干旱是目前向日葵生產(chǎn)中影響最大的非生物脅迫之一,受干旱脅迫影響,向日葵生產(chǎn)及育種面臨著極大的挑戰(zhàn)。試驗(yàn)共收集了122份油用向日葵材料,利用SLAF-seq技術(shù),以向日葵基因組作為參考進(jìn)行酶切預(yù)測(cè),水稻日本晴為對(duì)照進(jìn)行比對(duì),獲得多態(tài)性標(biāo)簽,并開(kāi)發(fā)大量特異性SNP,結(jié)合苗期抗旱盆栽試驗(yàn),通過(guò)表型數(shù)據(jù)分析以及抗旱相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析,鑒定供試品種抗旱性及性狀顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn),對(duì)顯著相關(guān)位點(diǎn)候選基因進(jìn)行功能注釋,篩選可能抗旱候選基因,為進(jìn)一步研究向日葵抗旱機(jī)理及分子標(biāo)記輔助育種提供了理論依據(jù)。研究主要結(jié)果如下:1.干旱脅迫條件下,株高、葉片相對(duì)含水量、SPAD、葉面積、根冠比、相對(duì)電導(dǎo)率、根長(zhǎng)度、根表面積及根體積9個(gè)性狀均可作為向日葵苗期抗旱性鑒定指標(biāo)。其中葉面積、根長(zhǎng)、根表面積、根體積4個(gè)性狀對(duì)脅迫反應(yīng)更為敏感,在向日葵苗期抗旱性評(píng)價(jià)中更具有代表性。經(jīng)過(guò)綜合抗旱性評(píng)價(jià),確定材料B108綜合抗旱性最強(qiáng)。2.運(yùn)用SLAF-seq技術(shù),共獲得477.76M reads數(shù)據(jù),1,105,347個(gè)SLAF標(biāo)簽,其中多態(tài)性SLAF標(biāo)簽86,985個(gè),共得到群體SNP標(biāo)記414,692個(gè),其中228,987個(gè)為高...

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
1 前言
    1.1 作物抗旱機(jī)制
    1.2 向日葵抗旱性研究進(jìn)展
    1.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的開(kāi)發(fā)及研究現(xiàn)狀
        1.3.1 SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)
        1.3.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.4 關(guān)聯(lián)分析及其在作物育種中的研究進(jìn)展
        1.4.1 連鎖不平衡
        1.4.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析概述
        1.4.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
    1.5 本研究的目的意義及技術(shù)路線(xiàn)
        1.5.1 研究目的與意義
        1.5.2 技術(shù)路線(xiàn)
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 盆栽試驗(yàn)
        2.2.2 基于SLAF-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)SNP標(biāo)記
    2.3 性狀測(cè)定
    2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
        2.4.1 表型性狀的統(tǒng)計(jì)分析
        2.4.2 分子數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果分析
    3.1 向日葵苗期抗旱性鑒定
        3.1.1 苗期各項(xiàng)指標(biāo)抗旱系數(shù)對(duì)干旱脅迫響應(yīng)分析
        3.1.2 各性狀抗旱系數(shù)相關(guān)分析
        3.1.3 各性狀抗旱系數(shù)與綜合抗旱隸屬函數(shù)值線(xiàn)性回歸分析
        3.1.4 抗旱性綜合評(píng)價(jià)
        3.1.5 苗期9項(xiàng)指標(biāo)抗旱系數(shù)與綜合抗旱評(píng)價(jià)D值相關(guān)分析
    3.2 SLAF-sep開(kāi)發(fā)SNP標(biāo)記分析
        3.2.1 酶切方案評(píng)估
        3.2.2 實(shí)驗(yàn)建庫(kù)評(píng)估
        3.2.3 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與評(píng)估
        3.2.4 參考基因組比對(duì)結(jié)果統(tǒng)計(jì)
        3.2.5 SLAF標(biāo)簽在向日葵染色體上的分布
        3.2.6 SNP標(biāo)記開(kāi)發(fā)
    3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.3.1 不同條件下性狀表型分析
        3.3.2 系統(tǒng)發(fā)育及親緣關(guān)系評(píng)估
        3.3.3 群體結(jié)構(gòu)分析
        3.3.4 連鎖不平衡分析
        3.3.5 苗期抗旱相關(guān)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.3.6 候選基因預(yù)測(cè)分析
4 討論
    4.1 抗旱性鑒定指標(biāo)的篩選
    4.2 抗旱性評(píng)價(jià)方法
    4.3 傳統(tǒng)分子標(biāo)記局限性
    4.4 SLAF-seq在分子育種中技術(shù)優(yōu)勢(shì)
    4.5 遺傳結(jié)構(gòu)對(duì)全基因組關(guān)聯(lián)分析的影響
    4.6 連鎖不平衡對(duì)全基因組關(guān)聯(lián)分析影響
    4.7 苗期抗旱性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)
    4.8 抗旱候選基因
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3774287