利用CRISPR/Cas9技術(shù)改良水稻株高、抽穗期和品質(zhì)相關(guān)性狀的初步探討
發(fā)布時間:2022-10-08 14:14
水稻的雜交育種耗時長、操作復(fù)雜,且難以達(dá)到性狀定向改良的目的。利用CRISPR/Cas9技術(shù)進(jìn)行基因的定點編輯已經(jīng)在水稻中得到了成功的運用。我們使用CRISPR/Cas9技術(shù)定向改良了水稻性狀,挑選wx、fgr、sd1、hd1、ghd7.1、GS3為候選靶基因,設(shè)計它們的CRISPR/Cas9編輯載體,通過農(nóng)桿菌侵染法構(gòu)建這些載體在不同水稻材料中的突變體。通過雜交或自交的方法,得到無T-DNA插入的水稻。此方法一方面可以快速定向改良水稻性狀,另一方面,也可以創(chuàng)建突變體,提供新型種質(zhì)資源。主要結(jié)果如下:1.根據(jù)候選基因設(shè)計靶點,將兩個候選基因的靶點同時構(gòu)建到CRISPR/Cas9編輯載體。使用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化法分別獲得了華2613S-wx-fgr、貴州香禾糯-sd1-ghd7.12、貴州香禾糯-hd1-ghd7.11、香玉玻-GS3的T0代轉(zhuǎn)基因植株。2.使用自交和雜交的方法獲得雙基因純合的功能突變型華2613S-wx1-fgr2、貴州香禾糯-sd1-ghd7.12、貴州香禾糯-hd1-ghd7.11植株。3.考察T1代貴州香禾糯-hd1-ghd7.11、T
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 目的基因研究背景
1.1.1 Wx基因的研究背景
1.1.2 fgr基因的研究背景
1.1.3 SD1基因的研究背景
1.1.4 抽穗期相關(guān)基因的研究背景
1.1.5 GS3基因的研究背景
1.2 CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)概述
1.2.1 CRISPR-Cas系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)
1.2.2 CRISPR-Cas系統(tǒng)的適應(yīng)免疫機制
1.2.3 CRISPR-Cas系統(tǒng)的分類
1.2.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)在水稻中的應(yīng)用
1.3 本研究的目的意義
第一章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)改良貴州香禾糯的株高和抽穗期
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供實驗用水稻
2.1.2 菌株和質(zhì)粒
2.2 實驗方法
2.2.1 CRISPR敲除載體的構(gòu)建
2.2.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻的遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.3 水稻米質(zhì)的測定方法
3 結(jié)果與分析
3.1 雙靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.1.1 U6/U3-sgRNA載體的構(gòu)建
3.1.2 sgRNA載體與pCXUN載體的連接
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T_0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.2.1 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化
3.2.2 轉(zhuǎn)基因陽性單株的篩選
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 貴州香禾糯突變體突變基因型功能分析
3.4.1 sd1突變基因型功能分析
3.4.2 Hd1突變基因型功能分析
3.4.3 Ghd7.1突變基因型功能分析
3.5 轉(zhuǎn)基因植株的表型鑒定
3.5.1 貴州香禾糯突變體株高和抽穗期的表型鑒定
3.5.2 貴州香禾糯突變體農(nóng)藝性狀表型考察
3.5.3 貴州香禾糯突變體品質(zhì)性狀表型考察
第二章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)將水稻不育系華2613S改為香糯型
2 材料與方法
3 結(jié)果與分析
3.1 雙靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 華 2613S突變體突變基因型功能分析
3.4.1 wx突變基因型功能分析
3.4.2 fgr突變基因型功能分析
3.5 華 2613S突變體直鏈淀粉含量及香味性狀的表型鑒定
第三章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)改良香玉玻粒型
2 材料與方法
3 結(jié)果與分析
3.1 單靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 香玉玻突變體GS3突變基因型功能分析
3.5 香玉玻突變體粒長性狀考察結(jié)果
4 討論
4.1 sd1基因不同突變體與株高的關(guān)系
4.2 Hd1基因與Ghd7.1基因?qū)Τ樗肫诘挠绊?br> 4.3 抽穗期與日照時間的探討
4.4 貴州香禾糯突變體材料非目的性狀變異
4.5 wx基因調(diào)控水稻籽粒的直鏈淀粉含量
4.6 突變體材料的篩選
