玉米胚乳發(fā)育動態(tài)的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2023-04-03 17:50
玉米是世界上最重要的農(nóng)作物之一,被廣泛用于食品加工、動物飼料和工業(yè)原料。成熟玉米籽粒由胚、胚乳和種皮三部分組成,其中胚乳作為籽粒的營養(yǎng)貯藏部分,占到了成熟籽粒重量的80%85%,同時胚乳細胞的發(fā)育、增殖和淀粉的積累情況決定了籽粒的產(chǎn)量和品質(zhì)。因此,深入探究影響玉米胚乳細胞發(fā)育變化的關(guān)鍵調(diào)控機制對提高玉米的產(chǎn)量和品質(zhì),以及保證世界的糧食安全有著重要的意義。轉(zhuǎn)錄組作為連接基因組和蛋白組的關(guān)鍵紐帶,對解析玉米胚乳發(fā)育的動態(tài)過程和探究胚乳發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控機制具有重要的作用。迄今為止,在全基因組范圍內(nèi)對玉米胚乳發(fā)育動態(tài)的轉(zhuǎn)錄組研究仍是不全面的,尤其是對基因可變剪接和表達變化研究仍鮮有報道。本文利用RNA-seq技術(shù)對陜單609授粉后第5、10、15和20天的胚乳樣品進行了測序,全面分析了四個胚乳發(fā)育時期的基因可變剪接、表達和功能變化,以及淀粉合成代謝相關(guān)酶的進化、表達和功能之間的關(guān)系。研究結(jié)果進一步完善了玉米籽粒發(fā)育相關(guān)基因在轉(zhuǎn)錄水平上的表達信息,為闡明玉米胚乳發(fā)育的關(guān)鍵的調(diào)控機制和代謝網(wǎng)絡(luò)提供了重要線索,為加速高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)玉米新品種的選育提供了有效的參考依據(jù)。研究結(jié)果如下:1....
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 玉米的生產(chǎn)重要性及其分類
1.2 玉米胚乳發(fā)育的研究進展
1.2.1 玉米胚乳的形成和發(fā)育
1.2.2 玉米胚乳的營養(yǎng)成分及生物學(xué)功能
1.3 玉米胚乳中淀粉生物合成代謝相關(guān)基因的研究進展
1.3.1 淀粉合成過程中的腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)
1.3.2 淀粉合成過程中的淀粉合成酶(SS)
1.3.3 淀粉合成過程中的淀粉分支酶(SBE)
1.3.4 淀粉合成過程中的淀粉去分支酶(SDBE)
1.4 基于測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進展
1.4.1 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展概述
1.4.2 RNA-seq技術(shù)在玉米中的應(yīng)用
1.5 實時熒光定量PCR技術(shù)
1.5.1 實時熒光定量PCR技術(shù)的基本原理
1.5.2 實時熒光定量PCR技術(shù)的應(yīng)用
1.6 研究的目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗材料種植和收集
2.2 RNA的提取和測序文庫構(gòu)建
2.3 Reads純化和定位
2.4 可變剪接的鑒定
2.5 基因表達豐度的評定
2.6 統(tǒng)計分析
2.7 實時熒光定量PCR
2.8 淀粉代謝相關(guān)基因的進化分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 玉米胚乳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的評估
3.2 玉米胚乳發(fā)育過程中可變剪接動態(tài)性
3.3 玉米胚乳發(fā)育過程中基因表達的特征
3.4 玉米胚乳發(fā)育過程中轉(zhuǎn)錄因子的動態(tài)表達
3.5 玉米胚乳中淀粉代謝相關(guān)基因分析
第四章 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 玉米胚乳發(fā)育過程中可變剪接的特點
4.1.2 玉米胚乳發(fā)育過程中基因的差異表達
4.1.3 玉米胚乳發(fā)育過程中轉(zhuǎn)錄因子的表達與調(diào)控
4.1.4 玉米胚乳發(fā)育過程中淀粉代謝相關(guān)基因的表達及互作
4.2 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡介
本文編號:3780864
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 玉米的生產(chǎn)重要性及其分類
1.2 玉米胚乳發(fā)育的研究進展
1.2.1 玉米胚乳的形成和發(fā)育
1.2.2 玉米胚乳的營養(yǎng)成分及生物學(xué)功能
1.3 玉米胚乳中淀粉生物合成代謝相關(guān)基因的研究進展
1.3.1 淀粉合成過程中的腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)
1.3.2 淀粉合成過程中的淀粉合成酶(SS)
1.3.3 淀粉合成過程中的淀粉分支酶(SBE)
1.3.4 淀粉合成過程中的淀粉去分支酶(SDBE)
1.4 基于測序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進展
1.4.1 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展概述
1.4.2 RNA-seq技術(shù)在玉米中的應(yīng)用
1.5 實時熒光定量PCR技術(shù)
1.5.1 實時熒光定量PCR技術(shù)的基本原理
1.5.2 實時熒光定量PCR技術(shù)的應(yīng)用
1.6 研究的目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗材料種植和收集
2.2 RNA的提取和測序文庫構(gòu)建
2.3 Reads純化和定位
2.4 可變剪接的鑒定
2.5 基因表達豐度的評定
2.6 統(tǒng)計分析
2.7 實時熒光定量PCR
2.8 淀粉代謝相關(guān)基因的進化分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 玉米胚乳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的評估
3.2 玉米胚乳發(fā)育過程中可變剪接動態(tài)性
3.3 玉米胚乳發(fā)育過程中基因表達的特征
3.4 玉米胚乳發(fā)育過程中轉(zhuǎn)錄因子的動態(tài)表達
3.5 玉米胚乳中淀粉代謝相關(guān)基因分析
第四章 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 玉米胚乳發(fā)育過程中可變剪接的特點
4.1.2 玉米胚乳發(fā)育過程中基因的差異表達
4.1.3 玉米胚乳發(fā)育過程中轉(zhuǎn)錄因子的表達與調(diào)控
4.1.4 玉米胚乳發(fā)育過程中淀粉代謝相關(guān)基因的表達及互作
4.2 結(jié)論
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作者簡介
本文編號:3780864
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