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薏苡油脂合成關(guān)鍵基因克隆及其生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-02-11 14:43
  【目的】掌握薏苡二酰甘油;D(zhuǎn)移酶基因(ClDGAT)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)油酸脫飽和酶基因(ClFAD2)和硬脂酸脫飽和酶基因(ClSAD)的生物信息學(xué)特性,明確薏苡油脂代謝調(diào)控機(jī)制,為今后開展以提高薏苡含油量和改良脂肪酸組成為目標(biāo)的育種研究提供理論依據(jù)!痉椒ā坷肦T-PCR和RACE克隆薏苡油脂合成關(guān)鍵基因(ClDGAT、ClFAD2和ClSAD),通過(guò)染色體步移技術(shù)獲得ClFAD2和ClSAD基因啟動(dòng)子序列,并以ExPASy ProtParam tool、SMART、TMHMM Server v.2.0和SOPMA等在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析!窘Y(jié)果】從薏苡葉片中成功克隆獲得ClDGAT、ClFAD2和ClSAD基因,NCBI登錄號(hào)分別為MK589802、MK589803和MK589804。其中,ClDGAT基因cDNA序列全長(zhǎng)1842 bp,其開放閱讀框(ORF)為1539 bp,編碼512個(gè)氨基酸;ClFAD2基因cDNA序列全長(zhǎng)1768 bp,其ORF為1164 bp,編碼387個(gè)氨基酸,無(wú)內(nèi)含子;ClSAD基因cDNA序列全長(zhǎng)1727 bp,其ORF為1182 bp,編碼393個(gè)氨...

【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)

【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 DNA提取及cDNA合成
    1.3 油脂合成關(guān)鍵基因cDNA序列克隆
    1.4 ClFAD2和ClSAD基因組序列及其啟動(dòng)子擴(kuò)增
    1.5 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD基因克隆及測(cè)序分析結(jié)果
    2.2 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白理化性質(zhì)預(yù)測(cè)分析結(jié)果
    2.3 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白功能域及其結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果
    2.4 ClDGAT、ClFAD2和ClSAD蛋白氨基酸序列進(jìn)化分析結(jié)果
    2.5 ClFAD2和ClSAD基因啟動(dòng)子序列分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào):3740583

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