陸地棉與達(dá)爾文氏棉種間BC 1 群體遺傳圖譜構(gòu)建
發(fā)布時間:2022-01-11 13:22
棉花是重要的天然纖維作物,可以提供優(yōu)質(zhì)天然纖維、高質(zhì)量蛋白及油份,涉及我國近兩億人的經(jīng)濟來源。陸地棉生產(chǎn)了世界95%以上的原棉,雖然經(jīng)過長期的人工選擇培育出了產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病蟲等綜合性狀優(yōu)良的品種,但是陸地棉遺傳基礎(chǔ)相對狹窄,在育種過程中亟需引入野生棉種優(yōu)良性狀,對其品質(zhì)進一步改良。棉花野生種在長期的自然選擇下,進化獲得了大量的優(yōu)良性狀(如抗逆、廣適性等),并且四倍體野生棉種與栽培種陸地棉雜交能夠得到可育后代。達(dá)爾文氏棉是一種野生四倍體棉,具有纖維細(xì)度好、耐旱、抗線蟲及抗枯黃萎的特性,可用于陸地棉栽培種綜合性狀改良。遺傳連鎖圖譜不僅可以用于研究基因組的結(jié)構(gòu)和變異,還可以用于QTL定位、圖位克隆、以及分子標(biāo)記輔助育種等。構(gòu)建陸地棉與野生棉雜交群體遺傳圖譜對鑒定野生棉有利等位基因、分子標(biāo)記輔助育種有著重要的意義。本研究以中棉所35號與達(dá)爾文氏棉建立的BC1為作圖群體,利用已發(fā)表的陸地棉達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜及本實驗室構(gòu)建的陸海種間遺傳圖譜上的標(biāo)記,構(gòu)建陸地棉與達(dá)爾文氏棉種間分子遺傳連鎖圖譜。主要研究結(jié)果如下:1.SSR引物多態(tài)性篩選利用3472對SSR引物對親本中棉所35號及達(dá)爾文氏棉進行...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SSR引物在陸地棉品種中棉所35與達(dá)爾文氏棉間的多態(tài)性
圖 4-2 SSR 標(biāo)記 CCRI 2517 在 BC1群體中的分離Figure 4-2 Segregation of SSR marker CCRI 2517 in BC1populationP1:中棉所 35;P2:達(dá)爾文氏棉;1-46:單株 1-46;P1: CCRI 35; P2: G. darwinii; 1-46: individual 1-464.3 標(biāo)記偏分離檢測將 1095 個標(biāo)記位點進行 χ2檢測,其中 157 個位點偏離孟德爾 1:1 分離比例(P<0.05),占總位點數(shù)的 14.34%。其中,輕微偏分離(χ2>3.84,P<0.05)占6.21%,中度偏分離(χ2>6.64,P<0.01)占 4.75%,重度偏分離(χ2>10.83,P<0.001)占 3.38%(表 4-2)。表 4-2 標(biāo)記位點偏分離統(tǒng)計Table 4-2 Statistics of marker locus detected deviation from Mendel偏分離程度 數(shù)量 Number 占比 Ration輕微偏分離 *Slight segregation Distortion68 6.21%
圖 4-4 種間遺傳圖譜與物理圖譜間共線性分析Figure 4-4 Analysis of Collinearity between Genetic Map and Physical Map
【參考文獻】:
期刊論文
[1]近5年毛棉考察總結(jié)[J]. 王坤波,劉方,周忠麗,王星星,王春英,黎紹惠. 中國棉花. 2016(06)
[2]棉籽油加工及其營養(yǎng)[J]. 劉大川. 中國油脂. 2012(11)
[3]棉花資源收集、保存、評價與利用現(xiàn)狀及未來[J]. 杜雄明,孫君靈,周忠麗,賈銀華,潘兆娥,何守樸,龐保印,王立如. 植物遺傳資源學(xué)報. 2012(02)
[4]夏威夷毛棉考察簡報[J]. 王坤波,文學(xué),黎紹惠,朱蕓. 中國棉花. 2011(12)
[5]A SSR Linkage Map of Maizex Teosinte F2 Population and Analysis of Segregation Distortion[J]. ZHOU Jun-qing1*,GUO Yu-qiu1*,GAO Yu-feng1,LI Jian-sheng1 and YAN Jian-bing1,2 1 National Maize Improvement Center of China,China Agricultural University,Beijing 100193,P.R.China 2 International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT),Mexico D.F.06600,Mexico. Agricultural Sciences in China. 2011(02)
[6]中國棉花生產(chǎn)與政策60年[J]. 馬淑萍,王戈,龍熹. 中國棉花. 2009(09)
[7]中國棉花生產(chǎn)中存在的主要問題及建議[J]. 王延琴,楊偉華,許紅霞,周大云,馮新愛,匡猛. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(14)
[8]墨西哥野生棉種質(zhì)資源考察[J]. 黃駿麒,肖松華,周寶良. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[9]陸地棉遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風(fēng)敏,馬靖. 作物學(xué)報. 2008(07)
[10]美國棉花資源現(xiàn)狀[J]. 王坤波. 中國棉花. 2008(06)
博士論文
