聯(lián)合利用Illumina 90K SNP芯片和毛細(xì)管高通量SSR檢測(cè)技術(shù),構(gòu)建75份育成品種384個(gè)SNP和42個(gè)SSR位點(diǎn)的指紋圖譜,比較兩種標(biāo)記在遺傳多樣性、遺傳相似系數(shù)和鑒別能力等方面的特征。結(jié)果顯示,SNP標(biāo)記揭示的遺傳多樣性指數(shù)明顯低于SSR標(biāo)記,但能較好地反映品種間的遺傳多樣性;SNP標(biāo)記揭示的遺傳相似系數(shù)明顯高于SSR標(biāo)記,但兩者呈極顯著線性相關(guān);384個(gè)SNP位點(diǎn)鑒定近等基因系的能力低于42個(gè)SSR位點(diǎn),但去除近等基因系后,僅需8個(gè)SNP或4個(gè)SSR位點(diǎn)組合即可區(qū)分剩余的74份品種,表明最優(yōu)位點(diǎn)組合具有較高的鑒定效率,在品種鑒定時(shí)可先采用少量標(biāo)記進(jìn)行初鑒,對(duì)于極近似品種可加大標(biāo)記密度。首次結(jié)合SSR和SNP標(biāo)記構(gòu)建指紋圖譜,證實(shí)了兩者之間的一致性,提出了分子身份鑒定技術(shù)標(biāo)記數(shù)量的選擇思路,為小麥品種DNA身份鑒定技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)制定提供了重要的參考依據(jù)。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2020,22(05)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 基因組DNA提取
    1.3 SNP基因分型
    1.4 SSR基因分型
    1.5 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果分析
    2.1 適于指紋圖譜構(gòu)建的SNP位點(diǎn)組合篩選
        2.1.1 SNP位點(diǎn)的篩選
        2.1.2 SNP位點(diǎn)的分布
        2.1.3 SNP位點(diǎn)的多態(tài)性分析
    2.2 SSR和SNP標(biāo)記指紋圖譜分析
    2.3 基于SNP和SSR標(biāo)記的遺傳多樣性比較
    2.4 基于SNP和SSR標(biāo)記的的遺傳相似系數(shù)比較
        2.4.1 遺傳相似系數(shù)比較
        2.4.2 遺傳相似系數(shù)相關(guān)性分析
        2.4.3 聚類(lèi)分析
    2.5 兩種標(biāo)記的鑒別能力比較
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]適于陸地棉品種身份鑒定的SNP核心位點(diǎn)篩選與評(píng)價(jià)[J]. 朱國(guó)忠,張芳,付潔,李樂(lè)晨,牛二利,郭旺珍.  作物學(xué)報(bào). 2018(11)
[2]利用SNP芯片構(gòu)建我國(guó)冬油菜參試品種DNA指紋圖譜[J]. 趙仁欣,李森業(yè),郭瑞星,曾新華,文靜,馬朝芝,沈金雄,涂金星,傅廷棟,易斌.  作物學(xué)報(bào). 2018(07)
[3]應(yīng)用SNP精準(zhǔn)鑒定大豆種質(zhì)及構(gòu)建可掃描身份證[J]. 魏中艷,李慧慧,李駿,Yasir A.Gamar,馬巖松,邱麗娟.  作物學(xué)報(bào). 2018(03)
[4]我國(guó)玉米品種標(biāo)準(zhǔn)DNA指紋庫(kù)構(gòu)建研究及應(yīng)用進(jìn)展[J]. 趙久然,王鳳格,易紅梅,田紅麗,楊揚(yáng).  作物雜志. 2015(02)
[5]河南省近年審定小麥品種基于系譜和SNP標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 曹廷杰,謝菁忠,吳秋紅,陳永興,王振忠,趙虹,王西成,詹克慧,徐如強(qiáng),王際睿,羅明成,劉志勇.  作物學(xué)報(bào). 2015(02)



本文編號(hào)：3632138