水稻生物質(zhì)高效降解的結(jié)構(gòu)因子與遺傳特性解析以及纖維素的定向遺傳改良
發(fā)布時(shí)間:2022-05-03 01:13
能源作物細(xì)胞壁遺傳改良是提高生物質(zhì)酶解效率和生物乙醇產(chǎn)量的有效途徑。能源作物遺傳改良需要解決三個(gè)主要科學(xué)問(wèn)題:(1)鑒定影響生物質(zhì)酶解效率的主要細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子;(2)揭示細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子的分子遺傳基礎(chǔ);(3)探索細(xì)胞壁遺傳改良的方法與途徑。迄今,影響生物質(zhì)酶解效率的細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子尚未完全鑒定,且極少通過(guò)數(shù)量遺傳學(xué)的方法進(jìn)行研究;另外,能源作物的遺傳改良主要側(cè)重于木質(zhì)素或半纖維素生物合成的調(diào)控,而調(diào)控纖維素合成的較少。故本研究在遺傳群體水平上全面分析了纖維素、木質(zhì)素和以半纖維為主的單糖對(duì)生物質(zhì)酶解效率的影響,利用近紅外技術(shù)實(shí)現(xiàn)了水稻生物質(zhì)酶解效率和細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子的高通量快速測(cè)定和數(shù)量性狀位點(diǎn)定位,通過(guò)精細(xì)編輯水稻次生細(xì)胞壁纖維素合酶基因復(fù)合體,創(chuàng)建了纖維素結(jié)晶度和聚合度下降、生物質(zhì)酶解效率和乙醇發(fā)酵產(chǎn)率顯著升高且重要農(nóng)藝性狀未受影響的優(yōu)質(zhì)水稻突變體材料,為能源作物纖維素的定向精細(xì)改良提供了方法與手段。主要結(jié)果如下:1.選用100份水稻重組自交系群體,全面分析了晶體纖維素含量、纖維素結(jié)晶度、木質(zhì)素總量、酸溶或酸不溶木質(zhì)素含量、木質(zhì)素單體組成、半纖維素單糖組成和兩種預(yù)處理?xiàng)l件下的生物質(zhì)酶解效率...
【文章頁(yè)數(shù)】:188 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 前言
1.2 植物細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)與生物質(zhì)酶解
1.2.1 纖維素結(jié)構(gòu)
1.2.2 木質(zhì)素結(jié)構(gòu)
1.2.3 半纖維素結(jié)構(gòu)
1.2.4 果膠結(jié)構(gòu)
1.3 植物細(xì)胞壁生物合成與遺傳改良
1.3.1 纖維素生物合成
1.3.2 木質(zhì)素生物合成
1.3.3 半纖維生物合成
1.3.4 果膠生物合成
1.4 生物質(zhì)酶解效率相關(guān)數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)研究
1.4.1 細(xì)胞壁組分QTL
1.4.2 生物質(zhì)酶解效率QTL
1.5 細(xì)胞壁組分和生物質(zhì)酶解效率分析方法
1.5.1 傳統(tǒng)化學(xué)方法
1.5.2 高通量分析平臺(tái)
1.5.3 近紅外模型預(yù)測(cè)
1.6 CRISPR/Cas9 基因編輯技術(shù)與植物細(xì)胞壁遺傳改良
1.6.1 CRISPR/Cas9 技術(shù)的原理與發(fā)展
1.6.2 CRISPR/Cas9 在細(xì)胞壁遺傳改良中的應(yīng)用
1.7 本研究的目的和意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 水稻材料
2.1.2 基因編輯和轉(zhuǎn)基因載體
2.2 主要儀器與試劑
2.2.1 主要儀器
2.2.2 主要試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 水稻種植和生物質(zhì)粉末制備
2.3.2 細(xì)胞壁成分分析
2.3.3 纖維素結(jié)晶度測(cè)定
2.3.4 纖維素聚合度測(cè)定
2.3.5 生物質(zhì)預(yù)處理及酶解
2.3.6 生物質(zhì)酶解發(fā)酵及乙醇濃度測(cè)定
2.3.7 近紅外建模
2.3.8 QTL定位
2.3.9 基因編輯
2.3.10 Os CESA9 蛋白片段表達(dá)
2.3.11 大腸桿菌和農(nóng)桿菌感受態(tài)制備和轉(zhuǎn)化
2.3.12 水稻愈傷侵染和組織培養(yǎng)
2.3.13 水稻生物學(xué)性狀考察
2.3.14 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 水稻群體細(xì)胞壁成分和生物質(zhì)酶解效率
3.2 水稻生物質(zhì)酶解效率結(jié)構(gòu)因子鑒定
3.2.1 纖維素相關(guān)性狀對(duì)酶解效率的影響
3.2.2 木質(zhì)素相關(guān)性狀對(duì)酶解效率的影響
3.2.3 半纖維素單糖對(duì)酶解效率的影響
3.3 水稻生物質(zhì)酶解效率與細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子近紅外模型建立
