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水旱條件下小麥產(chǎn)量性狀和抗旱性的全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-12-18 04:56
  小麥?zhǔn)鞘澜缟现匾募Z食作物,選育高產(chǎn)節(jié)水小麥品種是當(dāng)前小麥育種的主要任務(wù)。本研究以134個(gè)小麥品種/系為材料,利用高通量SNP芯片,進(jìn)行小麥產(chǎn)量性狀和抗旱性的全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)掘重要性狀的QTL及其分子標(biāo)記,對(duì)小麥分子標(biāo)記輔助育種及基因克隆具有重要意義。主要結(jié)果如下:(1)利用小麥90K SNP芯片對(duì)包括134個(gè)品種/系的自然群體進(jìn)行掃描,在得到的多態(tài)性SNP中去除最小等位基因頻率(MAF)小于5%、缺失率大于15%的SNP,剩余9329個(gè)SNP。其中,85.24%(7952/9329)的SNP有遺傳位置信息,分布在21條染色體上。群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,將134個(gè)品種/系分為兩個(gè)亞群,分別包括121個(gè)品種/系和13個(gè)品種/系,群體的LD衰減距離約為13 cM。(2)在成株期,將試驗(yàn)材料在2年、3點(diǎn)、2種水分處理共12個(gè)環(huán)境下種植,調(diào)查了產(chǎn)量相關(guān)的11個(gè)表型性狀;在苗期,進(jìn)行了2次PEG-6000模擬干旱脅迫試驗(yàn),調(diào)查了10個(gè)表型性狀。相關(guān)分析結(jié)果顯示,產(chǎn)量性狀間存在明顯的相關(guān)性,產(chǎn)量性狀和抗旱系數(shù)間存在不同程度的相關(guān)性,不同抗旱系數(shù)間也存在相關(guān)性。(3)本研究用株高、產(chǎn)量和產(chǎn)量三要素... 

【文章頁數(shù)】:197 頁

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
符號(hào)說明
中文摘要
英文摘要
1 前言
    1.1 小麥生產(chǎn)概況
    1.2 小麥產(chǎn)量相關(guān)性狀與的產(chǎn)量關(guān)系
        1.2.1 產(chǎn)量構(gòu)成因素
        1.2.2 株高
        1.2.3 根系
        1.2.4 理想株型
    1.3 小麥抗旱性研究進(jìn)展
        1.3.1 國(guó)內(nèi)外干旱發(fā)生情況
        1.3.2 作物抗旱性
            1.3.2.1 形態(tài)性狀
            1.3.2.2 生理性狀
            1.3.2.3 生化性狀
            1.3.2.4 產(chǎn)量與抗旱性
        1.3.3 抗旱性鑒定方法與指標(biāo)
    1.4 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
        1.4.1 GWAS的基本原理
        1.4.2 GWAS研究的主要方法和軟件
        1.4.3 SNP標(biāo)記及其在GWAS分析中的應(yīng)用
        1.4.4 GWAS在植物復(fù)雜性狀分析中的應(yīng)用
    1.5 本研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
        2.2.1 苗期試驗(yàn)設(shè)計(jì)和形狀調(diào)查
        2.2.2 成株期試驗(yàn)設(shè)計(jì)和形狀調(diào)查
    2.3 SNP標(biāo)記檢測(cè)
    2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
        2.4.1 表型數(shù)據(jù)和抗旱系數(shù)的計(jì)算
        2.4.2 群體結(jié)構(gòu)、親緣關(guān)系和LD分析
        2.4.3 關(guān)聯(lián)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 水旱條件下表型變異和相關(guān)性分析
        3.1.1 表型變異分析
        3.1.2 相關(guān)性分析
        3.1.3 抗旱性小麥品種的鑒定
    3.2 SNP標(biāo)記多態(tài)性及群體結(jié)構(gòu)
        3.2.1 SNP多態(tài)性
        3.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析和親緣關(guān)系分析
    3.3 連鎖不平衡分析
    3.4 關(guān)聯(lián)分析
        3.4.1 表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
        3.4.2 抗旱性的關(guān)聯(lián)分析
        3.4.3 多效性SNP和QTL簇
4 討論
    4.1 產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL定位
    4.2 與已定位QTL的對(duì)比分析
    4.3 干旱脅迫對(duì)產(chǎn)量性狀QTL表達(dá)的影響
5 結(jié)論
6 參考文獻(xiàn)
7 致謝
8 附表


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)江中下游高產(chǎn)小麥產(chǎn)量與農(nóng)藝性狀的相關(guān)性研究[J]. 陳士強(qiáng),張容,王建華,朱瑩,袁媛,陳秀蘭,何震天.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(06)
[2]1961—2012年黃土高原干旱時(shí)空分布特征[J]. 王利娜,朱清科,翁白莎,劉芳,王建偉,何霄嘉.  水利水電技術(shù). 2018(02)
[3]基于干燥指數(shù)的近45年云南滇中地區(qū)干濕狀況的變化特征[J]. 曹言,王杰,黃英,張雷,戚娜.  水土保持研究. 2018(01)
[4]模擬干旱條件下冬小麥品種萌發(fā)期抗旱性評(píng)價(jià)[J]. 孫綠,李玉剛,王圣健,劉亞東,王志英,劉丹,李娜娜,趙長(zhǎng)星,蓋紅梅.  干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2017(06)
[5]SNP標(biāo)記在小麥遺傳育種中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 許陶瑜,唐朝暉,王長(zhǎng)彪,任永康,趙興華,劉江,趙霞.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(09)
[6]小麥品種抗旱性與深根性和深層根系活性的關(guān)系[J]. 李夢(mèng)達(dá),李向東,牛洪斌,楊習(xí)文,靳海洋,賀德先.  麥類作物學(xué)報(bào). 2017(05)
[7]薏苡種質(zhì)資源成株期抗旱性鑒定及抗旱指標(biāo)篩選[J]. 汪燦,周棱波,張國(guó)兵,張立異,徐燕,高旭,姜訥,邵明波.  作物學(xué)報(bào). 2017(09)
[8]植物抗旱性鑒定評(píng)價(jià)方法及抗旱機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李瑞雪,孫任潔,汪泰初,陳丹丹,李榮芳,李龍,趙衛(wèi)國(guó).  生物技術(shù)通報(bào). 2017(07)
[9]SNP標(biāo)記在玉米研究上的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 寧洽,劉文國(guó),楊偉光,路明.  玉米科學(xué). 2017(01)
[10]基于MCI指標(biāo)的甘肅省近50年干旱特征分析[J]. 成青燕,高曉清,林紓,趙紅巖,楊蘇華.  干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2017(01)

碩士論文
[1]控水條件下小麥不同抗旱性鑒定指標(biāo)的研究[D]. 張玉梅.萊陽農(nóng)學(xué)院 2006



本文編號(hào):3721385

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