[1]陸地棉×黃褐棉種間全基因組SSR高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]陸地棉×毛棉種間高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]達(dá)爾文氏棉旱脅迫轉(zhuǎn)錄組測序、EST-SSR開發(fā)及高密度遺傳圖譜構(gòu)建[D]. 陳浩東.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[4]棉屬21個種基于原位雜交的核型分析[D]. 王坤波.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[5]海島棉EST-SSR引物的遺傳評價及海陸棉種間高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與QTL定位[D]. 張艷欣.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]陸地棉和達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜構(gòu)建及優(yōu)異材料創(chuàng)制[D]. 蘭倩倩.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3582852
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SSR引物在陸地棉品種中棉所35與達(dá)爾文氏棉間的多態(tài)性
圖 4-2 SSR 標(biāo)記 CCRI 2517 在 BC1群體中的分離Figure 4-2 Segregation of SSR marker CCRI 2517 in BC1populationP1:中棉所 35;P2:達(dá)爾文氏棉;1-46:單株 1-46;P1: CCRI 35; P2: G. darwinii; 1-46: individual 1-464.3 標(biāo)記偏分離檢測將 1095 個標(biāo)記位點進行 χ2檢測,其中 157 個位點偏離孟德爾 1:1 分離比例(P<0.05),占總位點數(shù)的 14.34%。其中,輕微偏分離(χ2>3.84,P<0.05)占6.21%,中度偏分離(χ2>6.64,P<0.01)占 4.75%,重度偏分離(χ2>10.83,P<0.001)占 3.38%(表 4-2)。表 4-2 標(biāo)記位點偏分離統(tǒng)計Table 4-2 Statistics of marker locus detected deviation from Mendel偏分離程度 數(shù)量 Number 占比 Ration輕微偏分離 *Slight segregation Distortion68 6.21%
圖 4-4 種間遺傳圖譜與物理圖譜間共線性分析Figure 4-4 Analysis of Collinearity between Genetic Map and Physical Map
【參考文獻】:
期刊論文
[1]近5年毛棉考察總結(jié)[J]. 王坤波,劉方,周忠麗,王星星,王春英,黎紹惠. 中國棉花. 2016(06)
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[4]夏威夷毛棉考察簡報[J]. 王坤波,文學(xué),黎紹惠,朱蕓. 中國棉花. 2011(12)
[5]A SSR Linkage Map of Maizex Teosinte F2 Population and Analysis of Segregation Distortion[J]. ZHOU Jun-qing1*,GUO Yu-qiu1*,GAO Yu-feng1,LI Jian-sheng1 and YAN Jian-bing1,2 1 National Maize Improvement Center of China,China Agricultural University,Beijing 100193,P.R.China 2 International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT),Mexico D.F.06600,Mexico. Agricultural Sciences in China. 2011(02)
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[7]中國棉花生產(chǎn)中存在的主要問題及建議[J]. 王延琴,楊偉華,許紅霞,周大云,馮新愛,匡猛. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(14)
[8]墨西哥野生棉種質(zhì)資源考察[J]. 黃駿麒,肖松華,周寶良. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[9]陸地棉遺傳圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量和纖維品質(zhì)性狀QTL定位[J]. 陳利,張正圣,胡美純,王威,張建,劉大軍,鄭靚,鄭風(fēng)敏,馬靖. 作物學(xué)報. 2008(07)
[10]美國棉花資源現(xiàn)狀[J]. 王坤波. 中國棉花. 2008(06)
博士論文
[1]陸地棉×黃褐棉種間全基因組SSR高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]陸地棉×毛棉種間高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]達(dá)爾文氏棉旱脅迫轉(zhuǎn)錄組測序、EST-SSR開發(fā)及高密度遺傳圖譜構(gòu)建[D]. 陳浩東.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[4]棉屬21個種基于原位雜交的核型分析[D]. 王坤波.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[5]海島棉EST-SSR引物的遺傳評價及海陸棉種間高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與QTL定位[D]. 張艷欣.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]陸地棉和達(dá)爾文氏棉種間遺傳圖譜構(gòu)建及優(yōu)異材料創(chuàng)制[D]. 蘭倩倩.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3582852
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