM)>LG 2(71.90 cM)>LG 3(44.55 c...

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
    1.1 綠豆種植地位及研究意義
    1.2 遺傳連鎖圖譜構建原理及步驟
        1.2.1 遺傳連鎖圖譜構建原理
        1.2.2 遺傳標記種類
        1.2.3 遺傳連鎖圖譜構建主要內容
    1.3 綠豆遺傳圖譜研究現(xiàn)狀
        1.3.1 綠豆DNA分子標記的開發(fā)
        1.3.2 綠豆遺傳圖譜的研究進展
    1.4 QTL定位的原理及方法
    1.5 綠豆農(nóng)藝性狀遺傳研究進展
    1.6 選題目的意義和研究內容
        1.6.1 選題目的與意義
        1.6.2 主要研究內容
第二章 材料與方法
    2.1 實驗材料
    2.2 方法
        2.2.1 DNA文庫構建
        2.2.2 綠豆基因組重測序及數(shù)據(jù)處理
        2.2.3 親本之間SNP檢測
        2.2.4 .高密度遺傳圖譜的構建
        2.2.5 遺傳作圖操作方法
        2.2.6 農(nóng)藝性狀的考察
        2.2.7 QTL定位方法與步驟
        2.2.8 候選基因篩選及SNP變異分析
第三章 結果與分析
    3.1 高密度遺傳圖譜構建
        3.1.1 測序深度及基因組覆蓋度分析
        3.1.2 分子標記的開發(fā)及篩選
        3.1.3 遺傳連鎖圖譜特征分析
    3.2 共線性分析
    3.3 農(nóng)藝性狀表型分布及遺傳分析
        3.3.1 農(nóng)藝性狀分布
        3.3.2 葉形態(tài)表型分析
    3.4 農(nóng)藝性狀QTL定位
        3.4.1 QTL位點分布情況
        3.4.2 葉形態(tài)QTL定位與候選基因SNP變異分析
        3.4.3 株型相關性狀QTL定位
        3.4.4 豆莢形態(tài)相關QTL定位
        3.4.5 與籽粒性狀相關的QTL定位
        3.4.6 初花期相關QTL定位
        3.4.7 葉片葉綠素含量QTL定位
        3.4.8 幼莖色QTL定位
第四章 討論
    4.1 Bin標記應用于遺傳作圖的優(yōu)勢
    4.2 高密度遺傳圖譜構建
    4.3 農(nóng)藝性狀定位
    4.4 葉緣的遺傳機理
第五章 結論
    5.1 綠豆群體基因組重測序及 SNP 標記開發(fā)
    5.2 作圖群體的選擇
    5.3 高密度遺傳圖譜構建
    5.4 農(nóng)藝性狀表型分析
        5.4.1 葉形態(tài)分析
        5.4.2 農(nóng)藝性狀分布情況
    5.5 農(nóng)藝性狀QTL定位
    5.6 葉緣表型候選基因發(fā)掘及SNP變異分析
參考文獻
附錄A
致謝
作者簡歷



本文編號：3822301