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 1:本研究中所用引物
附錄 2:部分實驗的詳細(xì)步驟
Protocol 1: SSR技術(shù)路線
Protocol 2: 載體構(gòu)建和遺傳轉(zhuǎn)化中各核心實驗步驟
Protocol 3: 水稻粳稻遺傳轉(zhuǎn)化體系
Protocol 4: 水稻秈稻遺傳轉(zhuǎn)化體系
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國華北地區(qū)粳稻品種抽穗期遺傳分析[J]. 魏祥進(jìn),江玲,徐俊鋒,陸廣文,王洪俊,王智權(quán),翟虎渠,萬建民. 中國水稻科學(xué). 2009(06)
[2]利用染色體片段代換系定位水稻主效抽穗期QTL[J]. 邵迪,李秋萍,吳比,邢永忠. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(04)
[3]Relationship Between the First Base of the Donor Splice Site of Waxy Gene Intron 1 and Amylose Content in Yunnan Indigenous Rice Varieties[J]. ZHANG Ya-li1,2, XU Ming-hui1, ZENG Ya-wen1, YAO Chun-xin1, CHEN Shan-na2 (1 Key Laboratory of Biotechnology Research of Yunnan Province, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kunming 650223, China; 2 College of Life Science, Yunnan University, Kunming 650091, China). Rice Science. 2007(03)
[4]水稻抽穗期基因研究進(jìn)展[J]. 董春林,孫業(yè)盈,鄧曉建. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2005(06)
[5]染色體單片段代換系的構(gòu)建及應(yīng)用于QTL精細(xì)定位[J]. 張麗霞,劉丕慶,劉學(xué)義. 分子植物育種. 2004(05)
[6]水稻蠟質(zhì)基因引導(dǎo)區(qū)的兩個SSR序列與直鏈淀粉含量的相關(guān)性(英文)[J]. 談移芳,張啟發(fā). 植物學(xué)報. 2001(02)
[7]秈稻和粳稻中蠟質(zhì)基因座位上微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性及其與直鏈淀粉含量的關(guān)系[J]. 舒慶堯,吳殿星,夏英武,高明尉. 遺傳學(xué)報. 1999(04)
[8]水稻蠟質(zhì)基因5’非翻譯區(qū)一個與調(diào)控有關(guān)的內(nèi)含子[J]. 蔡秀玲,王宗陽,鄭霏琴,洪孟民. 植物生理學(xué)報. 1997(03)
博士論文
[1]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻轉(zhuǎn)基因研究[D]. 林擁軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
本文編號:3687860
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 目的基因研究背景
1.1.1 Wx基因的研究背景
1.1.2 fgr基因的研究背景
1.1.3 SD1基因的研究背景
1.1.4 抽穗期相關(guān)基因的研究背景
1.1.5 GS3基因的研究背景
1.2 CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)概述
1.2.1 CRISPR-Cas系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)
1.2.2 CRISPR-Cas系統(tǒng)的適應(yīng)免疫機制
1.2.3 CRISPR-Cas系統(tǒng)的分類
1.2.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)在水稻中的應(yīng)用
1.3 本研究的目的意義
第一章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)改良貴州香禾糯的株高和抽穗期
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供實驗用水稻
2.1.2 菌株和質(zhì)粒
2.2 實驗方法
2.2.1 CRISPR敲除載體的構(gòu)建
2.2.2 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻的遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.3 水稻米質(zhì)的測定方法
3 結(jié)果與分析
3.1 雙靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.1.1 U6/U3-sgRNA載體的構(gòu)建
3.1.2 sgRNA載體與pCXUN載體的連接
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T_0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.2.1 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化
