野生花生全基因組SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2023-03-09 18:01
栽培花生(Arachis hypogaea L.)在中國(guó)、印度、美國(guó)等廣泛種植,是世界上重要的油料作物和經(jīng)濟(jì)作物。除了用于榨油外,花生也被用做鮮食或被加工成各種食品,花生在我國(guó)農(nóng)民增收、農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整中有著巨大的發(fā)展?jié)摿椭匾a(chǎn)業(yè)地位。目前,分子標(biāo)記輔助選擇(Marker assisted selection,MAS)已經(jīng)成為作物育種的重要手段。分子標(biāo)記輔助選擇具有快速、準(zhǔn)確且不受環(huán)境因素的干擾的優(yōu)點(diǎn),提升了育種的效率并縮短了育種周期。除了高油酸性狀外,花生的其他性狀鮮有分子標(biāo)記輔助育種的報(bào)道。和水稻、玉米、小麥等糧食作物相比,花生的MAS還處于起步階段,其中,分子標(biāo)記數(shù)量少是制約花生分子標(biāo)記輔助選擇發(fā)展的重要限制因素。本研究基于花生二倍體祖先種的全基因組測(cè)序的序列信息,開(kāi)發(fā)了大量的花生基因組SSR標(biāo)記,并將花生的SSR分子標(biāo)記應(yīng)用到花生雜交種F1真?zhèn)舞b定、抗葉斑病QTL分析等工作中,研究結(jié)果將為花生高密度遺傳圖譜構(gòu)建、重要基因的定位、圖位克隆及分子標(biāo)記輔助選擇育種奠定基礎(chǔ),主要研究結(jié)果如下:1、花生全基因組SSR分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)在花生野生祖先種全基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,從花生祖先種Arach...
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英文縮略表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展
1.1.1 第一代分子標(biāo)記
1.1.2 第二代分子標(biāo)記
1.1.3 SSR分子標(biāo)記原理
1.1.4 第三代分子標(biāo)記
1.2 花生分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用
1.2.1 花生分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
1.2.2 花生SSR標(biāo)記的應(yīng)用
1.2.3 本研究的內(nèi)容和意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試花生材料
2.1.2 主要試劑盒和成品試劑
2.1.3 試劑配置
2.1.4 主要儀器設(shè)備
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 花生全基因SSR位點(diǎn)的鑒定的方法
2.2.2 花生全基因SSR引物的設(shè)計(jì)
2.2.3 電子PCR(InSilicoPCR)方法
2.2.4 基因組DNA提取
3 結(jié)果與討論
3.1 花生全基因組SSR的位點(diǎn)的鑒定
3.1.1 花生全基因組SSR位點(diǎn)的數(shù)量、種類和統(tǒng)計(jì)分析
3.1.2 花生全基因組SSR位點(diǎn)在花生不同染色體上的分布
3.2 花生全基因組SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
3.2.1 花生全基因組SSR引物的設(shè)計(jì)
3.2.2 花生全基因組SSR引物的電子PCR分析
3.2.3 花生SSR引物在花生野生種和栽培種的實(shí)際擴(kuò)增情況
3.3 花生全基因組SSR標(biāo)記的應(yīng)用
3.3.1 花生SSR標(biāo)記在花生野生種中的應(yīng)用
3.3.2 利用分子標(biāo)記進(jìn)行花生雜交F1真?zhèn)舞b定
3.3.3 基因組SSR分子標(biāo)記對(duì)花生種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定
3.3.4 利用功能性和基因組SSR分子標(biāo)記對(duì)花生栽培種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析
3.3.5 花生SSR標(biāo)記在花生QTL定位方面的應(yīng)用
4 總結(jié)
5 參考文獻(xiàn)
6 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論著
7 致謝
本文編號(hào):3758041
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英文縮略表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展
1.1.1 第一代分子標(biāo)記
1.1.2 第二代分子標(biāo)記
1.1.3 SSR分子標(biāo)記原理
1.1.4 第三代分子標(biāo)記
1.2 花生分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用
1.2.1 花生分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
1.2.2 花生SSR標(biāo)記的應(yīng)用
1.2.3 本研究的內(nèi)容和意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試花生材料
2.1.2 主要試劑盒和成品試劑
2.1.3 試劑配置
2.1.4 主要儀器設(shè)備
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 花生全基因SSR位點(diǎn)的鑒定的方法
2.2.2 花生全基因SSR引物的設(shè)計(jì)
2.2.3 電子PCR(InSilicoPCR)方法
2.2.4 基因組DNA提取
3 結(jié)果與討論
3.1 花生全基因組SSR的位點(diǎn)的鑒定
3.1.1 花生全基因組SSR位點(diǎn)的數(shù)量、種類和統(tǒng)計(jì)分析
3.1.2 花生全基因組SSR位點(diǎn)在花生不同染色體上的分布
3.2 花生全基因組SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
3.2.1 花生全基因組SSR引物的設(shè)計(jì)
3.2.2 花生全基因組SSR引物的電子PCR分析
3.2.3 花生SSR引物在花生野生種和栽培種的實(shí)際擴(kuò)增情況
3.3 花生全基因組SSR標(biāo)記的應(yīng)用
3.3.1 花生SSR標(biāo)記在花生野生種中的應(yīng)用
3.3.2 利用分子標(biāo)記進(jìn)行花生雜交F1真?zhèn)舞b定
3.3.3 基因組SSR分子標(biāo)記對(duì)花生種質(zhì)資源進(jìn)行鑒定
3.3.4 利用功能性和基因組SSR分子標(biāo)記對(duì)花生栽培種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析
3.3.5 花生SSR標(biāo)記在花生QTL定位方面的應(yīng)用
4 總結(jié)
5 參考文獻(xiàn)
6 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論著
7 致謝
本文編號(hào):3758041
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