苧麻花發(fā)育相關(guān)AP2/ERF類基因的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2022-09-30 12:48
苧麻是多年生的植物,目前苧麻的育種目標(biāo),主要集中在產(chǎn)量,纖維品質(zhì),加工品質(zhì),抗逆性,飼用品質(zhì)等方面,而開花會(huì)很大程度上,影響8月份以后生長苧麻的產(chǎn)量與品質(zhì)。根據(jù)現(xiàn)有的生長周期,苧麻的開花,不利于三麻時(shí)期的營養(yǎng)生長,三麻期大量的開花結(jié)實(shí),會(huì)導(dǎo)致苧麻的纖維品質(zhì)和產(chǎn)量明顯下降。本研究的目的是想通過對不同品種苧麻在不同時(shí)期不同部位的轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá),找到含AP2/ERF結(jié)構(gòu)域與開花相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子,克隆出開花調(diào)控相關(guān)的基因,為后續(xù)苧麻開花調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。本文的主要研究結(jié)果如下:(1)本文通過實(shí)驗(yàn)室前期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),找到可信度比較高的七個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,同時(shí)利用ExPASy,NCBI,Smart等生物信息學(xué)的網(wǎng)站進(jìn)行核苷酸序列分析,氨基酸翻譯以及氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域搜索,對轉(zhuǎn)錄因子6896,18197,17478,15426N,15247n,9156,16687共七個(gè)進(jìn)行分析,經(jīng)過分析發(fā)現(xiàn)18197,17478,15247,6896,9156都含有AP2結(jié)構(gòu)域,同時(shí)選取的七個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),具有一定的代表性,為后續(xù)研究提供理論方向。(2)本研究以3個(gè)苧麻品種為材料,采用actin作為內(nèi)參基因,利...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 苧麻概述
1.2 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子
1.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.4 研究的目的與意義
第2章 苧麻轉(zhuǎn)錄組來源的AP2/ERF基因生物信息學(xué)分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 ORF的分析
2.2.2 AP2/ERF結(jié)構(gòu)域分析
2.2.3 轉(zhuǎn)錄因子聚類分析
2.3 討論
第3章 苧麻熒光定量實(shí)時(shí)PCR體系建立
3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 RNA提取率
3.2.2 RNA的純度和完整性
3.2.3 實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增曲線和熔解曲線分析
3.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR相對表達(dá)量分析
3.3 結(jié)論與討論
3.3.1 結(jié)論
3.3.2 討論
第4章 苧麻AP2/ERF基因的時(shí)空表達(dá)分析
4.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)取材
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.2 熒光定量PCR結(jié)果
4.2.1 不同苧麻品種中骨,莖尖,皮,葉部位的表達(dá)
4.3 討論
第5章 苧麻花發(fā)育相關(guān)AP2/ERF基因的克隆與生物信息學(xué)分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
5.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.2.1 基因克隆
5.2.2 苧麻9156基因序列
5.2.3 苧麻9156蛋白二級結(jié)構(gòu)分析
5.2.4 苧麻9156聚類分析
5.2.5 苧麻9156蛋白的三維結(jié)構(gòu)分析
5.3 討論
第6章 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
6.1 結(jié)論
6.2 創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
縮寫表
致謝
作者簡介
本文編號(hào):3683583
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 苧麻概述
1.2 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子
1.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.4 研究的目的與意義
第2章 苧麻轉(zhuǎn)錄組來源的AP2/ERF基因生物信息學(xué)分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 ORF的分析
2.2.2 AP2/ERF結(jié)構(gòu)域分析
2.2.3 轉(zhuǎn)錄因子聚類分析
2.3 討論
第3章 苧麻熒光定量實(shí)時(shí)PCR體系建立
3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 RNA提取率
3.2.2 RNA的純度和完整性
3.2.3 實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增曲線和熔解曲線分析
3.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR相對表達(dá)量分析
3.3 結(jié)論與討論
3.3.1 結(jié)論
3.3.2 討論
第4章 苧麻AP2/ERF基因的時(shí)空表達(dá)分析
4.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)取材
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.2 熒光定量PCR結(jié)果
4.2.1 不同苧麻品種中骨,莖尖,皮,葉部位的表達(dá)
4.3 討論
第5章 苧麻花發(fā)育相關(guān)AP2/ERF基因的克隆與生物信息學(xué)分析
5.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
5.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.2.1 基因克隆
5.2.2 苧麻9156基因序列
5.2.3 苧麻9156蛋白二級結(jié)構(gòu)分析
5.2.4 苧麻9156聚類分析
5.2.5 苧麻9156蛋白的三維結(jié)構(gòu)分析
5.3 討論
第6章 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
6.1 結(jié)論
6.2 創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
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致謝
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本文編號(hào):3683583
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