3.2.2 轉(zhuǎn)基因陽性單株的篩選
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 貴州香禾糯突變體突變基因型功能分析
3.4.1 sd1突變基因型功能分析
3.4.2 Hd1突變基因型功能分析
3.4.3 Ghd7.1突變基因型功能分析
3.5 轉(zhuǎn)基因植株的表型鑒定
3.5.1 貴州香禾糯突變體株高和抽穗期的表型鑒定
3.5.2 貴州香禾糯突變體農(nóng)藝性狀表型考察
3.5.3 貴州香禾糯突變體品質(zhì)性狀表型考察
第二章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)將水稻不育系華2613S改為香糯型
2 材料與方法
3 結(jié)果與分析
3.1 雙靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 華 2613S突變體突變基因型功能分析
3.4.1 wx突變基因型功能分析
3.4.2 fgr突變基因型功能分析
3.5 華 2613S突變體直鏈淀粉含量及香味性狀的表型鑒定
第三章 利用CRISPR/Cas9技術(shù)改良香玉玻粒型
2 材料與方法
3 結(jié)果與分析
3.1 單靶點CRISPR/Cas9載體構(gòu)建
3.2 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株T0代的獲取和陽性鑒定結(jié)果
3.3 CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)基因植株的突變類型
3.4 香玉玻突變體GS3突變基因型功能分析
3.5 香玉玻突變體粒長性狀考察結(jié)果
4 討論
4.1 sd1基因不同突變體與株高的關(guān)系
4.2 Hd1基因與Ghd7.1基因?qū)Τ樗肫诘挠绊?br> 4.3 抽穗期與日照時間的探討
4.4 貴州香禾糯突變體材料非目的性狀變異
4.5 wx基因調(diào)控水稻籽粒的直鏈淀粉含量
4.6 突變體材料的篩選
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 1:本研究中所用引物
附錄 2:部分實驗的詳細(xì)步驟
Protocol 1: SSR技術(shù)路線
Protocol 2: 載體構(gòu)建和遺傳轉(zhuǎn)化中各核心實驗步驟
Protocol 3: 水稻粳稻遺傳轉(zhuǎn)化體系
Protocol 4: 水稻秈稻遺傳轉(zhuǎn)化體系
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國華北地區(qū)粳稻品種抽穗期遺傳分析[J]. 魏祥進(jìn),江玲,徐俊鋒,陸廣文,王洪俊,王智權(quán),翟虎渠,萬建民. 中國水稻科學(xué). 2009(06)
[2]利用染色體片段代換系定位水稻主效抽穗期QTL[J]. 邵迪,李秋萍,吳比,邢永忠. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(04)
[3]Relationship Between the First Base of the Donor Splice Site of Waxy Gene Intron 1 and Amylose Content in Yunnan Indigenous Rice Varieties[J]. ZHANG Ya-li1,2, XU Ming-hui1, ZENG Ya-wen1, YAO Chun-xin1, CHEN Shan-na2 (1 Key Laboratory of Biotechnology Research of Yunnan Province, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kunming 650223, China; 2 College of Life Science, Yunnan University, Kunming 650091, China). Rice Science. 2007(03)
[4]水稻抽穗期基因研究進(jìn)展[J]. 董春林,孫業(yè)盈,鄧曉建. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2005(06)
[5]染色體單片段代換系的構(gòu)建及應(yīng)用于QTL精細(xì)定位[J]. 張麗霞,劉丕慶,劉學(xué)義. 分子植物育種. 2004(05)
[6]水稻蠟質(zhì)基因引導(dǎo)區(qū)的兩個SSR序列與直鏈淀粉含量的相關(guān)性(英文)[J]. 談移芳,張啟發(fā). 植物學(xué)報. 2001(02)
[7]秈稻和粳稻中蠟質(zhì)基因座位上微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性及其與直鏈淀粉含量的關(guān)系[J]. 舒慶堯,吳殿星,夏英武,高明尉. 遺傳學(xué)報. 1999(04)
[8]水稻蠟質(zhì)基因5’非翻譯區(qū)一個與調(diào)控有關(guān)的內(nèi)含子[J]. 蔡秀玲,王宗陽,鄭霏琴,洪孟民. 植物生理學(xué)報. 1997(03)
博士論文
[1]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻轉(zhuǎn)基因研究[D]. 林擁軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
本文編號:3687860
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