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水稻抽穗期基因dth6與lfi1的圖位克隆及功能分析

發(fā)布時間:2022-04-23 09:07
  自然界中的植物為了適應(yīng)不同的緯度、海拔以及不同的種植環(huán)境,產(chǎn)生各自獨特的開花機制進(jìn)行繁衍生息。在長期的馴化中,熟期適中、穩(wěn)產(chǎn)性好的水稻品種更容易在生產(chǎn)被保留。決定水稻品種抽穗期的因素主要有基本營養(yǎng)生長性、感光性和感溫性。不同的基本營養(yǎng)生長性、感光性和感溫性的組合,使得不同的水稻品種呈現(xiàn)了抽穗期的多樣性和不同的地理分布特點。這一方面為育種工作者提供了豐富的資源;另一方面也使得抽穗期的研究工作變得異常復(fù)雜。水稻抽穗期表型呈現(xiàn)典型的數(shù)量性狀(QTL)遺傳特征,發(fā)掘和鑒定水稻抽穗期基因/QTLs,開展抽穗期基因精細(xì)定位、克隆等方面的研究對于完善水稻抽穗期基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),闡明水稻開花的分子機理,指導(dǎo)生產(chǎn)選育具有重要的理論和實踐意義。本研究分別對染色體片段置換系和突變體材料開展抽穗期相關(guān)基因的定位,主要包括以下結(jié)果:1.水稻抽穗期QTL位點dth6的圖位克隆本實驗前期利用秈稻品種IR24和粳稻品種Asominori的重組自交系(RILs)群體,檢測到了一個抽穗期QTL(dth6),位于第6染色體。為了驗證dth6的效應(yīng),我們從Asominori為背景親本,IR24為供體親本的染色體片段置換系(CS... 

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 水稻抽穗期的概念和研究意義
        1.1 水稻抽穗期的概念
        1.2 水稻抽穗期的研究意義
    2 水稻抽穗期的決定因素
        2.1 基本營養(yǎng)生長性
        2.2 感光性
        2.3 感溫性
    3 水稻抽穗期的遺傳
        3.1 水稻抽穗期的遺傳行為
        3.2 秈粳亞種間雜種抽穗期的遺傳表現(xiàn)
    4 水稻抽穗期QTL的定位
    5 水稻抽穗期基因的克隆及功能分析
        5.1 水稻抽穗期感光基因Se-5的克隆
        5.2 Hd1的克隆和功能分析
        5.3 Hd2的克隆和功能分析
        5.4 Hd3a及RFT1的克隆
        5.5 Ghd7的克隆和功能分析
        5.6 Ehd1的克隆和功能分析
        5.7 OsGI的克隆和功能分析
        5.8 RID1/OsID/Ehd2及SIDI的克隆和功能分析
    6 Hd1的結(jié)構(gòu)和功能分析
        6.1 BBX轉(zhuǎn)錄因子對植物生長發(fā)育的影響
        6.2 COL轉(zhuǎn)錄因子對植物生長發(fā)育的影響
    7 組蛋白甲基化修飾對植物生長發(fā)育的影響
    8 本研究的主要內(nèi)容
第二章 水稻抽穗期QTL位點dth6的圖位克隆
    1 材料和方法
        1.1 供試材料
        1.2 田間試驗
        1.3 表型鑒定
        1.4 分子標(biāo)記的開發(fā)
        1.5 DNA樣品制配,PCR反應(yīng)程序及電泳檢測
        1.6 候選位點的QTL效應(yīng)檢測
        1.7 dth6的精細(xì)定位
        1.8 候選基因的預(yù)測、測序及BLAST分析
        1.9 dth6的熒光定量檢測和亞細(xì)胞定位
    2 結(jié)果
        2.1 QTL-dth6的驗證
        2.2 抽穗期基因dth6的定位
        2.3 候選基因的篩選和BLAST分析
        2.4 Hd1基因是dth6位點可能的候選基因
    3 討論
        3.1 本研究所檢測到的QTL-dth6與已報道的QTL-Hd1的比較
        3.2 抽穗期感光基因dth6的圖位克隆
        3.3 抽穗期基因dth6可能參與馴化過程
第三章 水稻晚開花突變體lft1的鑒定與基因克隆
    1 材料和方法
        1.1供試材料
        1.2 主要農(nóng)藝性狀調(diào)查
        1.3 T-DNA旁鄰序列的克隆與T-DNA插入的鑒定
        1.4 分子標(biāo)記的開發(fā)
        1.5 DNA樣品制備
        1.6 PCR反應(yīng)及電泳檢測
        1.7 實時熒光定量檢測基因的表達(dá)量
    2 結(jié)果
        2.1 突變體的表型特征及主要農(nóng)藝性狀的考察
        2.2 遺傳分析與T-DNA共分離分析
        2.3 定位群體的抽穗期次數(shù)分布
        2.4 基因的初定位與候選基因鑒定
        2.5 抽穗期相關(guān)基因的表達(dá)分析
    3 討論
第四章 全文結(jié)論
    4.1 Hd1(CSSL30)相對于Hd1(Asominori)呈顯性
    4.2 抽穗期感光基因dth6是Hd1的復(fù)等位基因
    4.3 晚開花突變體lft1是SDG724基因的等位突變體
    4.4 SDG724影響抽穗期相關(guān)基因的表達(dá)
參考文獻(xiàn)
附錄
    附錄1 Hd1(CSSL30)和Hd1(Asominori)的氨基酸序列比較
    附錄2 煙草瞬時表達(dá)系統(tǒng)(農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化)
    附表 本研究所用的引物
    實驗所用的定量引物
致謝



本文編號:3646927

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