野生大豆(Glycine soja)是栽培大豆(Glycinemax)的祖先種。廣泛地分布于東亞,包括日本、韓國、俄羅斯遠東地區(qū)和中國,而中國是野生大豆的分布與多樣性中心。野生大豆未經(jīng)馴化和人工選擇,是大豆育種過程中重要的遺傳資源。了解野生大豆的遺傳多樣性和群體遺傳結構對野生大豆種質資源的保護和利用意義十分重大。大豆油是人類營養(yǎng)所需脂肪酸的重要來源,脂肪酸代謝途徑?jīng)Q定大豆油脂肪酸的組成關乎大豆油的品質和產(chǎn)量的提高。然而,對脂肪酸代謝途徑的遺傳變異的研究甚少。了解野生大豆脂肪酸代謝途徑的核苷酸變異將為有效地保護利用野生大豆種質資源,為提高大豆油產(chǎn)量和品質提供重要的理論依據(jù)。本研究中,我們利用119個野生大豆樣品,包括59個個體樣品和60個來自于四個天然居群的樣品作為實驗材料,4個脂肪酸代謝途徑相關基因片段(ACCase-A,accB-1,GPAT,KASI)作為分子標記,對野生大豆的脂肪酸代謝途徑相關基因的核苷酸變異以及其群體遺傳結構進行了深入研究。測序并對序列比對后得到的有效片段長度從599到831 bp不等,總長度為2958 bp。在野生大豆的59個個體樣品中總共檢測到50個多態(tài)性位...

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【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 野生大豆種質資源概述
        1.1.1 野生大豆的分類學地位
        1.1.2 野生大豆種質資源的形態(tài)特征
        1.1.3 野生大豆種質資源分布
        1.1.4 野生大豆種質資源的研究意義
    1.2 野生大豆種質資源的群體遺傳學研究進展
        1.2.1 SSR標記在野生大豆群體遺傳學研究中的應用
        1.2.2 利用RAPD技術研究野生大豆的群體遺傳學
        1.2.3 同工酶分子標記在野生大豆群體遺傳學方面的研究進展
        1.2.4 SNP標記與野生大豆群體遺傳學研究
    1.3 大豆脂肪酸代謝途徑及其相關基因
        1.3.1 大豆脂肪酸代謝途徑
        1.3.2 大豆脂肪酸代謝途徑相關基因
    1.4 本課題研究的內容和意義
第二章 中國野生大豆脂肪酸代謝途徑相關基因的核苷酸變異
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 研究材料
        2.2.2 野生大豆基因組DNA的提取與純化
        2.2.3 DNA質量的測定
        2.2.4 脂肪酸代謝途徑相關基因的篩選及引物設計
        2.2.5 PCR擴增
        2.2.6 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結果與討論
        2.3.1 ACCase-A基因片段的核苷酸變異
        2.3.2 accB-1基因片段的核苷酸變異
        2.3.3 KASI基因片段的核苷酸變異
        2.3.4 GPAT基因片段的核苷酸變異
        2.3.5 四個脂肪酸代謝途徑相關基因片段的核苷酸變異
    2.4 本章小結
第三章 中國野生大豆的群體遺傳結構研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 研究材料
        3.2.2 數(shù)據(jù)收集
        3.2.3 數(shù)據(jù)分析方法
    3.3 結果與討論
        3.3.1 群體遺傳結構分析
        3.3.2 三個生態(tài)地理聚類的遺傳多樣性與遺傳分化
    3.4 本章小結
第四章 中國三個生態(tài)地理區(qū)域野生大豆天然居群的遺傳多樣性與遺傳分化
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 研究材料
        4.2.2 數(shù)據(jù)收集
        4.2.3 數(shù)據(jù)分析方法
    4.3 結果與討論
        4.3.1 基于KASI基因片段的居群遺傳多樣性與遺傳分化分析
        4.3.2 基于accB-1基因片段的居群遺傳多樣性與遺傳分化分析
        4.3.3 基于兩個基因片段的居群遺傳多樣性與遺傳分化分析
    4.4 本章小結
第五章 野生大豆與半野生大豆的葉綠體基因組研究
    5.1 引言
    5.2 研究方法
        5.2.1 基因組測序數(shù)據(jù)的選擇
        5.2.2 基因組測序數(shù)據(jù)的預處理與葉綠體基因組reads的提取
        5.2.3 葉綠體基因組的拼接和注釋
    5.3 結果與討論
        5.3.1 野生大豆葉綠體基因組基本結構
        5.3.2 半野生大豆葉綠體基因組基本結構
        5.3.3 大豆屬葉綠體基因組比較分析
        5.3.4 基于葉綠體基因組的大豆屬系統(tǒng)發(fā)育分析
    5.4 本章小結
第六章 總結與展望
致謝
參考文獻
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本文編號：3808244