通過對大芻草轉(zhuǎn)錄組測序來發(fā)掘SSR標(biāo)記位點,結(jié)果發(fā)現(xiàn)14 099個SSR位點,出現(xiàn)頻率為13.31%。三核苷酸和單核苷酸是主要重復(fù)類型,分別占SSR總數(shù)的42.12%和25.65%;六核苷酸重復(fù)所占比例最小,占0.43%。轉(zhuǎn)錄組結(jié)果表明,大芻草SSR中共發(fā)現(xiàn)38種重復(fù)基元,單核苷酸重復(fù)基元A/T出現(xiàn)頻率最高,占總SSR的21.06%;其次為AG/CT和GCC/GGC,分別占6.759%和5.53%。5次重復(fù)的SSR數(shù)量最多,有3 927個,占總SSR的27.85%。研究結(jié)果為大芻草的SSR分子標(biāo)記研究、遺傳多樣性分析、種群遺傳結(jié)構(gòu)等提供基礎(chǔ)。 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料與總RNA提取
    1.2 轉(zhuǎn)錄組測序及組裝拼接
    1.3 轉(zhuǎn)錄組SSR篩選
2 結(jié)果與分析
    2.1 大芻草總RNA質(zhì)量的檢測
    2.2 大芻草轉(zhuǎn)錄組測序組裝結(jié)果及統(tǒng)計
    2.3 Unigene注釋
    2.4 大芻草轉(zhuǎn)錄組中SSR位點數(shù)量和分布
    2.5 大芻草轉(zhuǎn)錄組中SSR位點重復(fù)次數(shù)
    2.6 大芻草轉(zhuǎn)錄組中SSR基元類型和數(shù)量
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3676391