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一個小麥中水稻根系直系同源基因的分子鑒定及表達(dá)分析

發(fā)布時間:2023-03-05 14:44
  【目的】分析水稻中OsRAA1在小麥中的同源基因TaRAA1的結(jié)構(gòu)、進化、啟動子調(diào)控區(qū)域、組織特異性表達(dá)以及非生物脅迫表達(dá)等,初步探索其在小麥中的生物學(xué)功能,為進一步遺傳轉(zhuǎn)化研究其功能提供指導(dǎo)!痉椒ā坷迷诰數(shù)據(jù)庫獲得TaRAA1的基因編碼序列和蛋白結(jié)構(gòu),進一步分析其進化和表達(dá)模式,最后在"中國春"中進行RT-qPCR驗證該基因的組織特異性表達(dá)以及非生物脅迫表達(dá)!窘Y(jié)果】TaRAA1被定位到小麥第三同源染色體(3A、3B和3D),在所有分析物種中均無內(nèi)含子,其基因結(jié)構(gòu)具有高度保守性。在所研究的物種中除在水稻中檢測到一個低復(fù)雜區(qū)域外,其他物種中均未檢測到任何功能域。組織特異性表達(dá)分析表明,TaRAA1基因主要在小麥的根部大量表達(dá)。公共數(shù)據(jù)庫和RT-qPCR分析結(jié)果都表明小麥TaRAA1在高溫、高鹽、干旱處理下,表達(dá)量受到正向調(diào)控;而在低溫和PEG處理下,表達(dá)受到負(fù)向調(diào)控!窘Y(jié)論】TaRAA1基因可能在小麥?zhǔn)艿椒巧锬婢趁{迫時發(fā)揮著重要作用。

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 試驗材料與處理
    1.2 基因與氨基酸序列獲取
    1.3 Ta RAA1基因的染色體定位分析
    1.4 同源基因序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.5 核苷酸結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
    1.6 啟動子中的順式作用元件分析和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測
    1.7 表達(dá)模式分析
    1.8 RNA的提取及c DNA第一鏈的合成
    1.9 引物設(shè)計與RT-q PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Ta RAA1基因的染色體定位
    2.2 RAA1基因結(jié)構(gòu)
    2.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.4 啟動子分析
    2.5 中國春小麥的Ta RAA1基因?qū)γ{迫的響應(yīng)
3 討論與結(jié)論



本文編號:3756388

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