轉(zhuǎn)錄組測序輔助預測甘藍型油菜黃籽基因
發(fā)布時間:2021-10-26 16:40
油菜的抗逆性強,適應范圍廣,是我國區(qū)域分布最廣的油料作物。與黑籽相比,黃籽油菜具有含油量高、蛋白質(zhì)含量高、纖維素和多酚含量低、油質(zhì)清亮等優(yōu)點。油菜的種皮顏色受多基因控制,黑籽一般為顯性,多個位點都為隱性純合時才表現(xiàn)為黃籽,所以選育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的黃籽甘藍型油菜品種非常困難。人工合成的甘藍型油菜品系No.2127-17的籽粒純黃,其黃籽性狀受一對不完全顯性基因控制,這種遺傳模式明顯不同于油菜中的其它黃籽材料。前期的研究中,我們完成了顯性黃籽基因的精細定位。本研究中,我們對黃籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黃籽近等基因系ZY821(Y)進行了轉(zhuǎn)錄組測序,旨在闡明該基因控制的代謝途徑及其調(diào)控規(guī)律,并結(jié)合定位結(jié)果、qRT-PCR結(jié)果以及BAC序列鑒定黃籽候選基因,為最終克隆到該黃籽基因提供依據(jù)。本研究主要結(jié)果如下:1.對黃籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黃籽近等基因系ZY821(Y)開花后12天(12DAP)、19天(19DAP)、26天(26DAP)和33天(33DAP)的種皮進行轉(zhuǎn)錄組測序。分析發(fā)現(xiàn),各個時間點的差異表達基因都極特異的聚類在類黃酮合成相關通路中...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
珠被在甘藍型油菜種子發(fā)育過程中的分化(Nesietal2009)
轉(zhuǎn)錄組測序輔助預測甘藍型油菜黃籽基因種皮顏色有很大影響,而棕色種皮中不含山奈酚。唐志東(2013)通過CMS-IT-TOF定性檢測四川黃籽及其黑籽近等基因系種皮中類黃酮提取物的種,發(fā)現(xiàn)楊梅酮、茶黃素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某種衍生物和表兒茶素5種類黃酮只存在于黑籽種皮中,表明這幾種物質(zhì)可能是黑籽與黃籽間種皮差異形成的決定性色素。雖然對于影響種皮顏色的色素物質(zhì)仍有爭論,但現(xiàn)在研究人員普遍認為影皮顏色形成的主要是類黃酮類化合物,并且對油菜種子發(fā)育時期類黃酮代謝究主要集中在PA的積累。
圖 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material試劑試劑: 連接酶(New England Biolabs)s 高保真酶(TOYOBO)aster Mix(Vazyme)(Monad)取試劑盒(Tiangen)劑盒(Qiagene)劑盒(Thermo Fisher Scientific)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]腫瘤抑制因子CYLD與泛素化及相關疾病研究進展[J]. 蔣佳純,張澄,葉孟. 現(xiàn)代實用醫(yī)學. 2014(01)
[2]依托科技創(chuàng)新與服務加快油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變[J]. 官春云. 湖南農(nóng)業(yè)大學學報(社會科學版). 2010(04)
[3]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的歷史回顧與展望[J]. 王漢中. 中國油料作物學報. 2010(02)
[4]甘藍型油菜粒色與含油量的研究[J]. 薛漢軍,孫利軍,梁升平,白紅濤,董振生,蘇波. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2010(01)
[5]芥菜型油菜黃黑種皮色澤特征的分析化學研究[J]. 曾盔,劉忠松,嚴明理,曾笑. 中國油料作物學報. 2006(04)
[6]甘藍型黑籽和黃籽油菜種子發(fā)育過程中種皮色澤差異研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的變化及相關性[J]. 葉小利,李加納,唐章林,諶利. 中國油料作物學報. 2001(03)
[7]甘藍型油菜黃籽和黑籽皮殼中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的變異[J]. 王漢中,劉后利. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 1996(06)
[8]甘藍型油菜種子發(fā)育過程中種皮顏色變化[J]. 陳玉萍,劉后利. 中國油料. 1995(02)
[9]甘藍型黃籽油菜的遺傳研究[J]. 劉后利. 作物學報. 1992(04)
[10]油菜皮殼中多酚氧化酶活性的組織化學檢定及其與粒色的關系[J]. 王漢中,劉后利. 中國油料. 1991(01)
博士論文
[1]基于RNAi揭示BnTT1參與油菜種子發(fā)育與代謝的功能特征[D]. 練劍平.西南大學 2017
[2]甘藍籽粒色澤的遺傳及其與甘藍型油菜的比較[D]. 唐章林.西南大學 2012
碩士論文
[1]基于高通量表型檢測平臺解析甘藍型油菜表型性狀的遺傳基礎[D]. 楊山井.華中農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]延邊黃牛和韓延牛血液外胞體中miRNA的差異表達分析[D]. 張睿.延邊大學 2018
[3]芥菜型油菜黃籽基因定位及其功能驗證[D]. 王陽.西北農(nóng)林科技大學 2018
[4]BnaA.BAN.a調(diào)控甘藍型油菜種皮色素成分的研究[D]. 朱寶.揚州大學 2016
[5]人工合成甘藍型油菜的創(chuàng)建及其表觀遺傳分析[D]. 孔月琴.揚州大學 2015
[6]油菜莢果轉(zhuǎn)錄組測序分析及油分相關候選基因的鑒別[D]. 孔祥東.浙江大學 2015
