磷脂酶D（Phospholipase D,PLD）是植物體內(nèi)最主要的一類磷脂水解酶,它可以特異性地催化磷脂分子末端的磷酸二酯鍵水解,產(chǎn)生磷脂酸和一個自由基團,如膽堿、乙胺醇等。植物PLD調(diào)節(jié)細胞膜脂質(zhì)代謝,并參與生長發(fā)育和脅迫響應(yīng)等多種生理過程。目前,棉花PLD基因家族組成和分子特征的研究尚無報道,其在纖維發(fā)育中的作用也未被揭示。本研究首次在全基因組水平上解析了棉花PLD基因家族,并對其重要成員GhPLDα1在纖維細胞次生壁增厚中的作用進行了分析。首先,本研究從陸地棉（Gossypium hirsutum）、雷蒙德氏棉（Gossypium raimondii）和亞洲棉（Gossypium arboreum）中分別鑒定到40、20和19個PLD基因（GhPLD、Gr PLD和GaPLD）。系統(tǒng)進化樹分析表明,這些PLD基因可被分為α、β/γ、δ、ε、ζ和φ等6個不均等的亞組。同一亞組的棉花PLD基因具有相似的內(nèi)含子-外顯子組成,其氨基酸序列具有相同的功能結(jié)構(gòu)域組成并含有亞組特異性的保守氨基酸位點。三種棉花PLD基因家族擴張過程中共發(fā)生了16次基因片段復(fù)制事件和3次基因串聯(lián)復(fù)制事件,所有復(fù)... 

【文章來源】：清華大學北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：博士

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磷脂分子發(fā)生水解反應(yīng)的位置特異性（Chenetal.,2011）

圖 1.2 擬南芥 PLD 的結(jié)構(gòu)域組成 （Wang et al., 2014）2 是指 Ca2+依賴性的磷脂結(jié)合結(jié)構(gòu)域。PH 是指 pleckstrin 同源結(jié)構(gòu)域。PX 是指域。HKD 是指 HxKxxxxD 結(jié)構(gòu)域，它是 PLD 催化磷脂水解反應(yīng)的活性中心。 G 蛋白發(fā)生相互作用的結(jié)構(gòu)域。值得注意的是，不同的配體結(jié)合基序已經(jīng)在相 家族成員中被實驗所驗證。

圖 1.3 植物 PLD 行使信號傳導功能的分子機制模型 （Wang et al., 2014）植物 PLD 行使信號傳導功能的分子機制模型可以分為以下幾類：（1）PLD 通過其產(chǎn)A 與 PDK1（磷酸肌醇依賴的蛋白激酶 1）、MPK6（促分裂原活化蛋白激酶 6）、PEPC（烯醇式丙酮酸）等下游靶蛋白結(jié)合，發(fā)揮調(diào)控作用。（2）PLD 與 GAPC（細胞質(zhì)甘油醛酶）、G 蛋白、actin（肌動蛋白）等效應(yīng)蛋白直接結(jié)合，發(fā)揮調(diào)控作用。（3）PLD 通產(chǎn)物 PA 與 SPHK（鞘氨醇激酶）等蛋白結(jié)合，從而使 PLD 與 SPHK/phyto-S1P（鞘氨醇

【參考文獻】：
期刊論文
[1]SCFP, a novel fiber-specific promoter in cotton[J]. HOU Lei, LIU Hao, LI JiaBao, YANG Xia, XIAO YueHua, LUO Ming, SONG ShuiQing, YANG GuangWei & PEI Yan↑ Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement of the Ministry of Agriculture, Biotechnology Research Center, Southwest University, Chongqing 400716, China.  Chinese Science Bulletin. 2008(17)
[2]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong.  Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)



本文編號：3547889