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蓖麻胚與胚愈傷基因組甲基化的變化及和差異表達(dá)基因的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-09-22 11:59
  DNA甲基化是一種重要的表觀修飾,有一定的保守性。在植物中,DNA甲基化能夠穩(wěn)定地遺傳,同時(shí)也有組織特異性以及發(fā)育階段特異性。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),植物細(xì)胞在不同組織分化后基因組DNA甲基化經(jīng)常會(huì)發(fā)生一定變化。然而,植物細(xì)胞在分化或脫分化過程中基因組DNA甲基化的變化規(guī)律及其對(duì)基因表達(dá)影響等方面的研究非常有限,而且不同植物基因組DNA甲基化的式樣有一定的物種特異性,這些物種特異性在細(xì)胞分化或脫分化過程中對(duì)基因表達(dá)是否有影響一直缺乏關(guān)注。本實(shí)驗(yàn)以典型的油料種子植物蓖麻為實(shí)驗(yàn)材料,以胚和胚誘導(dǎo)愈傷為材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組全基因組DNA甲基化的高通量測(cè)序,以期探索蓖麻組培過程中DNA甲基化的改變模式,及其對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控。這不但增加了對(duì)不同植物組織DNA甲基化發(fā)生的多樣性認(rèn)識(shí),而且對(duì)理解DNA甲基化產(chǎn)生的生物學(xué)功能具有重要的參考意義。主要研究結(jié)果如下:1為了獲得蓖麻胚愈傷組織,我們首先優(yōu)化蓖麻胚愈傷組織的培養(yǎng)體系,設(shè)置不同濃度梯度的萘乙酸(1-Naphthaleneaceticacid,NAA)和噻重氮苯基脲(Thidiazuron,TDZ),蓖麻胚愈傷誘導(dǎo)結(jié)果表明當(dāng)6-芐氨基腺嗓(6-Benzylamin... 

【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

蓖麻胚與胚愈傷基因組甲基化的變化及和差異表達(dá)基因的關(guān)聯(lián)分析


圖1-1植物基因組DNA甲基化的維持[6]??Figure?1-1?Maintenance?of?plant?gnomic?DNA?methylation??1.3植物去甲基化調(diào)控機(jī)制??

機(jī)制,甲基化,去甲基化,胞嘧啶


I?I?^?I?II?I?I?I?〇H??CM?i?i?9?i?i?i?i?i?i??圖1-2植物中BER介導(dǎo)的主動(dòng)DNA去甲基化??Fig.?1-2?Base?excision?repair?(BER)-mediated?active?DNA?demethylation?in?plants.??目前認(rèn)為,被動(dòng)和主動(dòng)去甲基化途徑共同作用。首先,相比全甲基化DNA,?_??在半甲基化DNA上更活躍;其次,半甲基化DNA的富集降低不利于DSBs(double?strand??breaks)發(fā)生,推測(cè)是由DME在對(duì)稱情況下移除胞嘧啶甲基化導(dǎo)致的[26]。確實(shí),DME??雖能降低DSBs的產(chǎn)生,但在脫堿基位點(diǎn)去除甲基化的胞嘧啶的效率并不高t22]。最后,??除了有降低和DSBs工作效率風(fēng)險(xiǎn),MET1的下調(diào)或許也能導(dǎo)致DNA單鏈上由??DME活性作用所產(chǎn)生的半甲基化CG位點(diǎn)不能有效地被修復(fù)成全甲基化,而這可通過??4??

轉(zhuǎn)錄組,分析流程


果和分析??組織的獲得??驗(yàn)選6-BA為細(xì)胞分裂素,設(shè)置0.1?mg/L-0.5?mg/L多濃度梯度的NAA和的胚愈傷組織的誘導(dǎo)情況。在誘導(dǎo)過程中,在同種條件下,NAA誘導(dǎo)-D。因此本試驗(yàn)中選。危粒磷鳛橛鷤M織形成誘導(dǎo)形成的最佳生長(zhǎng)素,升,愈傷組織誘導(dǎo)率呈現(xiàn)出先升后降規(guī)律。當(dāng)6-BA2mg/L和NAA0.3?mg/傷長(zhǎng)勢(shì)最佳(表3-1)。在最佳激素配比下,愈傷組織大量產(chǎn)生,愈傷率17??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]DNA甲基化在動(dòng)植物遺傳育種中的研究進(jìn)展[J]. 徐青,余云舟,趙萌,孫東曉.  生物技術(shù)通訊. 2011(01)
[4]沙棘苗木繁殖技術(shù)研究綜述與展望[J]. 劉麗穎.  國(guó)際沙棘研究與開發(fā). 2006(02)

博士論文
[1]丹參全基因組DNA甲基化譜及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶與去甲基化酶基因的系統(tǒng)分析[D]. 李江.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[2]蓖麻胚乳表觀調(diào)控與基因組印跡研究[D]. 徐偉.云南大學(xué) 2016

碩士論文
[1]玉米體細(xì)胞胚胎發(fā)生的轉(zhuǎn)錄組分析及相關(guān)基因克隆[D]. 丁美琪.吉林大學(xué) 2017



本文編號(hào):3403724

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