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基于玉米野生近緣種大芻草滲入系群體的出苗率QTL定位分析

發(fā)布時間:2021-10-09 13:28
  玉米出苗率不僅受溫度、水分等外部環(huán)境因素的影響,同時也受到內(nèi)部遺傳因素的控制,直接影響玉米產(chǎn)量,是玉米育種重要的目標(biāo)性狀之一。本研究利用一套以玉米野生近緣種大芻草(Zea mays ssp. Parviglumis Iltis&Doebley)為供體親本,現(xiàn)代玉米自交系W22為受體親本構(gòu)建的包含866個家系的滲入系群體,結(jié)合均勻覆蓋玉米全基因組的19838個SNP分子標(biāo)記,采用R/qtl的多QTL模型對玉米出苗率進(jìn)行高精度的QTL定位分析。結(jié)果共檢測到3個控制玉米出苗率的QTL:qFGR4-1、qFGR5-1和qFGR8-1,分別位于第4、5和8染色體,兩側(cè)的分子標(biāo)記分別為m20780與m21277、m29418與m29680、m44383與m44706。3個QTL共解釋11.2%的表型變異,單個QTL表型貢獻(xiàn)率的變幅為2.8%~4.8%,加性效應(yīng)的變幅為4.5%~7.4%,表明玉米出苗率屬于典型的數(shù)量性狀,由微效多基因控制。3個QTL均來自W22的等位基因增加出苗率,表明玉米出苗率在玉米長期馴化和改良過程中可能受到定向選擇。本研究為進(jìn)一步解析玉米出苗率的遺傳基礎(chǔ),克隆相關(guān)基因... 

【文章來源】:植物遺傳資源學(xué)報. 2020,21(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

基于玉米野生近緣種大芻草滲入系群體的出苗率QTL定位分析


滲入系群體出苗率表型變異

出苗率,群體,圖譜,性狀


利用R/qtl的多QTL模型對滲入系群體出苗率性狀進(jìn)行QTL定位分析,采用置換檢驗10000次的方法確定QTL定位的LOD閾值為4.19,共檢測到3個出苗率QTL,分別位于第4、5和8染色體(圖2),表明玉米出苗率性狀由多基因控制。檢測到的3個出苗率QTL分別為q FGR4-1、q FGR5-1和q FGR8-1,位于第4、5和8染色體,LOD峰值下降1.5的置信區(qū)間兩側(cè)的分子標(biāo)記分別為m20780與m21277、m29418與m29680、m44383與m44706,單個QTL的LOD峰值為5.41~9.38,加性效應(yīng)大小為4.5%~7.4%,可解釋的表型變異為2.8%~4.8%,沒有檢測到表型貢獻(xiàn)率超過10%的主效QTL,表明玉米出苗率性狀是由微效多基因控制的數(shù)量性狀(表1)。

表型,位點,基因,效應(yīng)


根據(jù)玉米B73參考基因組數(shù)據(jù)庫(https://www.maizegdb.org/),在5號染色體q FGR5-1置信區(qū)間內(nèi)共檢索到187個基因,其中可能的候選基因有15個(表2):分別有植物激素相關(guān)基因(Zm00001d016838、Zm00001d016895、Zm00001d016896、Zm00001d016910、Zm00001d016924)、轉(zhuǎn)錄因子基因(Zm00001d016732、Zm00001d016791、Zm00001d016814、Zm00001d016873)、酶類基因(Zm00001d016759、Zm00001d016765、Zm00001d016846、Zm00001d016901、Zm00001d016942)及蔗糖轉(zhuǎn)運基因(Zm00001d016938)。植物激素相關(guān)基因、轉(zhuǎn)錄因子基因、酶類基因和蔗糖轉(zhuǎn)運基因在種子萌發(fā)和幼苗生長發(fā)育過程中發(fā)揮了重要作用,但相關(guān)基因的生物學(xué)功能仍有待進(jìn)一步研究和證實。3 討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同玉米自交系耐深播能力分析[J]. 李月明,孫麗惠,郝楠,馬云祥,畢文博,孫楠,王延波.  種子. 2017(06)
[2]中國玉米栽培研究進(jìn)展與展望[J]. 李少昆,趙久然,董樹亭,趙明,李潮海,崔彥宏,劉永紅,高聚林,薛吉全,王立春,王璞,陸衛(wèi)平,王俊河,楊祁峰,王子明.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(11)
[3]Identification and fine mapping of quantitative trait loci for the number of vascular bundle in maize stem[J]. Cheng Huang,Qiuyue Chen,Guanghui Xu,Dingyi Xu,Jinge Tian,Feng Tian.  Journal of Integrative Plant Biology. 2016(01)



本文編號:3426477

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