羅布麻(Apocynum venetum),又名紅麻,夾竹桃科(Apocynaceae)多年生宿根草本植物,是我國(guó)寶貴的野生植物資源,作為抗逆性極強(qiáng)的生態(tài)經(jīng)濟(jì)型植物,其莖桿可制成纖維,葉片可以炒茶,也是蜜源植物。羅布麻的根、莖、葉和花均可入藥,主治高血壓和高血脂等病癥,1977年被《中華人民共和國(guó)藥典》錄入。植物全基因組測(cè)序是分析解決基因組成、成分分析、代謝通路等關(guān)于其本身的最基本的信息短缺問(wèn)題,為物種之間的親緣關(guān)系、分化時(shí)間和種間進(jìn)化關(guān)系等信息作出科學(xué)的分析和支持。而羅布麻關(guān)于基因測(cè)序方面的相關(guān)研究甚少,NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中羅布麻Genomes僅有89條序列(截止2020年6月14日),極少數(shù)的羅布麻基因組序列,使得其基因組學(xué)的研究滯后,羅布麻的全基因組破解亟需開(kāi)展。本文利用Pacbio Sequel測(cè)序平臺(tái)、通過(guò)10X Gemonics測(cè)序技術(shù)、Hi-C輔助組裝等方法,對(duì)羅布麻進(jìn)行全基因組測(cè)序、組裝以及分析,獲得如下結(jié)果:1.羅布麻基因組大小初步預(yù)估為254.40Mbp,是復(fù)雜基因組。全基因組Survey調(diào)查調(diào)查結(jié)果表明,羅布麻基因組大小初步預(yù)估為254.40Mbp,其雜合率和重復(fù)率分...

【文章頁(yè)數(shù)】：65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 研究背景
    1.2 全基因組測(cè)序概述
    1.3 植物全基因組測(cè)序研究動(dòng)態(tài)
    1.4 羅布麻分子生物學(xué)研究進(jìn)展
    1.5 本研究目的及意義
    1.6 本研究技術(shù)路線圖
第二章 羅布麻基因組特征調(diào)查
    2.1 材料與方法
    2.2 結(jié)果和分析
    2.3 討論
    2.4 小結(jié)
第三章 羅布麻全基因組測(cè)序及組裝
    3.1 材料與方法
    3.2 結(jié)果與分析
    3.3 討論
    3.4 小結(jié)
第四章 羅布麻基因家族進(jìn)化分析
    4.1 材料和方法
    4.2 結(jié)果和分析
    4.3 討論
    4.4 小結(jié)
第五章 結(jié)論與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介及論文發(fā)表情況



本文編號(hào)：3785905