3.3.1 水稻生物質(zhì)近紅外光譜分析
3.3.2 近紅外建模集和驗(yàn)證集樣品選擇
3.3.3 近紅外模型的建立和驗(yàn)證
3.3.4 近紅外模型的特征波長(zhǎng)分析
3.4 近紅外模型預(yù)測(cè)生物質(zhì)酶解效率和細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子性狀
3.5 細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子之間相關(guān)性
3.6 生物質(zhì)酶解效率與細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子QTL鑒定
3.7 生物質(zhì)酶解效率和細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子QTL共定位
3.8 分子標(biāo)記輔助篩選能源水稻
3.9 水稻纖維素合酶基因編輯
3.10 纖維素合酶基因敲除與水稻生長(zhǎng)
3.11 纖維素合酶結(jié)構(gòu)域缺失與水稻生長(zhǎng)
3.12 纖維素合酶點(diǎn)突變與纖維素改良
3.12.1 ZnF區(qū)點(diǎn)突變
3.12.2 P-CR區(qū)點(diǎn)突變
3.12.3 CSR區(qū)點(diǎn)突變
3.12.4 QXXRW區(qū)點(diǎn)突變
3.12.5 TMD區(qū)點(diǎn)突變
3.13 纖維素對(duì)水稻生物質(zhì)酶解效率和生物學(xué)性狀的影響
3.14 OsCESA4/7/9突變體優(yōu)質(zhì)能源水稻材料篩選
3.15 優(yōu)質(zhì)水稻突變體A7P2-ec29和A7P2-ec31的生物學(xué)性狀
3.16 A7P2-ec29和A7P2-ec31的細(xì)胞壁成分和纖維素特征
3.17 A7P2-ec29和A7P2-ec31的生物質(zhì)酶解效率和乙醇發(fā)酵產(chǎn)率
3.18 纖維素合酶突變蛋白對(duì)纖維素合成的影響
3.18.1 纖維素合酶點(diǎn)突變蛋白
3.18.2 纖維素合酶蛋白片段
4 討論
4.1 木質(zhì)素對(duì)生物質(zhì)酶解效率的影響
4.2 木質(zhì)素單體與酸溶木質(zhì)素之間的關(guān)系
4.3 半纖維素單糖與木質(zhì)素之間的關(guān)系
4.4 不同酶解程度下的生物質(zhì)酶解效率影響因子
4.5 近紅外技術(shù)在生物質(zhì)酶解效率研究中的應(yīng)用
4.6 水稻次生細(xì)胞壁纖維素合酶突變體脆稈表型形成的原因
4.7 纖維素合酶各功能域的作用
4.8 A7P2-ec29和A7P2-ec31在纖維素乙醇生產(chǎn)上的應(yīng)用潛力
5 總結(jié)與展望
5.1 總結(jié)
5.2 展望
5.2.1 細(xì)胞壁酶解效率相關(guān)性狀的遺傳位點(diǎn)定位和克隆
5.2.2 半纖維素單糖和木質(zhì)素的交聯(lián)
5.2.3 植物纖維素合酶基因結(jié)構(gòu)域和關(guān)鍵位點(diǎn)的功能鑒定
5.2.4 次生細(xì)胞壁纖維素合酶基因編輯培育優(yōu)質(zhì)能源作物
數(shù)據(jù)說(shuō)明
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄一 常用試劑配方
附錄二 OsCESA4/7/9結(jié)構(gòu)域的位置
附錄三 OsCESA4/7/9基因編輯載體和spacer序列
附錄四 突變位點(diǎn)擴(kuò)增測(cè)序引物
附錄五 作者簡(jiǎn)歷
博士在讀期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號(hào):3650330
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要
ABSTRACT
縮略詞表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 前言
1.2 植物細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)與生物質(zhì)酶解
1.2.1 纖維素結(jié)構(gòu)
1.2.2 木質(zhì)素結(jié)構(gòu)
1.2.3 半纖維素結(jié)構(gòu)
1.2.4 果膠結(jié)構(gòu)
1.3 植物細(xì)胞壁生物合成與遺傳改良
1.3.1 纖維素生物合成
1.3.2 木質(zhì)素生物合成
1.3.3 半纖維生物合成
1.3.4 果膠生物合成
1.4 生物質(zhì)酶解效率相關(guān)數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)研究
1.4.1 細(xì)胞壁組分QTL
1.4.2 生物質(zhì)酶解效率QTL
1.5 細(xì)胞壁組分和生物質(zhì)酶解效率分析方法
1.5.1 傳統(tǒng)化學(xué)方法
1.5.2 高通量分析平臺(tái)
1.5.3 近紅外模型預(yù)測(cè)
1.6 CRISPR/Cas9 基因編輯技術(shù)與植物細(xì)胞壁遺傳改良
1.6.1 CRISPR/Cas9 技術(shù)的原理與發(fā)展
1.6.2 CRISPR/Cas9 在細(xì)胞壁遺傳改良中的應(yīng)用
