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棉花磷脂酶D基因家族的分子特征及其GhPLDα1功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-12-23 05:35
  磷脂酶D(Phospholipase D,PLD)是植物體內(nèi)最主要的一類(lèi)磷脂水解酶,它可以特異性地催化磷脂分子末端的磷酸二酯鍵水解,產(chǎn)生磷脂酸和一個(gè)自由基團(tuán),如膽堿、乙胺醇等。植物PLD調(diào)節(jié)細(xì)胞膜脂質(zhì)代謝,并參與生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫響應(yīng)等多種生理過(guò)程。目前,棉花PLD基因家族組成和分子特征的研究尚無(wú)報(bào)道,其在纖維發(fā)育中的作用也未被揭示。本研究首次在全基因組水平上解析了棉花PLD基因家族,并對(duì)其重要成員GhPLDα1在纖維細(xì)胞次生壁增厚中的作用進(jìn)行了分析。首先,本研究從陸地棉(Gossypium hirsutum)、雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)和亞洲棉(Gossypium arboreum)中分別鑒定到40、20和19個(gè)PLD基因(GhPLD、Gr PLD和GaPLD)。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,這些PLD基因可被分為α、β/γ、δ、ε、ζ和φ等6個(gè)不均等的亞組。同一亞組的棉花PLD基因具有相似的內(nèi)含子-外顯子組成,其氨基酸序列具有相同的功能結(jié)構(gòu)域組成并含有亞組特異性的保守氨基酸位點(diǎn)。三種棉花PLD基因家族擴(kuò)張過(guò)程中共發(fā)生了16次基因片段復(fù)制事件和3次基因串聯(lián)復(fù)制事件,所有復(fù)... 

【文章來(lái)源】:清華大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:110 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

棉花磷脂酶D基因家族的分子特征及其GhPLDα1功能分析


磷脂分子發(fā)生水解反應(yīng)的位置特異性(Chenetal.,2011)

結(jié)構(gòu)域,擬南芥


圖 1.2 擬南芥 PLD 的結(jié)構(gòu)域組成 (Wang et al., 2014)2 是指 Ca2+依賴性的磷脂結(jié)合結(jié)構(gòu)域。PH 是指 pleckstrin 同源結(jié)構(gòu)域。PX 是指域。HKD 是指 HxKxxxxD 結(jié)構(gòu)域,它是 PLD 催化磷脂水解反應(yīng)的活性中心。 G 蛋白發(fā)生相互作用的結(jié)構(gòu)域。值得注意的是,不同的配體結(jié)合基序已經(jīng)在相 家族成員中被實(shí)驗(yàn)所驗(yàn)證。

模型圖,信號(hào)傳導(dǎo),分子機(jī)制,植物


圖 1.3 植物 PLD 行使信號(hào)傳導(dǎo)功能的分子機(jī)制模型 (Wang et al., 2014)植物 PLD 行使信號(hào)傳導(dǎo)功能的分子機(jī)制模型可以分為以下幾類(lèi):(1)PLD 通過(guò)其產(chǎn)A 與 PDK1(磷酸肌醇依賴的蛋白激酶 1)、MPK6(促分裂原活化蛋白激酶 6)、PEPC(烯醇式丙酮酸)等下游靶蛋白結(jié)合,發(fā)揮調(diào)控作用。(2)PLD 與 GAPC(細(xì)胞質(zhì)甘油醛酶)、G 蛋白、actin(肌動(dòng)蛋白)等效應(yīng)蛋白直接結(jié)合,發(fā)揮調(diào)控作用。(3)PLD 通產(chǎn)物 PA 與 SPHK(鞘氨醇激酶)等蛋白結(jié)合,從而使 PLD 與 SPHK/phyto-S1P(鞘氨醇

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SCFP, a novel fiber-specific promoter in cotton[J]. HOU Lei, LIU Hao, LI JiaBao, YANG Xia, XIAO YueHua, LUO Ming, SONG ShuiQing, YANG GuangWei & PEI Yan↑ Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement of the Ministry of Agriculture, Biotechnology Research Center, Southwest University, Chongqing 400716, China.  Chinese Science Bulletin. 2008(17)
[2]KaKsCalculator:Calculating Ka and Ks Through Model Selection and Model Averaging[J]. Gane Ka-Shu Wong.  Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2006(04)



本文編號(hào):3547889

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