羅布麻(Apocynum venetum),又名紅麻,夾竹桃科(Apocynaceae)多年生宿根草本植物,是我國寶貴的野生植物資源,作為抗逆性極強的生態(tài)經(jīng)濟型植物,其莖桿可制成纖維,葉片可以炒茶,也是蜜源植物。羅布麻的根、莖、葉和花均可入藥,主治高血壓和高血脂等病癥,1977年被《中華人民共和國藥典》錄入。植物全基因組測序是分析解決基因組成、成分分析、代謝通路等關于其本身的最基本的信息短缺問題,為物種之間的親緣關系、分化時間和種間進化關系等信息作出科學的分析和支持。而羅布麻關于基因測序方面的相關研究甚少,NCBI數(shù)據(jù)庫中羅布麻Genomes僅有89條序列(截止2020年6月14日),極少數(shù)的羅布麻基因組序列,使得其基因組學的研究滯后,羅布麻的全基因組破解亟需開展。本文利用Pacbio Sequel測序平臺、通過10X Gemonics測序技術、Hi-C輔助組裝等方法,對羅布麻進行全基因組測序、組裝以及分析,獲得如下結果:1.羅布麻基因組大小初步預估為254.40Mbp,是復雜基因組。全基因組Survey調查調查結果表明,羅布麻基因組大小初步預估為254.40Mbp,其雜合率和重復率分...

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 全基因組測序概述
    1.3 植物全基因組測序研究動態(tài)
    1.4 羅布麻分子生物學研究進展
    1.5 本研究目的及意義
    1.6 本研究技術路線圖
第二章 羅布麻基因組特征調查
    2.1 材料與方法
    2.2 結果和分析
    2.3 討論
    2.4 小結
第三章 羅布麻全基因組測序及組裝
    3.1 材料與方法
    3.2 結果與分析
    3.3 討論
    3.4 小結
第四章 羅布麻基因家族進化分析
    4.1 材料和方法
    4.2 結果和分析
    4.3 討論
    4.4 小結
第五章 結論與展望
    5.1 結論
    5.2 展望
參考文獻
致謝
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本文編號：3785905