1.7 本研究的目的和意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 水稻材料
2.1.2 基因編輯和轉(zhuǎn)基因載體
2.2 主要儀器與試劑
2.2.1 主要儀器
2.2.2 主要試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 水稻種植和生物質(zhì)粉末制備
2.3.2 細(xì)胞壁成分分析
2.3.3 纖維素結(jié)晶度測(cè)定
2.3.4 纖維素聚合度測(cè)定
2.3.5 生物質(zhì)預(yù)處理及酶解
2.3.6 生物質(zhì)酶解發(fā)酵及乙醇濃度測(cè)定
2.3.7 近紅外建模
2.3.8 QTL定位
2.3.9 基因編輯
2.3.10 Os CESA9 蛋白片段表達(dá)
2.3.11 大腸桿菌和農(nóng)桿菌感受態(tài)制備和轉(zhuǎn)化
2.3.12 水稻愈傷侵染和組織培養(yǎng)
2.3.13 水稻生物學(xué)性狀考察
2.3.14 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 水稻群體細(xì)胞壁成分和生物質(zhì)酶解效率
3.2 水稻生物質(zhì)酶解效率結(jié)構(gòu)因子鑒定
3.2.1 纖維素相關(guān)性狀對(duì)酶解效率的影響
3.2.2 木質(zhì)素相關(guān)性狀對(duì)酶解效率的影響
3.2.3 半纖維素單糖對(duì)酶解效率的影響
3.3 水稻生物質(zhì)酶解效率與細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子近紅外模型建立
3.3.1 水稻生物質(zhì)近紅外光譜分析
3.3.2 近紅外建模集和驗(yàn)證集樣品選擇
3.3.3 近紅外模型的建立和驗(yàn)證
3.3.4 近紅外模型的特征波長(zhǎng)分析
3.4 近紅外模型預(yù)測(cè)生物質(zhì)酶解效率和細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子性狀
3.5 細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子之間相關(guān)性
3.6 生物質(zhì)酶解效率與細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子QTL鑒定
3.7 生物質(zhì)酶解效率和細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)因子QTL共定位
3.8 分子標(biāo)記輔助篩選能源水稻
3.9 水稻纖維素合酶基因編輯
3.10 纖維素合酶基因敲除與水稻生長(zhǎng)
3.11 纖維素合酶結(jié)構(gòu)域缺失與水稻生長(zhǎng)
3.12 纖維素合酶點(diǎn)突變與纖維素改良
3.12.1 ZnF區(qū)點(diǎn)突變
3.12.2 P-CR區(qū)點(diǎn)突變
3.12.3 CSR區(qū)點(diǎn)突變
3.12.4 QXXRW區(qū)點(diǎn)突變
3.12.5 TMD區(qū)點(diǎn)突變
3.13 纖維素對(duì)水稻生物質(zhì)酶解效率和生物學(xué)性狀的影響
3.14 OsCESA4/7/9突變體優(yōu)質(zhì)能源水稻材料篩選
3.15 優(yōu)質(zhì)水稻突變體A7P2-ec29和A7P2-ec31的生物學(xué)性狀
3.16 A7P2-ec29和A7P2-ec31的細(xì)胞壁成分和纖維素特征
3.17 A7P2-ec29和A7P2-ec31的生物質(zhì)酶解效率和乙醇發(fā)酵產(chǎn)率
3.18 纖維素合酶突變蛋白對(duì)纖維素合成的影響
3.18.1 纖維素合酶點(diǎn)突變蛋白
3.18.2 纖維素合酶蛋白片段
4 討論
4.1 木質(zhì)素對(duì)生物質(zhì)酶解效率的影響
4.2 木質(zhì)素單體與酸溶木質(zhì)素之間的關(guān)系
4.3 半纖維素單糖與木質(zhì)素之間的關(guān)系
4.4 不同酶解程度下的生物質(zhì)酶解效率影響因子
4.5 近紅外技術(shù)在生物質(zhì)酶解效率研究中的應(yīng)用
4.6 水稻次生細(xì)胞壁纖維素合酶突變體脆稈表型形成的原因
4.7 纖維素合酶各功能域的作用
4.8 A7P2-ec29和A7P2-ec31在纖維素乙醇生產(chǎn)上的應(yīng)用潛力
5 總結(jié)與展望
5.1 總結(jié)
5.2 展望
5.2.1 細(xì)胞壁酶解效率相關(guān)性狀的遺傳位點(diǎn)定位和克隆
5.2.2 半纖維素單糖和木質(zhì)素的交聯(lián)
5.2.3 植物纖維素合酶基因結(jié)構(gòu)域和關(guān)鍵位點(diǎn)的功能鑒定
5.2.4 次生細(xì)胞壁纖維素合酶基因編輯培育優(yōu)質(zhì)能源作物
數(shù)據(jù)說(shuō)明
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄一 常用試劑配方
附錄二 OsCESA4/7/9結(jié)構(gòu)域的位置
附錄三 OsCESA4/7/9基因編輯載體和spacer序列
附錄四 突變位點(diǎn)擴(kuò)增測(cè)序引物
附錄五 作者簡(jiǎn)歷
博士在讀期間發(fā)表的論文
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