馬鈴薯是重要的糧食作物,但由于多種脅迫的影響全球馬鈴薯的平均產(chǎn)量遠(yuǎn)低于理想產(chǎn)量。當(dāng)馬鈴薯遭受不利的環(huán)境影響時(shí)會(huì)誘導(dǎo)其體內(nèi)大量轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)。轉(zhuǎn)錄因子是一類(lèi)具有轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì),它們可以直接與靶基因啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件結(jié)合或與其他蛋白質(zhì)相互作用形成聚合體,結(jié)合在靶基因啟動(dòng)子區(qū)域,從而實(shí)現(xiàn)激活或抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄,對(duì)靶基因進(jìn)行精確調(diào)控,進(jìn)而形成轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),減輕植物在脅迫下的傷害。因此轉(zhuǎn)錄因子在植物生長(zhǎng)發(fā)育和環(huán)境適應(yīng)性過(guò)程中起著關(guān)鍵調(diào)控作用,明確植物在逆境脅迫下轉(zhuǎn)錄因子如何參與多種通路調(diào)節(jié)馬鈴薯生長(zhǎng)發(fā)育,在生產(chǎn)中具有重要意義。馬鈴薯中雖有關(guān)于轉(zhuǎn)錄因子研究的零散報(bào)道,但均未從全基因組水平對(duì)馬鈴薯轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行研究和解析。為此本研究建立了一個(gè)馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子cDNA文庫(kù),首先對(duì)馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行鑒定分析,結(jié)果表明馬鈴薯中共有1736個(gè)基因編碼得到2405個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,根據(jù)其結(jié)構(gòu)域序列特征分為56個(gè)家族,可知一個(gè)基因可能編碼2個(gè)及以上轉(zhuǎn)錄因子,本研究每個(gè)基因僅保留一個(gè)代表轉(zhuǎn)錄因子。以ARF家族為例,ARF家族成員共有33個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,共由18個(gè)基因編碼得到,其中有10個(gè)基因編碼了2個(gè)及以上...

【文章頁(yè)數(shù)】：120 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
    1.1 課題的提出
    1.2 文獻(xiàn)綜述
        1.2.1 轉(zhuǎn)錄因子分類(lèi)
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄因子功能相關(guān)研究
    1.3 研究目的
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 菌株與載體
        2.1.3 引物
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 生物信息學(xué)分析
        2.2.2 基因克隆
        2.2.3 載體構(gòu)建
3 結(jié)果與分析
    3.1 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子分析
        3.1.1 馬鈴薯ARF家族轉(zhuǎn)錄因子成員鑒定
        3.1.2 馬鈴薯ARF轉(zhuǎn)錄因子染色體定位
        3.1.3 不同物種ARF家族轉(zhuǎn)錄因子蛋白系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)分析
        3.1.4 馬鈴薯ARF家族轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)分析
        3.1.5 馬鈴薯ARF家族轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域分析
        3.1.6 馬鈴薯ARF家族轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)模式分析
    3.2 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子家族分析
        3.2.1 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子概況
        3.2.2 只含有一個(gè)結(jié)合結(jié)構(gòu)域類(lèi)家族
        3.2.3 含有輔助結(jié)構(gòu)域或多個(gè)結(jié)合結(jié)構(gòu)域類(lèi)家族
        3.2.4 含有結(jié)合結(jié)構(gòu)域但不含有禁止結(jié)構(gòu)域類(lèi)家族
    3.3 馬鈴薯轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)構(gòu)建
        3.3.1 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子克隆
        3.3.2 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子載體構(gòu)建
        3.3.4 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子測(cè)序結(jié)果比對(duì)分析
        3.3.5 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)構(gòu)建結(jié)果匯總
4 討論
    4.1 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子克隆
    4.2 馬鈴薯轉(zhuǎn)錄因子可變剪切
    4.3 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)
    4.4 未來(lái)研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄
    附圖1 StbHLH115基因克隆的不同轉(zhuǎn)錄本序列比對(duì)分析
    附圖2 StbHLH23基因克隆的不同轉(zhuǎn)錄本序列比對(duì)分析
    附圖3 StbHLH63 基因克隆的不同轉(zhuǎn)錄本序列比對(duì)分析
    附圖4 StbHLH11 基因克隆的不同轉(zhuǎn)錄本序列比對(duì)分析
    附圖5 StbHLH110 基因克隆的不同轉(zhuǎn)錄本序列比對(duì)分析
    附表6 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)構(gòu)建完成結(jié)果
    附表1 馬鈴薯ARF家族基因定量引物
    附表2 馬鈴薯ARF家族基因CDS全長(zhǎng)克隆引物序列
    附表3 馬鈴薯全基因組轉(zhuǎn)錄因子文庫(kù)構(gòu)建完成結(jié)果
    附件清單
致謝



本文編號(hào)：3749954