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陸地棉脂肪酸脫氫酶基因家族的全基因組鑒定和表達(dá)特征分析

發(fā)布時(shí)間:2022-02-26 10:59
  脂肪酸是植物細(xì)胞膜脂和種子儲(chǔ)藏油脂的重要組成成分。FAD基因家族編碼的脂肪酸脫氫酶是催化合成不飽和脂肪酸的關(guān)鍵酶,可將一個(gè)或多個(gè)C=C雙鍵引入至脂肪酸鏈特定位置,在調(diào)節(jié)植物生長和響應(yīng)外界環(huán)境信號(hào)過程中起著不可替代的作用。陸地棉(Gossypium hirsutum L.)是最重要的栽培棉種,產(chǎn)量約占世界棉花總產(chǎn)量的90%,是研究基因組進(jìn)化的重要模式植物,且對(duì)于研究多倍化的馴化作用具有較高的研究價(jià)值。此外,棉花雖是耐鹽先鋒作物,但當(dāng)土壤含鹽量大于0.3%時(shí),就會(huì)對(duì)棉花產(chǎn)生危害。同時(shí),棉花是喜溫作物,15 ℃以下的低溫就會(huì)導(dǎo)致凍害,影響產(chǎn)量和品質(zhì)。本研究基于四倍體栽培棉種陸地棉(AD1)全基因組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)和比較基因組學(xué)技術(shù)對(duì)FAD基因家族進(jìn)行了全基因組鑒定和基因結(jié)構(gòu)分析,并探索其在不同品種、不同器官、不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式,以及鹽和低溫脅迫下的應(yīng)答響應(yīng),為育種家通過修飾FAD基因的表達(dá)改善棉籽油分含量、提高非生物脅迫抗性提供了候選基因和理論基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:(1)鑒定出39個(gè)陸地棉FAD基因,其中有34個(gè)FAD基因定位于22條染色體上,其余5個(gè)基因的定位尚不明確。這些基因分屬于... 

【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 陸地棉的起源與進(jìn)化
    1.2 脂肪酸脫氫酶的研究進(jìn)展
        1.2.1 不飽和脂肪酸的合成途徑
        1.2.2 FAD基因家族的進(jìn)化和分類
        1.2.3 FAD基因家族對(duì)植物生長的調(diào)控
    1.3 植物比較基因組學(xué)和生物信息學(xué)研究進(jìn)展
        1.3.1 植物基因組測(cè)序
        1.3.2 棉花基因組測(cè)序
        1.3.3 比較基因組學(xué)
        1.3.4 生物信息學(xué)研究進(jìn)展
    1.4 植物非生物脅迫機(jī)理
        1.4.1 非生物脅迫對(duì)植物生長發(fā)育的影響
        1.4.2 植物應(yīng)對(duì)非生物脅迫的機(jī)制
        1.4.3 棉花非生物脅迫抗性的研究進(jìn)展
    1.5 本研究的目的意義
第2章 陸地棉FAD基因家族的鑒定和結(jié)構(gòu)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 全基因組鑒定和序列檢索
        2.1.2 序列比對(duì)和進(jìn)化樹構(gòu)建
        2.1.3 染色體定位和基因復(fù)制事件
        2.1.4 基因結(jié)構(gòu)分析
        2.1.5 復(fù)制基因?qū)a/Ks估算
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 陸地棉FAD基因的鑒定
        2.2.2 陸地棉FAD基因的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
        2.2.3 陸地棉FAD基因的染色體定位
        2.2.4 陸地棉FAD基因的同源性及復(fù)制分析
        2.2.5 陸地棉FAD基因結(jié)構(gòu)分析
        2.2.6 陸地棉FAD復(fù)制基因?qū)a/Ks分析
    2.3 討論
    2.4 本章小結(jié)
第3章 陸地棉FAD基因家族的表達(dá)特征
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 RNA提取
        3.1.3 反轉(zhuǎn)錄
        3.1.4 引物設(shè)計(jì)
        3.1.5 特異性檢測(cè)
        3.1.6 qRT-PCR分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 陸地棉FAD基因在不同品種中的表達(dá)
        3.2.2 陸地棉FAD基因在不同器官中的表達(dá)
        3.2.3 陸地棉FAD基因在不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)
    3.3 討論
    3.4 本章小結(jié)
第4章 陸地棉FAD基因家族在非生物逆境脅迫下的表達(dá)特征
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 RNA提取及qRT-PCR分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 陸地棉FAD基因在鹽脅迫下的表達(dá)
        4.2.2 陸地棉FAD基因在冷害脅迫下的表達(dá)
    4.3 討論
    4.4 本章小結(jié)
第5章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棉花植物同源結(jié)構(gòu)域(PHD)轉(zhuǎn)錄因子在非生物脅迫中的表達(dá)分析[J]. 楊雷,謝宗銘,司愛君,田琴.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(03)
[2]棉仁高油分材料篩選及其脂肪酸發(fā)育分析[J]. 宋俊喬,孫培均,張霞,張獻(xiàn)龍,聶以春,郭小平,朱龍付.  棉花學(xué)報(bào). 2010(04)
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[5]脂肪酸脫氫酶研究進(jìn)展[J]. 李冠,杜鈺,黃瓊,李金玉.  食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2007(02)
[6]植物非生物脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制[J]. 楊獻(xiàn)光,梁衛(wèi)紅,齊志廣,馬聞師,沈銀柱.  麥類作物學(xué)報(bào). 2006(06)
[7]鹽害生理與植物抗鹽性[J]. 曾洪學(xué),王俊.  生物學(xué)通報(bào). 2005(09)
[8]植物逆境生理研究進(jìn)展[J]. 喻方圓,徐錫增.  世界林業(yè)研究. 2003(05)
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[10]低溫脅迫對(duì)溫州蜜柑光合作用的影響[J]. 郭延平,張良誠,沈允鋼.  園藝學(xué)報(bào). 1998(02)

博士論文
[1]兩個(gè)二倍體棉種CDPK和FAD基因家族的全基因組鑒定與基因結(jié)構(gòu)功能分析[D]. 劉偉.浙江大學(xué) 2015

碩士論文
[1]玉米全基因組CCCH鋅指蛋白基因家族進(jìn)化分析[D]. 彭曉劍.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào):3644492

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