[7]油菜種皮顏色與含油量、色素含量的關系研究[D]. 唐志東.湖南農(nóng)業(yè)大學 2013
[8]人工合成甘藍型黃籽油菜No.2127-17粒色基因差異表達研究[D]. 陳麗.華中農(nóng)業(yè)大學 2010
[9]甘藍型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學研究[D]. 黃華磊.西南大學 2007
[10]甘藍型油菜編碼WIP-鋅指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黃、黑籽之間的差異表達[D]. 路小春.云南農(nóng)業(yè)大學 2006
本文編號:3459844
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
珠被在甘藍型油菜種子發(fā)育過程中的分化(Nesietal2009)
轉(zhuǎn)錄組測序輔助預測甘藍型油菜黃籽基因種皮顏色有很大影響,而棕色種皮中不含山奈酚。唐志東(2013)通過CMS-IT-TOF定性檢測四川黃籽及其黑籽近等基因系種皮中類黃酮提取物的種,發(fā)現(xiàn)楊梅酮、茶黃素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某種衍生物和表兒茶素5種類黃酮只存在于黑籽種皮中,表明這幾種物質(zhì)可能是黑籽與黃籽間種皮差異形成的決定性色素。雖然對于影響種皮顏色的色素物質(zhì)仍有爭論,但現(xiàn)在研究人員普遍認為影皮顏色形成的主要是類黃酮類化合物,并且對油菜種子發(fā)育時期類黃酮代謝究主要集中在PA的積累。
圖 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material試劑試劑: 連接酶(New England Biolabs)s 高保真酶(TOYOBO)aster Mix(Vazyme)(Monad)取試劑盒(Tiangen)劑盒(Qiagene)劑盒(Thermo Fisher Scientific)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]腫瘤抑制因子CYLD與泛素化及相關疾病研究進展[J]. 蔣佳純,張澄,葉孟. 現(xiàn)代實用醫(yī)學. 2014(01)
[2]依托科技創(chuàng)新與服務加快油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變[J]. 官春云. 湖南農(nóng)業(yè)大學學報(社會科學版). 2010(04)
[3]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的歷史回顧與展望[J]. 王漢中. 中國油料作物學報. 2010(02)
[4]甘藍型油菜粒色與含油量的研究[J]. 薛漢軍,孫利軍,梁升平,白紅濤,董振生,蘇波. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2010(01)
[5]芥菜型油菜黃黑種皮色澤特征的分析化學研究[J]. 曾盔,劉忠松,嚴明理,曾笑. 中國油料作物學報. 2006(04)
[6]甘藍型黑籽和黃籽油菜種子發(fā)育過程中種皮色澤差異研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的變化及相關性[J]. 葉小利,李加納,唐章林,諶利. 中國油料作物學報. 2001(03)
[7]甘藍型油菜黃籽和黑籽皮殼中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的變異[J]. 王漢中,劉后利. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 1996(06)
[8]甘藍型油菜種子發(fā)育過程中種皮顏色變化[J]. 陳玉萍,劉后利. 中國油料. 1995(02)
[9]甘藍型黃籽油菜的遺傳研究[J]. 劉后利. 作物學報. 1992(04)
[10]油菜皮殼中多酚氧化酶活性的組織化學檢定及其與粒色的關系[J]. 王漢中,劉后利. 中國油料. 1991(01)
博士論文
[1]基于RNAi揭示BnTT1參與油菜種子發(fā)育與代謝的功能特征[D]. 練劍平.西南大學 2017
[2]甘藍籽粒色澤的遺傳及其與甘藍型油菜的比較[D]. 唐章林.西南大學 2012
碩士論文
[1]基于高通量表型檢測平臺解析甘藍型油菜表型性狀的遺傳基礎[D]. 楊山井.華中農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]延邊黃牛和韓延牛血液外胞體中miRNA的差異表達分析[D]. 張睿.延邊大學 2018
[3]芥菜型油菜黃籽基因定位及其功能驗證[D]. 王陽.西北農(nóng)林科技大學 2018
[4]BnaA.BAN.a調(diào)控甘藍型油菜種皮色素成分的研究[D]. 朱寶.揚州大學 2016
[5]人工合成甘藍型油菜的創(chuàng)建及其表觀遺傳分析[D]. 孔月琴.揚州大學 2015
[6]油菜莢果轉(zhuǎn)錄組測序分析及油分相關候選基因的鑒別[D]. 孔祥東.浙江大學 2015
[7]油菜種皮顏色與含油量、色素含量的關系研究[D]. 唐志東.湖南農(nóng)業(yè)大學 2013
[8]人工合成甘藍型黃籽油菜No.2127-17粒色基因差異表達研究[D]. 陳麗.華中農(nóng)業(yè)大學 2010
[9]甘藍型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學研究[D]. 黃華磊.西南大學 2007
[10]甘藍型油菜編碼WIP-鋅指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黃、黑籽之間的差異表達[D]. 路小春.云南農(nóng)業(yè)大學 2006
本文編號:3459844
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